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- Emil Heinricher (1931): Untersuchungen über die Nachkommenschaft der Primula Kewensis und ihre Vielgestaltigkeit (mit 14 Textfiguren und 6 Tafeln). – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 102: 69 - 112.
- Emil Heinricher (1928): Die Sexualitätsverhältnisse und die Rassen der Kaiserkrone (Fritillaria imperialis L.) – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 137: 747 - 758.
- Emil Heinricher (1925): Viehweide, ein am Formwechsel und an der Artbildung bei Pflanzen mitwirkender Faktor – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 134: 7 - 20.
- Emil Heinricher (1925): Ist Für die Anlage der Haustorien der Santalaceen chemische Reizung oder Kontakt wirksam? – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 135: 43 - 50.
- Emil Heinricher (1924): Das Absorptionssystem der Wacholdermistel (Arceuthobium oxycedri [DC.] mB.) mit besonderer Berücksichtigung seiner Entwicklung und Leistung – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 132: 143 - 194.
- Emil Heinricher (1924): Die Schlafbewegungen der Blütenkörbchen von Dimorphotheca pluvialis (L.) Mnch. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 133: 87 - 135.
- Emil Heinricher (1923): Einiges zur Kenntnis der Blüten von Dimorphotheca pluvialis (L.) Mnch. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 41: 59 - 67.
- Emil Heinricher (1922): Über die Blüten und die Bestäubung bei Viscum cruciatum Sieb. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 40: 168 - 173.
- Emil Heinricher (1922): Kreuzungsversuche zwischen Viscum album L. und Viscum cruciatum Sieb. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 40: 174 - 177.
- Emil Heinricher (1921): Mistelträger im Botanischen Garten zu Innsbruck. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 39: 291 - 295.
- Emil Heinricher (1921): Das Absorptionssystem von Arceuthobium oxycedri (D. C.) M. Bieb. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 39: 1020 - 1025.
- Emil Heinricher (1920): Arceuthobium Oxycedri (D. C.) M. Bieb auf Cupressus. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 38: 220 - 223.
- Emil Heinricher (1920): Wie erfolgt die Bestäubung der Mistel; scheiden ihre Blüten wirklich Nektar ab? – Biologisches Zentralblatt – 40: 514 - 527.
- Emil Heinricher (1920): Ist die Mistel (Viscum album L.) wirklich nur Isektenblütler? – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 113: 155 - 167.
- Emil Heinricher (1919): Ein Versuch Samen, allenfalls Pflanzen, aus der Kreuzung einer Laubholzmistel mit der Tannenmistel zu gewinnen. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 37: 392 - 398.
- Emil Heinricher (1917): Warum die Samen anderer Pflanzen auf Mistelschleim nicht oder nur schlecht keimen – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 126: 839 - 892.
- Emil Heinricher (1917): Über tötende Wirkung des Mistelschleims auf das Zellgewebe von blättern und Sprossen – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 126: 815 - 836.
- Emil Heinricher (1917): Kampf zwischen Mistel und Birnbaum. Immune, unecht immune und nicht immune Birnrassen; Immunwerden für das Mistelgift früher sehr empfindlicher Bäume nach dem Überstehen einer ersten Infektion (mit 4 Tafeln). – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 93: 501 - 534.
- Emil Heinricher (1917): Die Krümmungsbewegungen des Hypokotyls von Viscum album, ihre zeitliche Folge, insbesonders der Nachweis seiner negativ geotropischen Reaktion. Beziehungen zwischen Lichtgenuß und Keimung, sowie Erhaltung des Keimvermögens der Mistelsamen. – Jahrbücher für wissenschaftliche Botanik – 57: 321 - 362.
- Emil Heinricher (1917): Berichtigende Mitteilung über die Keimungsbedingungen der Samen von Arceuthobium Oxycedri (DC.) M. Bieb. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 35: 204 - 212.
- Emil Heinricher (1917): Die erste Aufzucht einer Rafflesiacee, Cytinus Hypocistis L, aus Samen. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 35: 505 - 512.
- Emil Heinricher (1917): Zur Kenntnis der Blüte von Cytinus Hypocistis L. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 35: 513 - 517.
- Emil Heinricher (1917): Rückgang der Panaschierung und ihr völliges Erlöschen als Folge verminderten Lichtgenusses; nach Beobachtungen und Versuchen mit Tradescantia Fluminensis Veil. var. albo striata – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 109: 40 - 54.
- Emil Heinricher (1916): Über den Mangel einer durch innere Bedingungen bewirkten Ruheperiode bei den Samen der Mistel (Viscum album L.) – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 125: 163 - 188.
- Emil Heinricher (1916): Über die geotropischen Reaktionen unserer Mistel. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 34: 818 - 829.
- Emil Heinricher (1916): Aufzucht der Zwergmistel (Arceuthobium Oxycedri (DC.) MB. im Freilande des Innsbrucker Botanischen Gartens. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 34: 673 - 676.
- Emil Heinricher (1915): Beiträge zur Biologie der Zwergmistel Arceuthobium Oxycedri, besonders zur Kenntnis des anatomischen Baues und der Mechanik ihrer explosiven Beeren – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 124: 181 - 230.
- Emil Heinricher (1915): Über Bau und Biologie der Blüten von Arceuthobium Oxycedri (DC.) MB. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 124: 481 - 504.
- Emil Heinricher (1915): Die Keimung und Entwicklungsgeschichte der Wacholdermistel, Arceuthobium Oxycedri, auf Grund durchgeführter Kulturen geschildert – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 124: 319 - 352.
- Zur Frage nach der assimilatorischen Leistungsfähigkeit der Hexenbesen des Kirschbaumes.Emil Heinricher (1915): Zur Frage nach der assimilatorischen Leistungsfähigkeit der Hexenbesen des Kirschbaumes. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 33: 245 - 253.
- Emil Heinricher (1914): untersuchungen über Lilium bulbiferum L., Lilium croceum Chaix und den gezüchteten Bastard Lilium sp. weibl. x Lilium corceium Chaix männl. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 123: 1195 - 1220.
- Emil Heinricher (1913): Bei der Kultur von Misteln beobachtete Korrelationserscheinungen und die das Wachstum der Mistel begleitenden Krümmüngsbewegungen – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 122: 1259 - 1280.
- Einige Bemerkungen zur Rhinantheen-Gattung Striga.Emil Heinricher (1913): Einige Bemerkungen zur Rhinantheen-Gattung Striga. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 31: 238 - 242.
- Emil Heinricher (1912): Über Versuche, die Mistel (Viscum album L.) auf monocotylen und auf sukkulenten Gewächshauspflanzen zu ziehen – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 121: 541 - 572.
- Emil Heinricher (1912): Samenreife und Samenruhe der Mistel (Viscum album L.) und die Umstände, welche die Keimung beeinflussen – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 121: 573 - 613.
- Emil Heinricher (1911): Zur Frage nach den Unterschieden zwischen Lilium bulbiferum L und Lilium croceum Chaix. B. Über die Geschlechtsverhältnisse des letzteren auf Grund mehrjähriger Kulturen – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 103: 54 - 73.
- Emil Heinricher, Ernst Elsler (1910): Pachyma Cocos Fr. – Veröffentlichungen des Tiroler Landesmuseums Ferdinandeum – 3_54: 339 - 349.
- Emil Heinricher (1908): Ph. Van Tieghem's Anschauungen über den Bau der Balanophora-Knolle – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 117: 337 - 346.
- Emil Heinricher (1908): ): Potentilla aurea L. mit zygomorphen oder auch assymetrischen Blüten und Vererbbarkeit dieser Eigentümlichkeit. – Veröffentlichungen des Tiroler Landesmuseums Ferdinandeum – 3_52: 281 - 286.
- Emil Heinricher (1908): Uber Androdiöcie und Andromonöcie bei Lilium croceum Chaix und die systematischen Merkmale dieser Art – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 98: 362 - 378.
- Emil Heinricher (1908): Eine erbliche Farbenvarietät des Ligustrum vulgare L. – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 98: 379.
- Emil Heinricher (1908): Die Samenkeimung und das Licht. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 26a: 298 - 301.
- Emil Heinricher (1907): Beiträge zur Kenntnis der Gattung Balanophora – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 116: 439 - 465.
- Emil Heinricher (1907): Zur Kenntnis der Farngattung Nephrolepis. – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 97: 43 - 75.
- Emil Heinricher (1906): Beiträge zur Kenntniss der Rafflesiaceae. I. (Mit 3 Tafeln und 2 Textfiguren). – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 78: 57 - 81.
- Emil Heinricher (1904): Melampyrum pratense L, ein in gewissen Grenzen spezialisierter Parasit. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 22: 411 - 414.
- Emil Heinricher (1903): Nachtrag zu der Abhandlung "Zur Kenntnis von Drosera" (mit 5 Textabbildungen). – Veröffentlichungen des Tiroler Landesmuseums Ferdinandeum – 3_47: 300 - 307.
- Emil Heinricher (1903): Kritisches zur Systematik der Gattung Alectorolophus – Jahrbücher für wissenschaftliche Botanik – 38: 667 - 688.
- Emil Heinricher (1902): Zur Kenntnis von Drosera (mit 2 Tafeln). – Veröffentlichungen des Tiroler Landesmuseums Ferdinandeum – 3_46: 1 - 29.
- Emil Heinricher (1902): Entgegnung auf die Besprechung meiner Arbeit: "Die grünen Halbschmarotzer. IV. Nachträge zu Euphrasia, Odontites und Alectorolophus. Kritische Bemerkungen zur Systematik letzterer Gattung " 1) durch Herrn Prof. v. Wettstein in Jahrg. 1902, Nr. 5, p. 195 dieser Zeitschrift. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 052: 246 - 247.
- Emil Heinricher (1902): Notiz zur Frage nach der Bacterienfäule der Kartoffeln. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 20: 156 - 158.
- Emil Heinricher (1901): Unsere einheimischen Polygala-Arten sind keine Parasiten. – Berichte des naturwissenschaftlichen-medizinischen Verein Innsbruck – 26: 109 - 121.
- Emil Heinricher (1901): Notiz über das Vorkommen eines Brandpilzes aus der Gattung Entyloma auf Tozzia alpina L. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 19: 362 - 366.
- Emil Heinricher (1900): Nachträge zu meiner Studie über die Regenerationsfähigkeit der Cystopteris-Arten – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 18: 109 - 121.
- Emil Heinricher (1899): Die Lathraea-Arten Japans. Eine Bitte an die Botaniker Japans – Botanisches Centralblatt – 77: 10 - 12.
- Emil Heinricher (1899): Original-Referate aus botan. Gärten und Instituten. Aus dem botanischen Institut zu lnnsbruck. – Botanisches Centralblatt – 77: 302 - 308.
- Emil Heinricher (1899): Zur Entwickelungsgeschichte einiger grüner Halbschmarotzer – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 17: 1244 - 1247.
- Emil Heinricher (1899): Ein Fall beschleunigender Wirkung des Lichtes auf die Samenkeimung – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 17: 308 - 311.
- Emil Heinricher (1898): Erwiderung – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 048: 233 - 237.
- Emil Heinricher (1898): Original-Referate aus botan. Gärten und Instituten.*) Aus dem botanischen Institut zu Innsbruck. – Botanisches Centralblatt – 73: 108 - 113.
- Emil Heinricher (1898): Notiz über die Keimung von Lathraea Squamaria L. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 16: 2 - 5.
- Emil Heinricher (1896): Ueber die Widerstandsfähigkeit der Adventivknospen von Cystopteris bulbifera (L.) Bernhardi gegen das Austrocknen. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 14: 234 - 244.
- Emil Heinricher (1896): Ueber pflanzenbiologische Gruppen. – Botanisches Centralblatt – 66: 273 - 284.
- Emil Heinricher (1896): Iris pallida Lam., abavia, das Ergebnis einer auf Grund atavistischer Merkmale vorgenommen Züchtung und ihre Geschichte. – Biologisches Zentralblatt – 16: 13 - 24.
- Emil Heinricher (1895): Zur Frage über die Entwickelungs-Geschichte der Adventivknospen bei Farnen. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 13: 112 - 114.
- Emil Heinricher (1895): Entgegnung auf die Erklärung des Herrn Rostowzew. – Botanisches Centralblatt – 62: 346 - 347.
- Emil Heinricher (1895): Anatomischer Bau und Leistung der Saugorgane der Schuppenwurz-Arten – Beiträge zur Biologie der Pflanzen – 7_2: 315 - 406.
- Emil Heinricher (1894): Neue Beiträge zur Pflanzenteratologie und Blüthenmorphologie. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 044: 41 - 45.
- Emil Heinricher (1894): Neue Beiträge zur Pflanzenteratologie und Blüthenmorphologie. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 044: 87 - 91.
- Emil Heinricher (1894): Neue Beiträge zur Pflanzenteratologie und und Blüthenmorphologie. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 044: 165 - 167.
- Emil Heinricher (1894): Die Keimung von Lathraea. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 12: 1117 - 1132.
- Emil Heinricher (1894): Wahrung der Priorität. Zur Frage über die Entwickelungsgeschichte der Adventivknospen bei Farnen. – Botanisches Centralblatt – 60: 334 - 336.
- Emil Heinricher (1893): Biologische Studien an der Gattung Lathraea. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 11: 1 - 18.
- Emil Heinricher (1892): Biologische Studien an der Gattung Lathraea. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 101: 423 - 477.
- Emil Heinricher (1891): Neue Beiträge zur Pflanzen-Teratologie und Blüthen-Morphologie. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 041: 41 - 45.
- Emil Heinricher (1891): Ueber massenhaftes Auftreten von Krystalloiden in Laubtrieben der Kartoffelpflanze – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 9: 287 - 291.
- Emil Heinricher (1891): Nochmals über die Schlauchzellen der Fumariaceen. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 9: 184 - 187.
- Emil Heinricher (1890): Über einen eigenthümlichen Fall von Umgestaltung einer Oberhaut und dessen biologische Deutung. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 99: 25 - 39.
- Emil Heinricher (1890): Neue Beiträge zur Pflanzen-Teratologie und Blüthen-Morphologie. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 040: 328 - 332.
- Bericht der III. Section für Botanik. (Seiten LXXII-LXXV)Emil Heinricher (1889): Bericht der III. Section für Botanik. (Seiten LXXII-LXXV) – Mitteilungen des naturwissenschaftlichen Vereins für Steiermark – 25.
- Die botanische Literatur der Steiermark im Jahre 1888. (Seiten LXXXVII-LXXXVIII)Emil Heinricher (1889): Die botanische Literatur der Steiermark im Jahre 1888. (Seiten LXXXVII-LXXXVIII) – Mitteilungen des naturwissenschaftlichen Vereins für Steiermark – 25.
- Asphodelus albus Miller in Steiermark. (Seiten CII-CV)Emil Heinricher (1889): Asphodelus albus Miller in Steiermark. (Seiten CII-CV) – Mitteilungen des naturwissenschaftlichen Vereins für Steiermark – 25: CII-CV.
- Emil Heinricher (1889): Hubert Leitgeb, sein Leben und Streben. – Mitteilungen des naturwissenschaftlichen Vereins für Steiermark – 25: 159 - 181.
- Emil Heinricher (1889): Anhang: Verzeichnis Schriften Peyritsch's – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 7: 1019 - 1020.
- Emil Heinricher (1889): Nachruf auf Johann Peyritsch – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 7: 1012 - 1018.
- Emil Heinricher (1888): Die botanische Literatur der Steiermark im Jahre 1886 u. 1887. (Seiten LXXVIV-LXXVI) – Mitteilungen des naturwissenschaftlichen Vereins für Steiermark – 24: LXXVIV-LXXVI.
- Emil Heinricher (1888): Zur Biologie der Gattung Impatiens – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 71: 163 - 175.
- Emil Heinricher (1888): Zur Biologie der Gattung Impatiens – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 71: 179 - 185.
- Emil Heinricher (1887): Histologische Differenzierung der pflanzlichen Oberhaut. – Mitteilungen des naturwissenschaftlichen Vereins für Steiermark – 23: 25 - 46.
- Emil Heinricher (1887): Vorläufige Mittheilung über die Schlauchzellen der Fumariaceen. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 5: 233 - 239.
- Emil Heinricher (1886): Die Eiweissschläuche der Cruciferen und verwandte Elemente in der Rhoeadinen-Reihe – Mittheilungen aus dem Botanischen Institute zu Graz – 1: 1 - 92.
- Emil Heinricher (1886): Vorwort – Mittheilungen aus dem Botanischen Institute zu Graz – 1: V-VI.
- Emil Heinricher (1886): Beeinflusst das Licht die Organanlage am Farnembryo? – Mittheilungen aus dem Botanischen Institute zu Graz – 1: 237 - 253.
- Emil Heinricher (1885): Wissenschaftliche Original-Mittheiiungen. Ueber einige im Laube dikotyler Pflanzen trockenen Standortes auftretende Einrichtungen, welche muthmaasslich eine ausreichende Wasserversorgung des Blattmesophylls bezwecken – Botanisches Centralblatt – 23: 56 - 61.
- Emil Heinricher (1885): Wissenschaftliche Original-Mittheilungen. Ueber einige im Laube dikotyler Pflanzen trockenen Standortes auftretende Einrichtungen, welche muthmaasslich eine ausreichende Wasserversorgung des Blattmesophylls bezwecken. – Botanisches Centralblatt – 23: 21 - 25.
- Emil Heinricher (1885): Ein reducirtes Organ bei Campanula persicifolia und einigen anderen Campanula Arten – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 3: 4 - 13.
- Emil Heinricher (1884): Ueber Eiweissstoffe führende Idioblasten bei einigen Cruciferen – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 2: 463 - 466.
- Emil Heinricher (1883): Beiträge zur Pflanzenteratologie und Blüthenmorphologie. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 87: 95 - 133.
- Emil Heinricher (1883): Beiträge zur Pflanzenteratologie und Blüthenmorphologie. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 87: 95 - 133.
- Emil Heinricher (1883): Zur Kenntniss der Algengattung Sphaeroplea. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 1: 433 - 450.