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- Ulrike Pröbstl-Haider, Ulrich Ammer, Christina Pröbstl (2018): Aufbau eines Ökokontos für einen land- und forstwirtschaftlichen Betrieb in Oberbayern – Anliegen Natur – 40_1_2018: 49 - 56.
- Ulrich Ammer (2003): Erfassung und Beurteilung von Seen und deren Einzugsgebieten mit Methoden der Fernerkundung – Laufener Spezialbeiträge und Laufener Seminarbeiträge (LSB) – 2_2003: 7 - 10.
- Claudius Mott, Thorsten Andresen, Caroline Rogg, Thomas Schneider, Ulrich Ammer (2003): AQUATIC: Identifizierung und Monitoring von Landnutzungs-/Landoberflächen-Typen in einem multitemporalen/multisensoralen Ansatz – Laufener Spezialbeiträge und Laufener Seminarbeiträge (LSB) – 2_2003: 55 - 65.
- Kerstin Engel, Ulrich Ammer (2000-2007): Vergleich verschiedener Fanglösungen – Faunistisch-Ökologische Mitteilungen – 8: 297 - 301.
- Ulrich Ammer (1998): Historische Entwicklung des Naturschutzes in Deutschland und sein Bezug zum Wald und zum Forstwesen – Berichte der Bayerischen Akademie für Naturschutz und Landschaftspflege (ANL) – 22: 59 - 64.
- Ulrike Pröbstl, Ulrich Ammer, Siegfried Karpf (1998): Wege zu einer verbesserten Begrünung von Schadstellen im Hochgebirge – Jahrbuch des Vereins zum Schutz der Bergwelt – 63_1998: 229 - 249.
- Ulrich Ammer (1996): Grußwort – Berichte der Bayerischen Akademie für Naturschutz und Landschaftspflege (ANL) – 20: 11 - 12.
- Ulrich Ammer (1995): Leitbildorientierte Aufforstung und naturnahe Waldpflege oder Plantagenwald, Kahlschlagswirtschaft und Totalreservate? – Laufener Spezialbeiträge und Laufener Seminarbeiträge (LSB) – 4_1995: 131 - 140.
- Ulrich Ammer, Günther Weber, Jürgen Zander, Hans Utschik (1991): Stufenweise Wiedervernässung einer voralpinen abgetorften Hochmoorparzelle – Verhandlungen der Gesellschaft für Ökologie – 20_1_1991: 265 - 273.
- Ulrich Ammer, Hans Utschick (1990): Zur Erfassung und Bewertung von Kleinstrukturen im Wald – Laufener Spezialbeiträge und Laufener Seminarbeiträge (LSB) – 3_1990: 14 - 15.
- Ulrich Ammer, Ahmed Manghabati (1988): Auswirkungen des Tourismus auf den Bergwald – Jahrbuch des Vereins zum Schutz der Bergwelt – 53_1988: 107 - 114.
- Ludwig Albrecht, Ulrich Ammer, Wolfgang Geissner, Hans Utschick (1986): Tagfalterschutz im Wald – Berichte der Bayerischen Akademie für Naturschutz und Landschaftspflege (ANL) – 10_1986: 171 - 183.
- Ulrich Ammer (1982): Forstwirtschaft unter Beachtung ökologischer und sonstiger natur- und landschaftsbedingter Erfordernisse - einschließlich Forstwirtschaftswegebau – Laufener Spezialbeiträge und Laufener Seminarbeiträge (LSB) – 8_1982: 17 - 19.
- VorwortUlrich Ammer (1982): Vorwort – Nationalpark Bayerischer Wald - Wissenschaftliche Reihe – 8: 2.
- Sammeln und Langlaufen im Nationalpark Bayerischer WaldUlrich Ammer, A. Pledl, Hermine Riederer, K. Thiele (1982): Sammeln und Langlaufen im Nationalpark Bayerischer Wald – Nationalpark Bayerischer Wald - Wissenschaftliche Reihe – 8: 3 - 4.
- Das Sammeln im Nationalpark Bayerischer WaldUlrich Ammer, Hermine Riederer, K. Thiele (1982): Das Sammeln im Nationalpark Bayerischer Wald – Nationalpark Bayerischer Wald - Wissenschaftliche Reihe – 8: 5 - 65.
- Ulrich Ammer, Ulrich Sauter (1981): Überlegungen zur Erfassung der Schutzwürdigkeit Auebiotopen im Voralpenraum – Berichte der Bayerischen Akademie für Naturschutz und Landschaftspflege (ANL) – 5_1981: 99 - 137.