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- Emil Wepfer (1922): 1. Terrestrische Einflüsse bei der marinen Sedimentation und ihre Bedeutung. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 74: 39 - 47.
- Emil Wepfer (1920): 9. „Streifenbüschel" bei Ammoniten – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 72: 339 - 348.
- Emil Wepfer (1916): Ein wichtiger Grund für die Lückenhaftigkeit paläontologischer Überlieferung. – Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1916: 105 - 113.
- Emil Wepfer (1915): Beiträge zur Geologie des Sabinergebirges. – Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1915: 17 - 23.
- Emil Wepfer (1915): Beiträge zur Geologie des Sabinergebirges. – Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1915: 82 - 93.
- Emil Wepfer (1913): Ueber das Vorkommen von „Cyprina islandica" im Postpliocän von Palermo. – Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1913: 173 - 177.
- Emil Wepfer (1913): Die Gattung Oppelia im süddeutschen Jura. – Palaeontographica - Beiträge zur Naturgeschichte der Vorzeit – 59: 1 - 67.
- Emil Wepfer (1912): Zur Lagerung des Flysch im vorderen Bregenzer Wald. An Herrn O. Ampferer. – Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1912: 378 - 380.
- Emil Wepfer (1910): Ueber Schwammgesteine aus den jüngeren Bohnerztonen des südlichen Baden. – Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1910: 10 - 17.