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Anton Carl Weithofer (1917): Die Oligozänablagerungen Oberbayerns. – Austrian Journal of Earth Sciences – 10: 1 - 125.- Anton Carl Weithofer (1915): Die Entwicklung der Anschauungen über Stratigraphie u. Tektonik im oberbayr. Molassegebiet – Geologische Rundschau - Zeitschrift für allgemeine Geologie – 5: 65 - 77.
Anton Carl Weithofer (1914): Über Gebirgsspannungen und Gebirgsschläge. – Jahrbuch der Geologischen Bundesanstalt – 064: 99 - 142.
Anton Carl Weithofer (1912): Über neuere Aufschlüsse in den jüngeren Molasseschichten Oberbayerns – Verhandlungen der Geologischen Bundesanstalt – 1912: 347 - 356.
Anton Carl Weithofer (1904): Ludwig Hertle – Verhandlungen der Geologischen Bundesanstalt – 1904: 289 - 290.
Anton Carl Weithofer (1902): Einige Querprofile durch die Molassebildungen Oberbayerns. – Jahrbuch der Geologischen Bundesanstalt – 052: 39 - 70.
Anton Carl Weithofer (1902): Geologische Skizze des Kladno - Rakonitzer Kohlenbeckens – Verhandlungen der Geologischen Bundesanstalt – 1902: 399 - 420.
Anton Carl Weithofer (1901): Geologische Beobachtungen im Kladno - Schlaner Steinkohlenbecken – Verhandlungen der Geologischen Bundesanstalt – 1901: 336 - 338.
Anton Carl Weithofer (1899): Zur Kenntnis der oberen Horizonte der oligocänen Brackwassermolasse Oberbayerns und deren Beziehungen zur miocänen (oberen) Meeresmolasse im Gebiete zwischen Inn und Lech – Verhandlungen der Geologischen Bundesanstalt – 1899: 269 - 282.
Anton Carl Weithofer (1898): Zur Frage der gegenseitigen Altersverhältnisse der mittel- und nordböhmischen Carbon- und Permablagerungen – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 107: 53 - 73.
Anton Carl Weithofer (1897): Der Schatzlar-Schwadowitzer Muldenflügel des niederschlesisch- böhmischen Steinkohlenbeckens. – Jahrbuch der Geologischen Bundesanstalt – 047: 455 - 478.
Anton Carl Weithofer (1897): Zur stratigraphischen Gliederung der mittelböhmischen Steinkohlenablagerungen – Verhandlungen der Geologischen Bundesanstalt – 1897: 317 - 320.
Anton Carl Weithofer (1891): DIE FOSSILEN PROBOSCIDIER DES ARNOTHALES IN TOSKANA. – Beiträge zur Paläontologie von Österreich = Mitteilungen des Geologischen und Paläontologischen Institutes der Universität Wien – 008: 107 - 240.
Alfred Rodler, Anton Carl Weithofer (1890): Die Wiederkäuer der Fauna von Maragha. (Mit 6 Tafeln.) – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 57: 753 - 772.
Anton Carl Weithofer (1890): Ueber Tithon und Neocom der Krim – Verhandlungen der Geologischen Bundesanstalt – 1890: 195 - 199.
Anton Carl Weithofer (1889): Die fossilen Hyänen des Arnothales. (Mit 4 Tafeln.) – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 55_2: 337 - 360.
Anton Carl Weithofer (1889): Ueber die tertiären Landsäugethiere Italiens. – Jahrbuch der Geologischen Bundesanstalt – 039: 55 - 82.
Anton Carl Weithofer (1889): Tapir und Nautilus aus oberösterreichischen Tertiärablagerungen – Verhandlungen der Geologischen Bundesanstalt – 1889: 179 - 180.
Anton Carl Weithofer (1889): Über Jura und Kreide aus dem nordwestlichen Persien – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 98: 756 - 773.
Anton Carl Weithofer (1888): Zur Kenntniss der fossilen Cheiropteren der französischen Phosphorite. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 96: 341 - 360.
Anton Carl Weithofer (1888): BEITRÄGE ZUR KENNTNISS DER FAUNA VON PIKERMI BEI ATHEN. – Beiträge zur Paläontologie von Österreich = Mitteilungen des Geologischen und Paläontologischen Institutes der Universität Wien – 006: 225 - 292.
Anton Carl Weithofer (1888): Ueber einen neuen Dicynodonten (Dicynodon simocephalus) aus der Karrooformation Südafrikas (Tafel I.) – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 3: 1 - 6.
Anton Carl Weithofer (1888): Ueber ein Vorkommen von Eselsresten in der Höhle "Pytina jama" bei Gabrowitza nächst Prosecco im Küstenlande (Tafel II.) – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 3: 7 - 14.
Anton Carl Weithofer (1887): Bemerkungen über eine fossile Scalpellumart aus dem Schlier von Ottnang und Kremsmünster, sowie über Cirripedien im Allgemeinen. – Jahrbuch der Geologischen Bundesanstalt – 037: 371 - 385.
