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- Otto Fuhrmann (1915): Eigentümliche Fischcestoden. – Zoologischer Anzeiger – 46: 385 - 398.
- Otto Fuhrmann (1914): Ein neuer getrenntgeschlechtiger Cestode. – Zoologischer Anzeiger – 44: 611 - 620.
- Otto Fuhrmann (1914): Über eine neue Peripatus=Art vom Oberlauf des Amazonas. – Abhandlungen der Senckenbergischen Naturforschenden Gesellschaft – 36_1914: 276 - 281.
- Otto Fuhrmann (1913): Über einige neue neotropische Peripatus-Arten. – Zoologischer Anzeiger – 42: 241 - 248.
- Otto Fuhrmann (1913): Die Atmungsorgane von Thyphlonectes. – Zoologischer Anzeiger – 42: 229 - 234.
- Voyage d'exploration scientifique en ColombieOtto Fuhrmann, E. Mayor (1913): Voyage d'exploration scientifique en Colombie – Mémoires de la Société neuchâteloise des Sciences naturelles – 5: 255 - 269.
- Otto Fuhrmann (1912): Ergebnisse der mit Subvention aus der Erbschaft Treitl unternommenen zoologischen Forschungsreise Dr. Franz Werner's nach dem ägyptischen Sudan und Nord-Uganda. XXI. Vogelcestoden – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 121: 181 - 192.
- Otto Fuhrmann (1911-1913): Vogelcestoden der Aru-Inseln. – Abhandlungen der Senckenbergischen Naturforschenden Gesellschaft – 34_1911-1913: 249 - 266.
- Otto Fuhrmann (1908): XIV i. Trematodes, Cestodes, Nemathelminthes (Nematodes, Mermis und Gordius), Acanthocephales und Nematoides für 1907. – Archiv für Naturgeschichte – 74-2_3: 1 - 42.
- Otto Fuhrmann (1907): Die Systematik der Ordnung der Cyclophyllidea. – Zoologischer Anzeiger – 32: 289 - 297.
- Otto Fuhrmann (1905): Über ost-asiatische Vogel-Cestoden. (Reise von Dr. Walter Volz.) – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 22: 303 - 320.
- Otto Fuhrmann (1904): Ein getrenntgeschlechtiger Cestode. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 20: 131 - 150.
- Otto Fuhrmann (1903): Neue Anoplocephaliden der Vögel. – Zoologischer Anzeiger – 27: 384 - 388.
- Otto Fuhrmann (1903): Ein neuer Verteter eines marinen Turbellariengenus im Süßwasser. – Zoologischer Anzeiger – 27: 381 - 384.
- Otto Fuhrmann (1903): Zur Synonymie von Macrorhynohus bivittatus (Ulianin). – Zoologischer Anzeiger – 27: 298.
- Otto Fuhrmann (1901): Sur deux nouveaux genres de Cestodes d'oiseaux. – Zoologischer Anzeiger – 25: 357 - 360.
- Otto Fuhrmann (1901): Gyrator reticulatus Sekera. – Zoologischer Anzeiger – 24: 177 - 178.
- Otto Fuhrmann (1901): Neue Arten und Genera von Vogeltaenien. – Zoologischer Anzeiger – 24: 271 - 273.
- Otto Fuhrmann (1900): Neue eigentümliche Vogeltaenien. – Zoologischer Anzeiger – 23: 48 - 51.
- Otto Fuhrmann (1900): Beitrag zur Biologie des Neuenburger Sees. – Biologisches Zentralblatt – 20: 85 - 96.
- Otto Fuhrmann (1900): Beitrag zur Biologie des Neuenburger Sees. – Biologisches Zentralblatt – 20: 121 - 128.
- Otto Fuhrmann (1900): Yves Delage, Sur la fécondation mérogonique et ses résultats – Biologisches Zentralblatt – 20: 424 - 425.
- Le plankton du Lac de NeuchatelOtto Fuhrmann (1900): Le plankton du Lac de Neuchatel – Bulletin de la Societe Neuchateloise des Sciences Naturelles Frueher: Bulletin de la Societe des Sciences Naturelles de Neuchatel. – 28: 86 - 99.
- Otto Fuhrmann (1899): Das Genus Prosthecocotyle. – Zoologischer Anzeiger – 22: 180 - 183.
- Otto Fuhrmann (1899): Zur Kritik der Planktontechnik. – Biologisches Zentralblatt – 19: 584 - 590.
- Otto Fuhrmann (1898): Ist Bothriocephalus Zschokkei mihi synonym mit Schistocephalus nodosus^ Rud.? – Zoologischer Anzeiger – 21: 143 - 145.
- Otto Fuhrmann (1898): Neue Turbellarien der Bucht von Concarneau (Finistère). – Zoologischer Anzeiger – 21: 252 - 256.
- Otto Fuhrmann (1898): Über die Genera Prosthecocotyle Monticelli und Bothridiotaenia Lönnberg. – Zoologischer Anzeiger – 21: 385 - 388.
- Otto Fuhrmann (1895): 1. Die Taenien der Amphibien – Zoologischer Anzeiger – 18: 181 - 184.
- Otto Fuhrmann (1894): 11. Über die Turbellarienfauna der Umgebung von Basel – Zoologischer Anzeiger – 17: 133 - 135.