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- Die Frühlingsankunft der Zugvögel bei Lübeck und ihre Beziehung zur Witterung und anderen…Werner Hagen (1962): Die Frühlingsankunft der Zugvögel bei Lübeck und ihre Beziehung zur Witterung und anderen äußeren Faktoren – Schriften des Naturwissenschaftlichen Vereins für Schleswig-Holstein – 33: 37 - 82.
- Werner Hagen (1935-36): Zur Ornithologie Oberschleswigholsteins. – Schriften des Naturwissenschaftlichen Vereins für Schleswig-Holstein – 21: 68 - 83.
- Die Eismöwe (Larus glaucus Br. ) in Schleswig-HolsteinWerner Hagen (1935): Die Eismöwe (Larus glaucus Br.) in Schleswig-Holstein – Ornithologischer Anzeiger – 2_9: 360 - 362.
- Werner Hagen (1933-34): Die Großtrappe (Otis tarda L.) in der Nordmark. – Schriften des Naturwissenschaftlichen Vereins für Schleswig-Holstein – 20: 75 - 80.
- Werner Hagen (1933): Der Frühlingszug 1932 bei Lübeck und die Wetterlage – Der Vogelzug - Berichte über Vogelzugsforschung und Vogelberingung – 4_1933: 49 - 55.
- G. J. van Oordt, Werner Hagen, Helmut Bogdanowicz, Ivar Hortling, Rudolf Berndt, Rudolf Drost, Ernst Schüz (1933): Kurze Mitteilungen – Der Vogelzug - Berichte über Vogelzugsforschung und Vogelberingung – 4_1933: 80 - 86.
- Werner Hagen (1932): Früher Kiebitzzug im Ostseegebiet – Ornithologischer Anzeiger – 2_4: 156 - 157.
- Werner Hagen (1929-31): Zusätze zur „Literatur über die Tierwelt von Schleswig-Holstein 1924—1928". – Schriften des Naturwissenschaftlichen Vereins für Schleswig-Holstein – 19: 117 - 128.
- Das weißsternige Blaukehlchen (Luscinia svecica cyanecula Wolf) in der NordmarkWerner Hagen (1929): Das weißsternige Blaukehlchen (Luscinia svecica cyanecula Wolf) in der Nordmark – Journal für Ornithologie – 77_1929: 150 - 164.
- Werner Hagen (1927-28): Der Kolkrabe (Corvus c. corax L.) in der Nordmark – Schriften des Naturwissenschaftlichen Vereins für Schleswig-Holstein – 18: 49 - 61.
- Werner Hagen (1917): Ornithologische Mitteilungen. – Journal für Ornithologie – 65_1917: 181 - 189.
- Werner Hagen (1916): Ein Beitrag zur Avifauna von Hessen-Nassau. – Journal für Ornithologie – 64_1916: 120 - 136.
- Werner Hagen (1916): Zur Spatzenwanderung. – Ornithologische Monatsschrift – 41: 215 - 219.
- Werner Hagen (1913): Die Vögel des Freistaates und Fürstentums Lübeck – Monografien Vertebrata Aves – 0026: 1 - 166.
- Werner Hagen (1912): Über den Vogelzug 1911 bei Lübeck. – Journal für Ornithologie – 60_1912: 470 - 480.
- Werner Hagen (1910): Der Vogelzug bei Lübeck. – Journal für Ornithologie – 58_1910: 160 - 169.
- Werner Hagen (1909): Erithacus cyaneculus (Wolf) in Lübecks Umgebung. – Ornithologische Monatsschrift – 34: 432 - 434.
- Werner Hagen (1909): Parus Salicarius im lübeckischen Gebiet – Falco - unregelmässig im Anschluss an das Werk "BERAJAH, Zoographia infinita" erscheinende Zeitschrift – 5_1909: 53 - 55.