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- Karl Benjamin Klunzinger (1914): Erinnerungen aus meinem Leben als Naturforscher und Arzt zu Koseir am Roten Meere. – Zoologische Annalen - Zeitschrift für Geschichte der Zoologie – 6: 223 - 311.
- Karl Benjamin Klunzinger (1914): Ein Besuch beim klugen Hund Rolf nebst Parallelbeobachtungen an anderen Tieren und tierpsychologischen und sonstigen Betrachtungen. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 70: 217 - 254.
- Karl Benjamin Klunzinger, Eduard Becher, Reinhard Demoll (1914): Mitteilungen aus Museen, Instituten usw. – Zoologischer Anzeiger – 44: 382 - 384.
- Karl Benjamin Klunzinger (1910): Geschichte der Stuttgarter Tiergärten. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 66: 167 - 217.
- Karl Benjamin Klunzinger (1905): Schlusswort auf obenstehende "letzte Erwiderung" Professor Nüsslin's in dieser Zeitschrift, die Gangfisch-Blaufelchen-Frage betreffend. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 61: 307 - 309.
- Karl Benjamin Klunzinger (1906): über einige eigentümlich gefärbte und gezeichnete, besonders melanische Grasfrösche. – Bericht über die Senckenbergische naturforschende Gesellschaft – 1906: 105 - 115.
- Karl Benjamin Klunzinger (1905): Zur Krammetsvogelfangfrage. – Ornithologische Monatsschrift – 30: 161 - 164.
- Karl Benjamin Klunzinger (1904): Entgegnung auf Nüsslin's Ausführungen in der Gangfisch- Blaufelchen-Frage vom September 1903 – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 60: 335 - 343.
- Karl Benjamin Klunzinger (1904): Zur Verschleppung bzw. Einbürgerung von Lacerten. – Zoologischer Anzeiger – 28: 694.
- Karl Benjamin Klunzinger (1904): Zur Verschleppung bzw. Einbürgerung von Lacerten. – Zoologischer Anzeiger – 28: 694 - 698.
- Karl Benjamin Klunzinger (1903): Gangfisch und Blaufelchen. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 59: 255 - 266.
- Karl Benjamin Klunzinger (1903): Ueber Melanismus bei Tieren im allgemeinen und bei unseren einheimischen insbesondere. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 59: 267 - 297.
- Karl Benjamin Klunzinger (1903): Über des Hohenstaufenkaisers Friedrich II. Werk über die Vögel und die Jagd mit Falken. – Journal für Ornithologie – 51_1903: 539 - 542.
- Karl Benjamin Klunzinger (1902): Ueber das Vorkommen des Apus caneriformis Schäffer in Württemberg. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 58: 348 - 351.
- Karl Benjamin Klunzinger (1902): Geschichte des grünen Feuersees in Stuttgart. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 58: 338 - 345.
- Karl Benjamin Klunzinger (1902): Ueber den Blautopf bei Blaubeuren. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 58: 352 - 364.
- Karl Benjamin Klunzinger (1902): Ueber die physikalischen, chemischen und biologischen Ursachen der Farbe unserer Gewässer: Nachtragt – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 58: 365 - 370.
- Karl Benjamin Klunzinger (1902): Ueber parasitische Fliegenmaden an einer Kröte. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 58: 371 - 379.
- Karl Benjamin Klunzinger (1902): Bericht über die sechsundfünfzigste Hauptversammlung am 23. Juni 1901 in Rottweil. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 58: VII-LVII.
- Karl Benjamin Klunzinger (1901): Ueber die physikalischen, chemischen und biologischen Ursachen der Farbe unserer Gewässer – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 57: 321 - 346.
- Karl Benjamin Klunzinger (1900): Ueber Zwergrassen bei Fischen und bei Felchen insbesondere. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 56: 519 - 532.
- Karl Benjamin Klunzinger (1899): Theodor Eimer. Ein Lebensabriss mit Darstellung der Eimer'schen Lehren nach ihrer Entwickelung. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 55: 1 - 22.
- Karl Benjamin Klunzinger (1885): Über Bach- und Seeforellen. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 41: 266 - 288.
- Karl Benjamin Klunzinger (1884): Ueber die Felchenarten des Bodensees. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 40: 105 - 128.
- Karl Benjamin Klunzinger (1882): Ueber die Astacus-Arten in Mittel- und Südeuropa und den Lereboullet'schen Dohlenkrebs insbesondere. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 38: 326 - 342.
- Karl Benjamin Klunzinger (1881): Die Fische in Württemberg, faunistisch-biologisch betrachtet, und die Fischereiverhältnisse daselbst. – Jahreshefte des Vereins für vaterländische Naturkunde in Württemberg – 37: 172 - 304.
- Karl Benjamin Klunzinger (1880): Die v. Müller'sche Sammlung australischer Fisch ein Stuttgart. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 80: 325 - 430.
- Karl Benjamin Klunzinger (1872): Zur Fischfauna von Süd-Australien. – Archiv für Naturgeschichte – 38-1: 17 - 47.
- Karl Benjamin Klunzinger (1871): Synopsis der Fische des Rothen Meeres. II. Theil. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 21: 441 - 688.
- Karl Benjamin Klunzinger (1871): Syst. Uebersicht der Fische des Rothen Meeres. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 21: 1353 - 1368.
- Karl Benjamin Klunzinger (1870): Synopsis der Fische des Rothen Meeres. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 20: 669 - 834.
- Karl Benjamin Klunzinger (1870): Eine zoologische Excursion auf ein Korallriff des rothen Meeres. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 20: 389 - 394.
- Karl Benjamin Klunzinger (1866-1867): Ueber Branchipus rubricandatus nov. spec – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 17: 23 - 33.
- Karl Benjamin Klunzinger (1866): Ueber eine Süsswassercrustacee im Nil. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 16: 357 - 364.
- Karl Benjamin Klunzinger (1864): Einiges zur Anatomie der Daphnien, nebst kurzen Bemerkungen über die Süsswasserfauna der Umgegend Cairo's. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 14: 165 - 173.
- Karl Benjamin Klunzinger (1864): Beiträge zur Kenntniss der Limnadiden. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 14: 139 - 164.