Species (749)
- Septoria pyrethri Bres. & Krieg. 1897
- Septoria sonchifolia Cooke 1878
- Septoria sorbi Lasch 1843
- Septoria stachydis Roberge ex Desm. 1847
- Septoria syringae Sacc. & Speg. 1878
- Septoria tanaceti Niessl 1865
- Septoria tenella Cooke & Ellis 1878
- Septoria silybi Pass. 1879
- Septoria thelygoni Sacc. 1915
- Septoria tormentillae Roberge ex Desm. 1847
- Septoria ulmariae Oudem. 1876
- Septoria veronicae Roberge ex Desm. 1849
- Septoria villarsiae Desm. 1863
- Septoria verbenae Roberge ex Desm. 1847
- Septoria urticae Roberge ex Desm. 1847
- Septoria virgaureae Desm. 1842
- Septoria wilsonii G.P. Clinton 1876
- Septoria xanthii Desm. 1847
- Septoria umbrosa Melnik 1965
- Septoria acerella Sacc. 1884
- Septoria achilleicola Melnik 1967
- Septoria alpicola Sacc. 1897
- Septoria antirrhini Desm. 1853
- Septoria asaricola Allesch. 1900
- Septoria associata Bubák & Kabát 1907
- Septoria atropurpurea Peck 1880
- Septoria astericola Ellis & Everh. 1889
- Septoria aucuparicola Oudem. 1903
- Septoria azaleae Voglino 1899
- Septoria avenae A.B. Frank 1895
- Septoria aucupariae Bres. 1892
- Septoria apiicola Speg. 1888
- Septoria bellidicola Roberge ex Desm. 1853
- Septoria balsaminae Pass. 1879
- Septoria bellidis Roberge ex Desm. 1853
- Septoria betulina Pass. 1879
- Septoria caricis-montanae Vestergr. 1903
- Septoria berteroae Thüm. 1874
- Septoria carthusianorum Westend. 1857
- Septoria cerastii Roberge ex Desm. 1849
- Septoria chamaecisti Vestergr. 1896
- Septoria chelidonii Desm. 1937
- Septoria chrysanthemella Sacc. 1895
- Septoria convolvuli Desm. 1842
- Septoria elymi-europaei Jaap 1907
- Septoria echinopis Bondartsev & Lebedera 1914
- Septoria euphorbiae Kalchbr. 1865
- Septoria exotica Speg. 1880
- Septoria glaucis Syd. 1921
- Septoria fulvescens Sacc. 1878
- Septoria geranii Roberge ex Desm. 1853
- Septoria hepaticae Desm. 1843
- Septoria lysimachiae Westend. 1852
- Septoria lunariae Ellis & Dearn. 1913
- Septoria oudemansii Sacc. 1884
- Septoria pastinacae Westend. 1851
- Septoria orchidearum Westend. 1851
- Septoria sii Roberge ex Desm. 1853
- Septoria saponariae (DC.) Savi & Becc. 1862
- Septoria senecionis Westend. 1852
- Septoria scleranthi Desm. 1857
- Septoria violae-palustris Died. 1914
- Septoria clematidis Roberge ex Desm. 1853
- Septoria caricinella Sacc. & Roum. 1884
- Septoria crepidis Vestergr. 1896
- Septoria caricis Pass. 1879
- Septoria cucurbitacearum Sacc. 1878
- Septoria corni Niessl 1866
- Septoria cruciatae Roberge ex Desm. 1847
- Septoria cyclaminis Durieu & Mont. 1849
- Septoria cymbalariae Sacc. & Speg. 1878
- Septoria diedickei Sacc. & D. Sacc. 1906
- Septoria cytisi Desm. 1847
- Septoria erodii Rayss 1950
- Septoria erigerontis Peck 1872
- Stigmidium fuscatae (Arnold) R. Sant. 1988
- Stigmidium leucophlebiae Cl. Roux & Triebel 1994
- Stigmidium microspilum (Körb.) D. Hawksw. 1975
- Stigmidium mycobilimbiae Cl. Roux, Triebel & Etayo 1994
- Stigmidium lichenum (Arnold) Triebel 2001
- Stigmidium solorinarium (Vain.) D. Hawksw. 1983
- Stigmidium pumilum (Lettau) Matzer & Hafellner 1990
- Stigmidium squamariae (de Lesd.) Cl. Roux & Triebel 1994
- Stigmidium tabacinae (Arnold) Triebel 1989
- Stigmidium stygnospila (Minks) R. Sant. 1960
- Stigmina carpophila (Lév.) M.B. Ellis 1959
- Stigmidium xanthoparmeliarum Hafellner 1994
- Stigmina platani (Fuckel) Sacc. 1880
- Stigmina pulvinata (Kunze) M.B. Ellis 1959
- Stigmidium bellemerei Cl. Roux & Nav.-Ros. 1998
- Stigmidium hageniae (Rehm) Hafellner 1988
- Stigmidium neofusceliae Calatayud & Triebel 1999
- Stigmidium congestum Triebel 1991
- Stigmidium clauzadei Cl. Roux & Nav.-Ros. 1994
- Stigmidium cerinae Cl. Roux & Triebel 1994
- Stigmidium psorae (Anzi) Hafellner 1975
- Stigmidium rivulorum (Kernst.) Cl. Roux & Nav.-Ros. 1994
- Stigmidium schaereri (A. Massal.) Trevisan 1860
- Stigmidium punctillum (Arnold) D. Hawksw. 1975