Species (13.556)
- Septoria lythrina Peck 1880
- Septoria obesa Syd. 1914
- Septoria melissae Desm. 1853
- Septoria inconspicua Berk. & M.A. Curtis 1874
- Septoria lactucae Pass. 1879
- Septoria oenanthis Ellis & Everh. 1894
- Septoria macropoda Pass. 1879
- Septoria oenotherae Westend 1857
- Septoria passerinii Sacc. 1884
- Septoria petroselini Desm. 1843
- Septoria phlogis Sacc. & Speg. 1887
- Septoria paridis Pass. 1879
- Septoria phalaridis Cocc. & Morini 1884
- Septoria plantaginis-majoris (Sacc.) Nannf. 1950
- Septoria polygonorum Desm. 1842
- Septoria posoniensis Bäumler 1885
- Septoria primulae-latifoliae Jaap 1917
- Septoria prostrata Kabát & Bubák 1905
- Septoria salviae Pass. 1879
- Septoria quercicola (Desm.) Sacc. 1895
- Septoria rumicis Ellis 1893
- Septoria scabiosicola Desm. 1853
- Septoria sisymbrii Niessl 1910
- Septoria sambucina Peck 1876
- Septoria sleumeri Petr. 1947
- Septoria soldanellae Speg. 1879
- Septoria sonchi Sacc. 1878
- Septoria ranunculacearum Lév. 1842
- Septoria pyrethri Bres. & Krieg. 1897
- Septoria sonchifolia Cooke 1878
- Septoria sorbi Lasch 1843
- Septoria stachydis Roberge ex Desm. 1847
- Septoria syringae Sacc. & Speg. 1878
- Septoria tanaceti Niessl 1865
- Septoria tenella Cooke & Ellis 1878
- Septoria silybi Pass. 1879
- Septoria thelygoni Sacc. 1915
- Septoria tormentillae Roberge ex Desm. 1847
- Septoria ulmariae Oudem. 1876
- Septoria veronicae Roberge ex Desm. 1849
- Septoria villarsiae Desm. 1863
- Septoria verbenae Roberge ex Desm. 1847
- Septoria urticae Roberge ex Desm. 1847
- Septoria virgaureae Desm. 1842
- Septoria wilsonii G.P. Clinton 1876
- Septotrullula bacilligera Höhn. 1902
- Septoria xanthii Desm. 1847
- Septoria umbrosa Melnik 1965
- Septoriella junci (Desm.) B. Sutton 1980
- Seimatosporium lichenicola (Corda) Shoemaker & E. Müll. 1964
- Selenaspora guernisacii (P. Crouan & H. Crouan) R. Heim & Le Gal 1953
- Selenosporella gliocladioides Helfer 1991
- Sepedonium brunneum Peck 1879
- Sepedonium chalcipori Helfer 1991
- Seimatosporium hypericinum (Ces.) B. Sutton 1975
- Septatium aureum Velen. 1947
- Septatium caricinum Velen. 1947
- Seimatosporium vaccinii (Fuckel) B. Erikss. 1974
- Septatium carpaticum Velen. 1939
- Septatium quercinum Velen. 1939
- Septogloeum carthusianum (Sacc.) Sacc. 1880
- Septoria acerella Sacc. 1884
- Septoria achilleicola Melnik 1967
- Septoria alpicola Sacc. 1897
- Septoria antirrhini Desm. 1853
- Septoria asaricola Allesch. 1900
- Septoria associata Bubák & Kabát 1907
- Septoria atropurpurea Peck 1880
- Septoria astericola Ellis & Everh. 1889
- Septoria aucuparicola Oudem. 1903
- Septoria azaleae Voglino 1899
- Septoria avenae A.B. Frank 1895
- Septoria aucupariae Bres. 1892
- Septoria apiicola Speg. 1888
- Septoria bellidicola Roberge ex Desm. 1853
- Septoria balsaminae Pass. 1879
- Septoria bellidis Roberge ex Desm. 1853
- Septoria betulina Pass. 1879
- Septoria caricis-montanae Vestergr. 1903
- Septoria berteroae Thüm. 1874
- Septoria carthusianorum Westend. 1857
- Septoria cerastii Roberge ex Desm. 1849
- Septoria chamaecisti Vestergr. 1896
- Septoria chelidonii Desm. 1937
- Septoria chrysanthemella Sacc. 1895
- Septoria convolvuli Desm. 1842
- Septoria elymi-europaei Jaap 1907
- Septoria echinopis Bondartsev & Lebedera 1914
- Septoria euphorbiae Kalchbr. 1865
- Septoria exotica Speg. 1880
- Septoria glaucis Syd. 1921
- Septoria fulvescens Sacc. 1878
- Septoria geranii Roberge ex Desm. 1853
- Septoria hepaticae Desm. 1843
- Septoria lysimachiae Westend. 1852
- Septoria lunariae Ellis & Dearn. 1913
- Septoria oudemansii Sacc. 1884
- Septoria pastinacae Westend. 1851
- Septoria orchidearum Westend. 1851