Species (13.556)
- Acanthophiobolus helicosporus (Berk. & Broome) J. Walker 1972
- Acanthostigma scopulum Peck 1887
- Acervus flavidus (Berk. & M.A. Curtis) Pfister 1975
- Acremonium fusidioides (Nicot) W. Gams 1971
- Acremonium charticola (J. Lindau) W. Gams 1971
- Acremonium lichenicola W. Gams 1971
- Acremonium psammosporum W. Gams 1971
- Acrocordiella occulta (Romell) O.E. Erikss 1982
- Acrodontium hydnicola (Peck) De Hoog 1972
- Acrogenospora sphaerocephala (Berk. & Broome) M.B. Ellis 1971
- Acrospermum compressum Tode : Fr. 1790
- Acrospermum conicum Fr. 1822
- Acrostalagmus albus Preuss 1851
- Acrospermum pyramidale Tode 1790
- Acrostalagmus luteoalbus (Link) Zare, W. Gams & Schroers 2004
- Actidium baccarinii (Paoli) H. Zogg 1960
- Actidium hysterioides Fr. 1818
- Actidium nitidum (Ellis) H. Zogg 1960
- Actinocladium rhodosporum Ehrenb. 1819
- Actinoscypha muelleri Graddon 1972
- Actinoscypha scirpicola (Fuckel) E. Müll. 1966
- Adelococcus interlatens (Arnold) Matzer & Hafellner 1990
- Aeruginoscyphus sericeus (Alb. & Schwein. : Fr.) Dougoud 2012
- Abrothallus acetabuli Diederich 1989
- Abrothallus bertianus De Not. 1849
- Abrothallus buellianus De Not. 1846
- Abrothallus caerulescens C. Kotte 1909
- Abrothallus peyritschii (Stein) C. Kotte 1909
- Abrothallus prodiens (Harm.) Diederich & Hafellner 1989
- Abrothallus parmeliarum (Sommerf.) Arnold 1869
- Abrothallus microspermus Tul. 1852
- Abrothallus cetrariae C. Kotte 1909
- Abrothallus usneae Rabenh. 1861
- Acanthostigma ellisii Sacc. & P. Syd. 1899
- Acanthostigma oligospermum Kirschst. 1939
- Acanthostigma minutum (Fuckel) Sacc. 1883
- Acanthostigma pilosellum (P. Karst.) Kirschst. 1938
- Acanthostigma melanolasium Kirschst. 1939
- Acanthostigma septoconstrictum Promp. & A.N. Mill. 2010
- Acanthostigmella orthoseta Höhn. 1909
- Acephala macrosclerotiorum B. Münzenberger & B. Bubner 2009
- Actinothyrium graminis Kunze 1832
- Adelococcus alpestris (Zopf) Theiss. & Syd. 1918
- Acremonium domschii W. Gams 1971
- Acremonium longisporum (Preuss) W. Gams 1971
- Acremonium rhabdosporum W. Gams 1971
- Acrodontiella fallopiae U. Braun & Scheuer 1995
- Acremonium strictum W. Gams 1971
- Acrospermum graminum Lib. 1830
- Acrospermum adeanum Höhn. 1919
- Acrospermum pallidulum Kirschst. 1938
- Acrospermum unguinosum Tode 1783
- Amicodisca brdensis (Velen.) Svr?ek 1987
- Amblyosporium spongiosum (Pers.) S. Hughes 1958
- Amicodisca svrcekii Raitv. & Huhtinen 2001
- Amniculicola immersa Y. Zhang ter, J. Fourn., Crous & K.D. Hyde 2009
- Amicodisca virella (P. Karst.) Huhtinen 1994
- Amniculicola lignicola Y. Zhang ter & K.D. Hyde 2008
- Amorphotheca resinae Parbery 1969
- Ampelomyces quisqualis Ces. 1852
- Amphiporthe raveneliana (Thüm. & Rehm) M.E. Barr 1978
- Amarenomyces ammophilae (Lasch) O.E. Erikss. 1981
- Amarenographium metableticum (Trail) O.E. Erikss. 1982
- Amphisphaerella mycophila (Fr.) Kirschst. 1934
- Amphisphaeria brachyspora Kirschst. 1911
- Amphisphaerella xylostei (Pers. : Fr.) Munk 1953
- Amphisphaeria bufonia (Berk. & Broome) Ces. & De Not. 1863
- Amphisphaeria melanommoides Sacc. 1882
- Amphisphaeria papillata (Schumach.) De Not. 1863
- Amylocarpus encephaloides Curr. 1859
- Anisostomula areola (Fuckel) Höhn. 1918
- Aniptodera chesapeakensis Shearer & M.A. Mill. 1977
- Aniptodera juncicola Volkm.-Kohlm. & Kohlm. 1994
- Annulohypoxylon minutellum (Syd. & P. Syd.) Y.M. Ju, J.D. Rogers & H.M. Hsieh
- Anisogramma virgultorum (Fr.) Theiss. & Syd. 1917
- Anisomeridium viridescens (Coppins) R.C. Harris 1995
- Anguillospora longissima (Sacc. & P. Syd.) Ingold 1942
- Angelina rufescens (Schwein.) Duby 1862
- Anthina aeruginosa Fuckel 1863
- Anthina dichotoma (Roth) Fr. 1832
- Anthina filaris Fr. 1832
- Anthina purpurea Fr. 1832
- Anthostomella nitidula (Sacc.) Cooke 1875
- Anthostomella leptospora (Sacc.) S.M. Francis 1975
- Anthostomella punctulata (Rob.) Sacc. 1882
- Anthostomella phaeosticta (Berk.) Sacc. 1878
- Anthostomella rehmii (Thüm.) Rehm 1881
- Anthostomella rubicola Speg. ex Sacc. & Trotter 1913
- Anthostomella tomicum (Lév.) Sacc. 1875
- Antinoa fumosellina (Starbäck) Velen 1934
- Antinoa pinacea Velen. 1934
- Antinoa strobilina (Fr.) Velen. 1934
- Amblyosporium botrytis Fresen. 1863
- Amniculicola parva Y. Zhang ter, J. Fourn., Crous & K.D. Hyde 2009
- Amphiporthe hranicensis (Petr.) Petr. 1971
- Amphiporthe leiphaemia (Fr. : Fr.) Butin 1980
- Amphisphaerella alpigena (Fuckel) Lar.N. Vassiljeva 1998
- Amphisphaeria franconica Ade 1923