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- Franz Hilgendorf (1905): Fische von Deutsch und Englisch Ost-Afrika. Gesammelt von Oscar Neumann 1893-1895. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 22: 405 - 420.
- Franz Hilgendorf (1904): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 12. Januar 1904 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1904: 1 - 33.
- Franz Hilgendorf (1904): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 9. Februar 1904 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1904: 35 - 42.
- Franz Hilgendorf (1904): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 8. März 1904 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1904: 43 - 53.
- Franz Hilgendorf (1901): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 18. Juni 1901 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1901: 151 - 158.
- Franz Hilgendorf (1901): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 21. Mai 1901 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1901: 137 - 150.
- Franz Hilgendorf (1901): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 16. April 1901 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1901: 87 - 136.
- Franz Hilgendorf (1898): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 19. Juli 1898 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1898: 73 - 93.
- Franz Hilgendorf (1897): Zur Faunistik Deutsch-Ost-Afrikas. – Archiv für Naturgeschichte – 63-1: 47 - 88.
- Franz Hilgendorf, Julius Vosseler (1895): Bericht über die Leistungen in der Carcinologie während des Jahres 1894. – Archiv für Naturgeschichte – 61-2_2: 753 - 911.
- Franz Hilgendorf (1895): Philipp Bertkau. – Archiv für Naturgeschichte – 61-2_2: I-IV.
- Franz Hilgendorf (1895): Bericht über die Leistungen in der Ichthyologie während des Jahres 1892. – Archiv für Naturgeschichte – 61-2_1: 259 - 308.
- Franz Hilgendorf, Fr. Kopsch (1895): Bericht über die Leistungen in der Ichthyologie während des Jahres 1891. – Archiv für Naturgeschichte – 60-2_1: 373 - 470.
- Franz Hilgendorf (1895): Bericht über die Leistungen in der Carcinologie während des Jahres 1891. – Archiv für Naturgeschichte – 60-2_2: 277 - 359.
- Franz Hilgendorf (1895): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 16. Juli 1895 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1895: 143 - 146.
- Franz Hilgendorf, Fr. Kopsch (1893): Bericht über die Leistungen in der Ichthyologie während des Jahres 1890. – Archiv für Naturgeschichte – 59-2_1: 173 - 266.
- Franz Hilgendorf (1893): Bericht über die Leistungen in der Carcinologie während des Jahres 1890. – Archiv für Naturgeschichte – 59-2_2: 349 - 416.
- Franz Hilgendorf (1892): Bericht über die Leistungen in der Carcinologie während des Jahres 1889. – Archiv für Naturgeschichte – 58-2_2: 342 - 398.
- Franz Hilgendorf (1892): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 15. November 1892 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1892: 153 - 187.
- Franz Hilgendorf (1892): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 18. October 1892 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1892: 129 - 152.
- Franz Hilgendorf (1892): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 20. December 1892 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1892: 189 - 262.
- Franz Hilgendorf (1891): Bericht über die Leistungen in der Carcinologie während des Jahres 1888. – Archiv für Naturgeschichte – 57-2-2: 344 - 419.
- Franz Hilgendorf (1891): Bericht über die Leistungen in der Ichthyologie während des Jahres 1889. – Archiv für Naturgeschichte – 57-2-1: 185 - 299.
- Franz Hilgendorf (1890): Bericht über die Leistungen in der Ichthyologie während des Jahres 1889. – Archiv für Naturgeschichte – 56-2-1: 275 - 380.
- Franz Hilgendorf (1890): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 18. Februar 1890 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1890: 19 - 33.
- Franz Hilgendorf (1890): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 21. Januar 1890 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1890: 1 - 18.
- Franz Hilgendorf (1890): Sitzungs - Bericht der Gesellschaft naturforschender Freunde zu Berlin vom 18. März 1890 – Sitzungsberichte der Gesellschaft Naturforschender Freunde zu Berlin – 1890: 35 - 58.
- Franz Hilgendorf (1889): Bericht über die Leistungen in der Ichthyologie während des Jahres 1887. – Archiv für Naturgeschichte – 55-2-1: 273 - 377.
- Franz Hilgendorf (1887): Bericht über die Leistungen in der Ichthyologie während des Jahres 1886. – Archiv für Naturgeschichte – 53-2-1: 237 - 344.
- Franz Hilgendorf (1886): Bericht über die Leistungen in der Ichthyologie während des Jahres 1885. – Archiv für Naturgeschichte – 52-2-1: 332 - 436.
- Franz Hilgendorf (1885): Bericht über die Leistungen in der Ichthyologie während des Jahres 1884. – Archiv für Naturgeschichte – 51-2-2: 328 - 416.
- Franz Hilgendorf (1885): Die Steinheimer Gürrtelechse Propseudopus Fraasii. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 37: 358 - 378.
- Franz Hilgendorf (1884): Bericht über die Leistungen in der Ichthyologie während des Jahres 1883. – Archiv für Naturgeschichte – 50-2: 435 - 521.
- Franz Hilgendorf (1883): Vertilgung der Bettwanze. – Berliner Entomologische Zeitschrift – 27: 301 - 303.
- Franz Hilgendorf (1877): Noch einmal Planorbis multiformis. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 29: 50 - 62.
- Franz Hilgendorf (1877): Neue Forschnugen in Steinheim. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 29: 448 - 456.
- Infusionsthiere als Hautparasiten bei SüsswasserfischenFranz Hilgendorf, A. Paulicki (1869): Infusionsthiere als Hautparasiten bei Süsswasserfischen – Cbl. med. Wiss. – 7: 33 - 35.