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- Stephan Weigl (2023): Sperper Accipiter nisus (Linnaeus 1758) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2023_01: 1.
- Stephan Weigl (2023): Vorwort – Biologiezentrum Linz Sonderpublikationen – Saeugetiere_OOE: 13.
- Stephan Weigl (2023): Bernd (Bert) Krenslehner und die Erlegung des Wolfes Klaffer am Hochficht, Revier Holzschlag, Simmerlmoos, 3. Juli 1957 – Biologiezentrum Linz Sonderpublikationen – Saeugetiere_OOE: 590 - 591.
- Stephan Weigl (2023): Der Europäische Flusskrebs oder Edelkrebs Astacus astacus (Linnaeus 1758) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2023_05: 1.
- Stephan Weigl (2023): Braunkehlchen Saxicola rubetra (Linnaeus 1758) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2023_06: 1.
- Stephan Weigl (2023): DIE OBERÖSTERREICHISCH-SÜDBÖHMISCHE ORNITHOLOGISCHE EXKURSION 2022 – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 030: 127 - 132.
- Martin Brader, Stephan Weigl (2023): EDITORIAL – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 030: 1.
- Leopold Slotta-Bachmayr, Gundi Habenicht, Guido Reiter, Christine Resch, Stefan Resch, Michael Strauch, Jürgen Plass, Alexander Schuster, Stephan Weigl (2023): Rote Liste der Säugetiere Oberösterreichs – Biologiezentrum Linz Sonderpublikationen – Saeugetiere_OOE: 195 - 215.
- Stephan Weigl, Jürgen Plass (2023): Wildschwein Sus scrofa Linnaeus 1758 – Biologiezentrum Linz Sonderpublikationen – Saeugetiere_OOE: 740 - 751.
- Martin Brader, Stephan Weigl (2022): Editorial – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 028-029: 1.
- Stephan Weigl (2022): Tafelente Aythya ferina (Linnaeus, 1758) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2022_01: 1.
- Stephan Weigl (2022): 15. Das entomologische Ausstellungswesen in Oberösterreich – Entomofauna – M4: 136 - 154.
- Martin Brader, Jürgen Plass, Clemens Ratschan, Stephan Weigl, Werner Weißmair, Gerald Zauner (2022): Liste der Wirbeltiere Oberösterreichs 8. Fassung – Linzer biologische Beiträge – 0054_1: 1 - 62.
- Stephan Weigl (2021): Der Kranich Grus grus (Linnaeus 1758) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2021_10: 1.
- EinleitungStephan Weigl (2020): Einleitung – Denisia – 0044: 3 - 5.
- Rote Liste der Brutvögel OberösterreichsNorbert Pühringer, Florian Billinger, Karl Billinger, Maximilian Mitterbacher, Harald Pfleger, Alexander Schuster, Stephan Weigl, Jakob Vratny (2020): Rote Liste der Brutvögel Oberösterreichs – Denisia – 0044: 557 - 581.
- SeglerStephan Weigl (2020): Segler – Denisia – 0044: 274 - 275.
- Alexandra Aberham, Erna Aescht [Wirnsberger], Björn Berning, Agnes Bisenberger, Christian Schröck, Esther Ockermüller, Michael Malicky, Martin Pfosser, Jürgen Plass, Martin Schwarz, Stephan Weigl, Hermine Wiesmüller (2020): Bereich Naturwissenschaften – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 165: 573 - 618.
- Stephan Weigl (2019): Das Biologiezentrum als Zentrum der Biodiversitätsforschung – ÖKO.L Zeitschrift für Ökologie, Natur- und Umweltschutz – 2019_03-04: 4.
- Stephan Weigl, Martin Brader (2019): Ornithologische Dreiländer-Exkursion auf den Dachstein 2019 – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 027: 103 - 112.
- Alexandra Aberham, Erna Aescht [Wirnsberger], Björn Berning, Gerald Brandstätter, Fritz Josef [Friedrich] Gusenleitner, Michael Malicky, Esther Ockermüller, Martin Pfosser, Jürgen Plass, Martin Schwarz, Stephan Weigl, Hermine Wiesmüller (2019): Bereich Naturwissenschaften – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 164: 498 - 527.
- Fritz Josef [Friedrich] Gusenleitner, Erna Aescht [Wirnsberger], Björn Berning, Gerald Brandstätter, Michael Malicky, Martin Pfosser, Martin Schwarz, Stephan Weigl, Hermine Wiesmüller (2018): Bereich Naturwissenschaf ten – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 163: 574 - 600.
- Martin Pfosser, Fritz Josef [Friedrich] Gusenleitner, Michael Malicky, Stephan Weigl, Björn Berning, Erna Aescht [Wirnsberger], Eva Wintersberger, Alexandra Aberham (2018): Booklet zum 25 jährigen Bestand des Biologiezentrums Linz – Museumsführer und zur Geschichte des Oberösterreichischen Landesmuseums – 2018: 1 - 48.
- Stephan Weigl (2017): Der Große Abendsegler Nyctalus noctula (Schreber, 1774) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2017_09: 1.
- Stephan Weigl (2017): Orntihologische Dreiländer-Exkursion nach Südböhmen 2017 – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 025: 57 - 64.
- Fritz Josef [Friedrich] Gusenleitner, Alexandra Aberham, Erna Aescht [Wirnsberger], Björn Berning, Gerald Brandstätter, Michael Malicky, Martin Pfosser, Martin Schwarz, Stephan Weigl, Hermine Wiesmüller (2017): Bereich Naturwissenschaften – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 162: 468 - 501.
- Stephan Weigl, Gerhard Aubrecht (2016): VERTEBRATA (WIRBELTIERE) – Museumsführer und zur Geschichte des Oberösterreichischen Landesmuseums – 2016: 189 - 193.
- Stephan Weigl (2016): DER GROSSE BRACHVOGEL (NUMENIUS ARQUATA) – Museumsführer und zur Geschichte des Oberösterreichischen Landesmuseums – 2016: 76 - 77.
- Stephan Weigl (2016): ORNITHOLOGISCHE DREILÄNDER-EXKURSION AUF DEN FEUERKOGEL 2016 – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 024: 89 - 96.
- Fritz Josef [Friedrich] Gusenleitner, Alexandra Aberham, Erna Aescht [Wirnsberger], Björn Berning, Gerald Brandstätter, Michael Malicky, Martin Pfosser, Martin Schwarz, Stephan Weigl, Hermine Wiesmüller (2016): Bereich Naturwissenschaften – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 161: 489 - 515.
- Martin Brader, Jürgen Plass, Clemens Ratschan, Stephan Weigl, Werner Weißmair, Gerald Zauner (2016): Liste der Wirbeltiere Oberösterreichs – Linzer biologische Beiträge – 0048_1: 327 - 380.
- Stephan Weigl (2015): Die Kolbenente Netta rufina (Pallas 1773) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2015_03: 1.
- Stephan Weigl (2015): Bachforelle Salmo trutta fario (Linne, 1758) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2015_06: 1.
- Fritz Josef [Friedrich] Gusenleitner, Alexandra Aberham, Erna Aescht [Wirnsberger], Björn Berning, Gerald Brandstätter, Michael Malicky, Martin Pfosser, Martin Schwarz, Stephan Weigl, Hermine Wiesmüller (2015): Bereich Naturwissenschaften / Oberösterreichisches Landesmuseum – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 160: 672 - 694.
- Gerhard Aubrecht, Stephan Weigl (2014): IN MEMORIAM Dr.in Gertrud Theresia Mayer (10.3.1927 - 20.5.2014) – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 022: 99 - 103.
- Stephan Weigl, Gerhard Aubrecht (2014): In Memoriam Dr. Gertrud Theresia Mayer – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 159: 327 - 329.
- Stephan Weigl (2014): EXKURSION DER SÜDBÖHMISCHEN, OSTBAYERISCHEN UND OBERÖSTERREICHISCHEN ORNITHOLOGEN IN SÜDBÖHMEN 2014 – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 022: 93 - 98.
- Stephan Weigl (2014): Der Sterlet Acipenser ruthenus (Linnaeus 1758) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2014_02: 1.
- Stephan Weigl (2014): Der Oktopus Octopus vulgaris (Cuvier 1797) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2014_07: 1.
- Stephan Weigl (2013): Ausstellungsreferat Naturwissenschaften am Biologiezentrum Linz (2003-2012) – Beiträge zur Naturkunde Oberösterreichs – 0023_1: 371 - 404.
- Stephan Weigl (2013): Präparation Wirbeltiere 2003-2012 – Beiträge zur Naturkunde Oberösterreichs – 0023_1: 365 - 369.
- Stephan Weigl (2013): Unglaublich aber wahr - Gerhard Aubrecht geht in Pension – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 021: 159 - 175.
- Andrea Benedetter-Herramhof, Stephan Weigl (2012): DER BAIKALSEE Die Perle Sibiriens – Kataloge des OÖ. Landesmuseums N.F. – NS143: 1 - 80.
- Stephan Weigl (2011): UNGEWÖHNLICHER TOD EINER ROHRDOMMEL (Botaurus stellaris) – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 019ab: 93 - 96.
- Stephan Weigl (2011): ORNITHOLOGISCHE DREILÄNDEREXKURSION AUF DEN EBENSEER HOCHKOGEL 2011 – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 019ab: 111 - 114.
- Gerhard Aubrecht, Erna Aescht [Wirnsberger], Björn Berning, Fritz Josef [Friedrich] Gusenleitner, Michael Malicky, Martin Pfosser, Stephan Weigl (2011): Naturwissenschaftliche Sammlungen 2010. – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 156: 288 - 306.
- Gerhard Aubrecht, Erna Aescht [Wirnsberger], Björn Berning, Fritz Josef [Friedrich] Gusenleitner, Michael Malicky, Martin Pfosser, Stephan Weigl (2010): Naturwissenschaftliche Sammlungen 2008 und 2009*. – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 154_155: 477 - 498.
- Stephan Weigl, Martin Brader (2009): ORNITHOLOGISCHE VIERLÄNDER-EXKURSION NACH SÜDBÖHMEN AUF DEN TRUPPENÜBUNGSPLATZ BOLETICE (SPECIAL PROTECTED AREA) IM MAI 2009 – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 017ab: 129 - 140.
- Stephan Weigl, Werner Weißmair, Herbert Rubenser, Harald Pfleger (2008): ORNITHOLOGISCHE VIERLÄNDEREXKURSION NACH WESTUNGARN IM MAI 2008 – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 016b: 151 - 158.
- Stephan Weigl (2008): Ausstellungen. – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 153: 670 - 677.
- Stephan Weigl (2008): Feuersalamander (Salamandra salamandra LINNAEUS 1758) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2008_03: 1.
- Stephan Weigl (2008): Teichmolch Lissotriton vulgaris (Linnaeus 1758) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2008_10: 1.
- Stephan Weigl, Karl Götzendorfer (2007): Der Turmalin – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2007_02: 1.
- Stephan Weigl, Werner Weißmair (2006): ORNITHOLOGISCHE VIERLÄNDEREXKURSION AUF DEN DACHSTEIN, OBERÖSTERREICH – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 014b: 179 - 186.
- Stephan Weigl (2005): Der Rundblättrige Sonnentau – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2005_10: 1.
- Stephan Weigl (2004): Der Zaunkönig – Vogel des Jahres 2004 – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2004_07: 1.
- Stephan Weigl (2003): Biologische Ausstellungen am Biologiezentrum Linz – Beiträge zur Naturkunde Oberösterreichs – 0012: 197 - 214.
- Stephan Weigl (2003): Die Mykologische Arbeitsgemeinschaft am Biologiezentrum Linz – Beiträge zur Naturkunde Oberösterreichs – 0012: 257 - 258.
- Stephan Weigl (2003): Das Präparatorium Wirbeltiere am Biologiezentrum Linz – Beiträge zur Naturkunde Oberösterreichs – 0012: 129 - 134.
- Stephan Weigl (2003): Grauammer – Denisia – 0007: 456 - 457.
- Stephan Weigl (2003): Haubenlerche – Denisia – 0007: 280 - 281.
- Stephan Weigl (2002): Der Zaunkönig Troglodytes troglodytes (LINNAEUS 1758) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2002_02: 1.
- Stephan Weigl (2001): Die Saatkrähe Corvus frugilegus (LINNAEUS 1758) – Naturkundliches Objekt des Monats - Biologiezentrum Linz – 2001_02: 1.
- Rita Kilzer, Stephan Weigl (2001): Erstnachweise der Sturmschwalbe (Hydrobates pelagicus) für Vorarlberg und Oberösterreich. – Egretta – 44_1_2: 154 - 159.
- Stephan Weigl (2001): Die Funktion des Herzens und ihre phytotherapeutische Unterstützung – Stapfia – 0075: 1 - 12.
- Stephan Weigl (2000-2020): Bachforelle Salmo trutta fario (Linne, 1758) – Steckbriefe von Tieren und Pflanzen aus dem Ökopark – 120: 1.
- Stephan Weigl (2000-2020): Feuersalamander (Salamandra salamandra LINNAEUS 1758) – Steckbriefe von Tieren und Pflanzen aus dem Ökopark – 087: 1.
- Nachweis einer Falkenraubmöwe (Stercorarius longicaudis) in OberösterreichNorbert Pühringer, Stephan Weigl (1995): Nachweis einer Falkenraubmöwe (Stercorarius longicaudis) in Oberösterreich – Vogelkundliche Nachrichten aus Oberösterreich, Naturschutz aktuell – 003a: 47.
- Stephan Weigl (1991): Oberösterreichisches Landesmuseum. Ausstellungsreferat für Naturwissenschaften. – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 136b: 32 - 33.