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- Emil Harless (1863): Zur inneren Mechanik der Muskelzuckung und Beschreibung des Atwood'schen Myographion. – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 9: 353 - 418.
- Emil Harless (1863): Molekulare Vorgänge in der Nervensubstanz. IV. Abhandlung. Maassbestimmung der Reizbarkeit im Allgemeinen (Fortsetzung) und bei der Quellung insbesondere. – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 9: 1 - 63.
- Emil Harless (1863): Maassbestimmung der Polarisation durch das physiologische Rheoscop – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 9: 185 - 228.
- Emil Harless (1861): Die Leistung, Ermüdung und Erholung der Muskeln – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1861-1: 43 - 95.
- Emil Harless (1861): Die Wirkung des Ammoniaks auf die nervösen Centralorgane – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1861-1: 273 - 307.
- Emil Harless (1860): Die statischen Momente der menschlichen Gliedmassen. Zweite Abhandlung. – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 8: 257 - 294.
- Emil Harless (1860): Molekulare Vorgänge in der Nervensubstanz. I. Abhandlung: Voruntersuchungen. – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 8: 313 - 379.
- Emil Harless (1860): Die statischen Momente der menschlichen Gliedmassen. – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 8: 69 - 96.
- Emil Harless (1860): Molekulare Vorgänge in der Nervensubstanz. III. Abhandlung. Maassbestimmung der Reizbarkeit. – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 8: 683 - 747.
- Emil Harless (1860): Molekulare Vorgänge in der Nervensubstanz. II. Abhandlung. Voruntersuchungen. – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 8: 529 - 625.
- Emil Harless (1860): Untersuchungen über die Muskelstarre – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1860: 425 - 462.
- Emil Harless (1860): Untersuchungen an der Muskelsubstanz – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1860: 93 - 138.
- Emil Harless (1860): Zur innern Mechanik der Muskelzuckung und Beschreibung des Atwood'schen Myographion – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1860: 625 - 634.
- Emil Harless (1855): Beiträge zu einer wissenschafllichen Begründung der Lehre vom Mienenspiel. – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 7: 697 - 722.
- Emil Harless (1855): Theorie und Anwendung des "Seitendruckspirometers," eines neuen Instrumentes zur Bestimmung der Respirationsluft – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 7: 527 - 557.
- Emil Harless (1853-1854): Ueber die Chromatophoren des Frosches – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 5: 372 - 379.
- Emil Harless (1851-1852): Zusätze zu Dr. v. Wittich's Beobachtung von Pilzbildung im Hühnerei. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 3: 308 - 314.
- Emil Harless (1850): Die MuskelirritabiIität. – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 5: 481 - 510.
- Emil Harless (1850): Ueber den Zahnbau von Myliobates und dem verwandten Rochen Trikeras. – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 5: 841 - 876.
- Emil Harless (1847): Über die Nieren der Sepia oder die sogenannten Venenanhänge. – Archiv für Naturgeschichte – 13-1: 1 - 8.
- Emil Harless (1846): Untersuchung der Chromatophoren bei Loligo. – Archiv für Naturgeschichte – 12-1: 34 - 44.