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- Jakob Friedrich Caflisch (1883): Nekrologe – Berichte des naturwiss. Vereins für Schwaben, Augsburg – 27: 199 - 205.
- Jakob Friedrich Caflisch (1877): Beiträge zur Flora von Augsburg – Berichte des naturwiss. Vereins für Schwaben, Augsburg – 25: 87 - 91.
- Jakob Friedrich Caflisch (1873): Nachträge zur Flora von Schwaben und Neuburg, insbesondere der Umgebung von Augsburg – Berichte des naturwiss. Vereins für Schwaben, Augsburg – 23: 99 - 105.
- Jakob Friedrich Caflisch (1871): Beitrigä zur Flora des k. Regierungsbezirkes Schwaben und Neuburg – Berichte des naturwiss. Vereins für Schwaben, Augsburg – 22: 167 - 175.
- Jakob Friedrich Caflisch (1867): Ueber das Thalabwärts-Wandern der Alpenpflanzen im Lechgebiete – Berichte des naturwiss. Vereins für Schwaben, Augsburg – 20: 135 - 144.
- Jakob Friedrich Caflisch (1866): Nachträge zur Flora von Augsburg – Berichte des naturwiss. Vereins für Schwaben, Augsburg – 19: 101 - 112.
- Jakob Friedrich Caflisch (1862): Beiträge zur Flora des Algäu's – Berichte des naturwiss. Vereins für Schwaben, Augsburg – 15: 88 - 98.
- Jakob Friedrich Caflisch (1858): Eine untergegangene Welt – Berichte des naturwiss. Vereins für Schwaben, Augsburg – 11: 73 - 77.
- Jakob Friedrich Caflisch (1857): Beiträge zur Flora des Regierungs-Bezirkes Schwaben nnd Neuburg – Berichte des naturwiss. Vereins für Schwaben, Augsburg – 10: 59 - 64.
- Jakob Friedrich Caflisch (1856): Nachträge zu der "Uebersicht der Flora von Augsburg" – Berichte des naturwiss. Vereins für Schwaben, Augsburg – 9: 48 - 52.
- Jakob Friedrich Caflisch (1855): Jahres-Bericht über das Wirken des Naturhistorischen Vereins im Jahre 1854 – Berichte des naturwiss. Vereins für Schwaben, Augsburg – 8: 3 - 14.
- Jakob Friedrich Caflisch (1854): 2. Nachtrag zu der "Uebersicht der Flora von Augsburg" – Berichte des naturwiss. Vereins für Schwaben, Augsburg – 7: 30.
- Jakob Friedrich Caflisch (1848): Die Vegetationsgruppen der Umgebung Augsburgs – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 31: 385 - 397.