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- Joseph Schwertschlager (1925): Die Rosen Bayerns - Eine systematische Übersicht der bis 1919 beobachteten Arten und Variationen – Berichte der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der Flora – 18_2: 1 - 128.
- Joseph Schwertschlager (1924): Die Rosen Bayerns. – Botanische Jahrbücher für Systematik, Pflanzengeschichte und Pflanzengeographie – 59: 1 - 13.
- Karl W. Lutz, Joseph Schwertschlager (1921): Erdbeben in Bayern 1908/20. Mit geologischen Anmerkungen von J. Schwertschlager – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1921: 81 - 165.
- Joseph Schwertschlager (1915): Abhandlungen: Beobachtungen und Versuche zur Biologie der Rosenblüte und Rosenbefruchtung. – Berichte der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der Flora – 15: 1 - 16.
- Joseph Schwertschlager (1913): Verzeichnis neuer Formen und Varietäten der Rosenflora Bayerns mit ihren deutschen und lateinischen Diagnosen. – Mitteilungen der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der heimischen Flora – 3_1913: 68 - 77.
- Joseph Schwertschlager (1911): Die Farben der Blüten und Früchte bei den Rosen und andern einheimischen Phanerogamen – Hoppea - Denkschriften der Regensburgischen Botanischen Gesellschaft – 1911_11: 234 - 290.
- Joseph Schwertschlager (1911): Das Auftreten von Wasserdampf bei vulkanischen Eruptionen. – Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1911: 777 - 782.
- Joseph Schwertschlager (1911): Rezensionen. Umgekehrt ist auch gefahren! – Mitteilungen der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der heimischen Flora – 2_1911: 341 - 346.
- Joseph Schwertschlager, W. Graf zu Leiningen (1911): Rezensionen. Umgekehrt ist auch gefahren! – Mitteilungen der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der heimischen Flora – 2_1911: 342 - 344.
- Joseph Schwertschlager (1910): Die Rosen des südlichen und mittleren Frankenjura: Ihr System und ihre phylogenetischen Beziehungen, erörtert mit Hinsicht auf die ganze Gattung Rosa und das allgemeine Deszendenzproblem – Monografien Botanik Blütenpflanzen – 0352: 1 - 270.
- Joseph Schwertschlager (1910): Zum Bastard Rosa dumetorum Thuill. x tomentosa Sm. – Allgemeine botanische Zeitschrift für Systematik, Floristik, Pflanzengeographie – 16_1910: 20.
- Joseph Schwertschlager (1906): Über einige für Bayern neue Rosenarten und mehrere überhaupt neue Artbastarde von Rosen – Berichte der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der Flora – 11: 170 - 175.
- Franz Vollmann, Joseph Schwertschlager, Lorenz Gerstlauer, Eugen Erdner (1906): Literaturbesprechung. – Mitteilungen der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der heimischen Flora – 1_1906: 529 - 530.
- Joseph Schwertschlager (1895): Die Rosenflorula von Eichstätt – Berichte der Bayerischen Botanischen Gesellschaft zur Erforschung der Flora – 4: 22 - 25.