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- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1925): Epitrimerus massalongoianus (Nal) – Archiv für Naturgeschichte – 91A_8: 94 - 120.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1905): Monographie der Johannisbeeren-Blattlaus, Aptiis ribis L. – Zeitschrift für wissenschaftliche Insektenbiologie – 1: 233 - 237.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1905): Monographie der Johannisbeeren BlattlaTjis, Aptiis ribis L. – Zeitschrift für wissenschaftliche Insektenbiologie – 1: 209 - 215.
- Monographie der Johannisbeeren-Blattlaus, Aphis ribis L.Johann Heinrich Ludwig Flögel (1905): Monographie der Johannisbeeren-Blattlaus, Aphis ribis L. – Zeitschrift für wissenschaftliche Insektenbiologie – 1: 144 - 155.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1905): Monographie der Johannisbeeren-Blattlaus, Aphis ribis L. – Zeitschrift für wissenschaftliche Insektenbiologie – 1: 97 - 106.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1905): Monographie der Johannisbeeren-Blattlaus, Aphis ribis L. – Zeitschrift für wissenschaftliche Insektenbiologie – 1: 49 - 63.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1904): Monographie der Johannisbeeren-Blattlaus, Aphis ribis L. – Allgemeine Zeitschrift für Entomologie – 9: 321 - 334.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1904): Monographie der Johannisbeeren-Blattlaus, Aphis ribis L. – Allgemeine Zeitschrift für Entomologie – 9: 375 - 382.
- Gustav Karsten, Johann Heinrich Ludwig Flögel (1883): Feste Rückstände im Regenwasser. – Schriften des Naturwissenschaftlichen Vereins für Schleswig-Holstein – 5_2: 135 - 141.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1883): 1. Ueber die Möglichkeit, vulkanischen Staub in den atmosphärischen Niederschlägen nachzuweisen. 2. Ueber blaue Dunstnebel im Winter 1883/84. – Schriften des Naturwissenschaftlichen Vereins für Schleswig-Holstein – 5_2: 123 - 134.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1883): 3. Notiz, betreffend die Geruchskörper im Insectengehirn – Zoologischer Anzeiger – 6: 539 - 540.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1883): 1. Serienpreaparate – Zoologischer Anzeiger – 6: 565.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1883): 2. Mein Dunkelkasten – Zoologischer Anzeiger – 6: 566 - 567.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1878): Ueber den einheitlichen Bau des Gehirns in den Verschiedenen lnsecten-Ordnungen. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 30_Supp: 556 - 592.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1876): Über eine merkwürdige, durch Parasiten hervorgerufene Gewebsneubildung. – Archiv für Naturgeschichte – 42-1: 106 - 115.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1873): Repertorium. Die Diatomaceen in den Grundproben der Expedition zur Untersuchung der Ostsee. – Hedwigia – 12_1873: 98 - 111.
- Johann Heinrich Ludwig Flögel (1869): Ueber die Lippen einiger Oxyurisarten. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 19: 234 - 243.