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- Friedrich Wilhelm Merkel, Kriemhild Fischer-Klein (1973): Winkelkompensation bei Zwergwachteln (Excalfactoria chinensis) – Vogelwarte - Zeitschrift für Vogelkunde – 27_1973: 39 - 50.
- Wolfgang Wiltschko, Friedrich Wilhelm Merkel (1971): Zugorientierung von Dorngrasmücken (Sylvia communis) im Erdmagnetfeld – Vogelwarte - Zeitschrift für Vogelkunde – 26_1971: 245 - 249.
- Friedrich Wilhelm Merkel, Wolfgang Wiltschko (1965): Magnetismus und Richtungsfinden zugunruhiger Rotkehlchen (Erithacus rubecula) – Vogelwarte - Zeitschrift für Vogelkunde – 23_1965: 71 - 77.
- Friedrich Wilhelm Merkel, Hans Georg Fromme, Wolfgang Wiltschko (1964): Nicht-visuelles Orientierungsvermögen bei nächtlich zugunruhigen Rotkehlchen! – Vogelwarte - Zeitschrift für Vogelkunde – 22_1964: 168 - 173.
- Friedrich Wilhelm Merkel (1961/62): Eiablage bei gekäfigten Rotkehlchen (Erithacus rubecula) unter natürlichen und künstlichen (17:7 Stunden) Lichtverhältnissen – Vogelwarte - Zeitschrift für Vogelkunde – 21_1961: 156 - 160.
- Friedrich Wilhelm Merkel, Sebastian Pfeifer (1959/60): Erfolgreiche Winterbrut der Amsel (Turdus merula) – Vogelwarte - Zeitschrift für Vogelkunde – 20_1959: 134 - 137.
- Friedrich Wilhelm Merkel (1957/58): Untersuchungen zur künstlichen Beeinflussung der Aktivität gekäfigter Zugvögel – Vogelwarte - Zeitschrift für Vogelkunde – 19_1957: 173 - 185.
- Waldemar Trettau, Friedrich Wilhelm Merkel (1943): Ergebnisse einer Planberingung des Trauerfliegenfängers (Muscícapa hypoleuca Pallas) in Schlesien. – Der Vogelzug - Berichte über Vogelzugsforschung und Vogelberingung – 14_1943: 77 - 90.
- Friedrich Wilhelm Merkel (1941): Beiträge zur Heuschreckenfauna Schlesiens. – Mitteilungen der Deutschen Entomologischen Gesellschaft, E.V. – 10: 12 - 17.
- H. Giersberg, Friedrich Wilhelm Merkel (1939): Wasservogel-Beobachtungen im Rhein=Maingebiet. – Jahresbericht - Vogelkundliche Beobachtungsstation Untermain e.V. Frankfurt am Main – 12: 27 - 28.
- Friedrich Wilhelm Merkel (1932): Zur Brutbiologie der Beutelmeise, Remiz pendulinus L., in Schlesien – Journal für Ornithologie – 80_1932: 275 - 284.