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- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1907): Die in Deutschland kultivierten Arundinaria-Arten. – Mitteilungen der Deutschen Dendrologischen Gesellschaft – 16: 221 - 223.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1905): Die in Deutschland kultivierten winterharten Phyllostachys-Formen. – Mitteilungen der Deutschen Dendrologischen Gesellschaft – 14: 53 - 64.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1905): Nachruf auf Johann Anton Schmidt. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 23: 1021 - 1024.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1904): Immergrüne Laubhölzer im Heidelberger Schlossgarten. – Mitteilungen der Deutschen Dendrologischen Gesellschaft – 13: 54 - 58.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1902): Immergrüne Laubhölzer im Heidelberger Schlossgarten. – Mitteilungen der Deutschen Dendrologischen Gesellschaft – 11: 91 - 93.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1902): Über die Gattungsunterschiede von Arundinaria Mchx., Thamnocalamus Munro und Phyllostachys Sieb. Zucc. in nicht blühendem Zustand. – Mitteilungen der Deutschen Dendrologischen Gesellschaft – 11: 94 - 96.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1901): Immergrüne Laubhölzer im Heidelberger Schlossgarten. – Mitteilungen der Deutschen Dendrologischen Gesellschaft – 10: 35 - 39.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1900): Immergrüne Laubhölzer im Heidelberger Schlossgarten. – Mitteilungen der Deutschen Dendrologischen Gesellschaft – 9: 41 - 44.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1899): Immergrüne Laubhölzer im Heidelberger Schlossgarten. – Mitteilungen der Deutschen Dendrologischen Gesellschaft – 8: 95 - 98.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1898): Immergrüne Laubhölzer im Heidelberger Schlossgarten. – Mitteilungen der Deutschen Dendrologischen Gesellschaft – 7: 4 - 12.
- Beiträge zur Systematik der Orchideen. II.Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1898): Beiträge zur Systematik der Orchideen. II. – Botanische Jahrbücher für Systematik, Pflanzengeschichte und Pflanzengeographie – 25: 517.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer, Ad. Meyer (1896): Zur Anatomie der Blüthen- und Fruchtstände von Artocarpus integrifolia L. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 14: 52 - 53.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1895): Beiträge zur Systematik der Orchideen – Botanische Jahrbücher für Systematik, Pflanzengeschichte und Pflanzengeographie – 19: 1 - 42.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1894): Übersicht des natürlichen Systems der Pflanzen – Monografien Botanik Blütenpflanzen – 0391: 1 - 80.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1888): Nachruf auf Robert Caspary – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 6: XXVII-XXXI.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1887): Ueber eine Einbettungsmethode für entwicklungsgeschichtliche Untersuchungen – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 5: LXV-LXVIII.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1887): Entwurf einer natürlichen Anordnung der Orchideen – Monografien Botanik Blütenpflanzen – 0474: 1 - 108.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1885): Ueber Früchte, Keimung und Jugendzustände einiger Palmen. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 3: 32 - 52.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1884): Beobachtungen über Bau und Entwicklung der Orchideen – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 2: 472 - 480.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1883): Zur Morphologie und Anatomie der Monokotylen-ähnlichen Eryngien. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 1: 133 - 137.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1883): Ueber ein Härtung und Färbung vereinigendes Verfahren für die Untersuchung des plasmatischen Zellleibs – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 1: 44 - 47.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1877): Beobachtungen über Bau und Entwicklung epiphytischer Orchideen – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 60: 241 - 248.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1872): Ueber die Einlagerung von Kalkoxalat - Krystallen in die pflanzliche Zellhaut – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 55: 97 - 102.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1872): Ueber die Einlagerung von Kalkoxalat-Kryställen in die pflanzliche Zellhaut – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 55: 129 - 136.
- Ernst Hugo Heinrich Pfitzer (1872): Ueber die Einlagerung von Kalkoxalat-Kryställen in die pflanzliche Zellhaut – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 55: 113 - 120.