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- Joachim Illies (1983): Ökosystemforschung an einem Mittelgebirgsbach (Emergenzanalyse) – Verhandlungen der Gesellschaft für Ökologie – 10_1983: 247 - 253.
- Joachim Illies (1980): Glanz und Elend der Naturwissenschaften. Festvortrag von Prof.Dr.Joachim ILLIES am 3. Juli 1980. – Naturkundliche Beiträge aus dem Allgäu = Mitteilungen des Naturwissenschaftlichen Arbeitskreises Kempten (Allgäu) der Volkshochschule Kempten – 24_2: 1 - 24.
- Joachim Illies (1979): Ehrendoktor für Hans Mendl. – Naturkundliche Beiträge aus dem Allgäu = Mitteilungen des Naturwissenschaftlichen Arbeitskreises Kempten (Allgäu) der Volkshochschule Kempten – 23_1-2: 2 - 4.
- Limnofauna Europaea
Joachim Illies (1978): Limnofauna Europaea – Fischer, Stuttgart, New York; Swets & Zeitlinger, Amsterdam – : 1 - 532. - Joachim Illies, Peter Zwick (1976): Plecoptera Symposium Invitation – Perla – 02: 3.
- Joachim Illies (1974): Emergenzschwankungen - Ein produktionsbiologisches Problem – Verhandlungen der Gesellschaft für Ökologie – 3_1974: 131 - 142.
- Joachim Illies (1973): Europäisches Naturschutzjahr 1970 Eine Bilanz – Mitteilungen der Floristisch-soziologischen Arbeitsgemeinschaft (alte Serie) – NF_15-16_1973: 229 - 232.
- Noahs Arche Wege zum biologischen SystemJoachim Illies (1969): Noahs Arche Wege zum biologischen System – Kosmos, Franckh'sche Verl.handl., Stuttgart – : 1 - 88.
- Isoperla pawlowskii Wojtas (Plecoptera, Insecta), ein postglazialer Einwanderer aus dem OstenJoachim Illies (1968): Isoperla pawlowskii Wojtas (Plecoptera, Insecta), ein postglazialer Einwanderer aus dem Osten – Limnologica – 6/1: 23 - 27.
- Joachim Illies (1967-1970): Die Gattung als ökologische Grundeinheit – Faunistisch-Ökologische Mitteilungen – 3: 369 - 372.
- Joachim Illies (1967): Megaloptera und Plecoptera (Ins.) aus den jungpliozanen Siifiwassermergeln von Willershausen – Berichte der Naturhistorischen Gesellschaft Hannover – 111: 47 - 55.
- Neue Plecopteren aus Chile und ArgentinienJoachim Illies (1965): Neue Plecopteren aus Chile und Argentinien – Mitteilungen der schweizerischen entomologischen Gesellschaft – 37/3: 151 - 156.
- Südamerikanische Perlidae (Plecoptera), besonders aus Chile und ArgentinienJoachim Illies (1964): Südamerikanische Perlidae (Plecoptera), besonders aus Chile und Argentinien – Beiträge zur Neotropischen Fauna – 3/3: 207 - 233.
- Neue Plecopteren aus SüdamerikaJoachim Illies (1964): Neue Plecopteren aus Südamerika – Gewässer und Abwässer – 36: 49 - 57.
- The invertebrate fauna of the Huallaga, a Peruvian tributary of the Amazon River, from the…Joachim Illies (1964): The invertebrate fauna of the Huallaga, a Peruvian tributary of the Amazon River, from the sources down to Tingo Maria – Verh. Intern. Verein Limnol. – 15: 1077 - 1083.
- Joachim Illies (1963-1965): Verbreitungsgeschichtliche Typen bei den Süßwasserinsekten Mitteleuropas – Faunistisch-Ökologische Mitteilungen – 2: 174 - 179.
- Revision der südamerikanischen Gripopterygidae (Plecoptera)Joachim Illies (1963): Revision der südamerikanischen Gripopterygidae (Plecoptera) – Mitteilungen der schweizerischen entomologischen Gesellschaft – 36/3: 145 - 248.
- Neue Plecopteren aus den KarpathenJoachim Illies (1962): Neue Plecopteren aus den Karpathen – Mitteilungen der schweizerischen entomologischen Gesellschaft – 35/3-4: 288 - 295.
- Penturoperlidae, eine neue PlecopterenfamilieJoachim Illies (1960): Penturoperlidae, eine neue Plecopterenfamilie – Zoologischer Anzeiger. Diario....adnexa. Siehe: Bibliographia Zoologica. Supplementband. Siehe: Verh.der Deutschen Zool.Gesellschaft. – 164, Heft 1/2: 26 - 41.
- Zur Kenntnis der neuen Plecopterenfamilie AbranchioperlidaeJoachim Illies (1960): Zur Kenntnis der neuen Plecopterenfamilie Abranchioperlidae – Archiv fuer Hydrobiologie (und Planktonkunde). Frueher: Forschungsberichte aus der Biologischen Station zu Loen. Berlin. – 56/4: 413 - 424.
- Die erste auch im Larvenstadium terrestrische PlecoptereJoachim Illies (1960): Die erste auch im Larvenstadium terrestrische Plecoptere – Mitteilungen der schweizerischen entomologischen Gesellschaft – 33, Heft 3: 161 - 168.
- Joachim Illies (1960): Archiperlaria, eine neue Unterordnung der Plecopteren (Revision der Familien Eustheniidae und Diamphipnoidae) (Plecoptera). – Beiträge zur Entomologie = Contributions to Entomology – 10: 661 - 697.
- Joachim Illies (1959): Die Steinfliegen des Lechgebietes. – Bericht der Naturforschenden Gesellschaft Augsburg – 010_1959: 5 - 12.
- Die Steinfliegen des LechgebietesJoachim Illies (1959): Die Steinfliegen des Lechgebietes – Ber.naturf.Ges.Augsburg – 10: 5 - 12.
Joachim Illies (1955): Isoperla tripartita n.sp., eine neue Plecoptere aus dem Wienerwald. – Österreichische Zoologische Zeitschrift – 05: 118 - 122.- Steinfliegen oder PlecopteraJoachim Illies (1955): Steinfliegen oder Plecoptera – Die Tierwelt Deutschlands und der angrenzenden Meeresteile nach ihren Merkmalen und nach ihrer Lebensweise – 43: 1 - 150.
- Die Plecopteren-Arten der deutschen FaunaJoachim Illies (1954): Die Plecopteren-Arten der deutschen Fauna – Deutsche Entomologische Zeitschrift (Berliner Entomologische Zeitschrift und Deutsche Entomologische Zeitschrift in Vereinigung) – NF_1: 210 - 217.
Joachim Illies (1952): Die bayerischen Plecopteren der Zoologischen Sammlung des Bayerischen Staates – Nachrichtenblatt der Bayerischen Entomologen – 001: 58 - 60.
Joachim Illies (1952): Die bayerischen Pleeopteren der Zoologischen Sammlung des Bayerischen Staates – Nachrichtenblatt der Bayerischen Entomologen – 001: 49 - 51.- Joachim Illies (1952): Die europäischen Arten der Plecopterengattung Isoperla Banks (= Chloroperla Pictet) – Beiträge zur Entomologie = Contributions to Entomology – 2: 369 - 424.
