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- Johannes Frenzel (1897): Nachruf auf Dr. Johannes Frenzel sowie "Neue oder wenig bekannte Süßwasserprotisten" – Biologisches Zentralblatt – 17: 801 - 808.
- Johannes Frenzel (1897): Zur Planktonmethodik. – Biologisches Zentralblatt – 17: 364 - 371.
- Johannes Frenzel (1893): Zellvermehrung und Zellersatz. – Biologisches Zentralblatt – 13: 238 - 243.
- Johannes Frenzel (1892): Über einige argentinische Gregarinen. Ein Beitrag zur Organisation und Physiologie der Gregarinen überhaupt. – Jenaische Zeitschrift für Naturwissenschaft – NF_20: 233 - 336.
- Johannes Frenzel (1891): Notiz über den Wassergehalt des Muskelfleisches. – Biologisches Zentralblatt – 11: 619 - 625.
- Johannes Frenzel (1891): Die nukleoläre Kernhalbierung. – Biologisches Zentralblatt – 11: 701 - 704.
- Johannes Frenzel (1891): Der Zellkern und die Bakterien spore. – Biologisches Zentralblatt – 11: 757 - 763.
- Johannes Frenzel (1891): Ueber die primitiven Ortsbewegungen der Organismen – Biologisches Zentralblatt – 11: 464 - 474.
- Johannes Frenzel (1891): Zur Bedeutung der amitotischen (direkten) Kernteilung. – Biologisches Zentralblatt – 11: 558 - 565.
- Johannes Frenzel (1891): Das Mesozoon: Salinella. – Biologisches Zentralblatt – 11: 577 - 581.
- Johannes Frenzel (1890): 1. Die Saftentleerung bei Schmetterlingen nach deren Ausschlüpfen – Zoologischer Anzeiger – 13: 579 - 580.
- Johannes Frenzel (1888): 1. Über Mumification von Vögeln und anderen zoologischen Objecten – Zoologischer Anzeiger – 11: 706 - 711.
- Johannes Frenzel (1886-1887): Verdauung lebenden Gewebes und Selbstverdauung. – Biologisches Zentralblatt – 6: 681 - 685.
- Johannes Frenzel (1883): 1. Beitrag zur microscopischen Technik (Aufkleben der Schnitte) – Zoologischer Anzeiger – 6: 51 - 52.
- Johannes Frenzel (1883): 1. Neuer Beitrag zur microscopischen Technik – Zoologischer Anzeiger – 6: 422 - 424.
- Johannes Frenzel (1883-1884): Ueber die sogenannten Kalkzellen der Gasteropodenleber. – Biologisches Zentralblatt – 3: 323 - 327.
- Johannes Frenzel (1883-1884): Ueber die Mikrozymas in der Leber und im Pankreas. – Biologisches Zentralblatt – 3: 49 - 52.
- Johannes Frenzel (1882): 3. Der Verdauungstractus der Larve des Tenebrio molitor – Zoologischer Anzeiger – 5: 215 - 217.