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- August Ginzberger, Alfred Burgerstein (1921): Über einige Centaurea-Arten der adriatischen Küsten und Inseln. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 070: 29 - 46.
- Alfred Burgerstein (1921): Änderungen der Spaltöffnungsweite unter dem Einflusse verschiedener Bedingungen. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 70: 113 - 131.
- Alfred Burgerstein (1919): Ablehnung von Umbenennungen bei Koniferen-Arten seitens der Praktiker. – Mitteilungen der Deutschen Dendrologischen Gesellschaft – 28: 89 - 91.
- Alfred Burgerstein (1917): Julius Ritter von Wiesner. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 67: 6 - 12.
- Alfred Burgerstein (1913): Verzeichnis jener botanischen Abhandlungen, welche in den Programmen (Jahresberichten) der österreichischen Mittelschulen in den Jahren 1886-1910 veröffentlicht wurden. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 063: 212 - 221.
- Alfred Burgerstein (1913): Botanische Bestimmung sibirischer Holzskulpturen des Wiener naturhistorischen Hofmuseums. – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 27: 36 - 40.
- Alfred Burgerstein (1913): Botanische Bestimmungnordwestamerikanischer Holzskulpturen des Wiener naturhistorischen Hofmuseums. – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 27: 13 - 17.
- Alfred Burgerstein (1912): Botanische Bestimmung grönländischer Holzskulpturen des naturhistorischen Hofmuseums. – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 26: 243 - 247.
- Alfred Burgerstein (1912): Ergänzungen zur botanischen Bestimmung sibirischer Holzskulpturen. – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 26: 37 - 38.
- Alfred Burgerstein (1912): Anatomische Untersuchungen argentinischer Hölzer des k.k. naturhistorischen Hofmuseums in Wien. – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 26: 1 - 36.
- Alfred Burgerstein (1912): Bohnenpflanzen, aus großen und aus kleinen Samen erzogen. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 62: 17 - 19.
- Diagnostische Merkmale der Markstrahlen von Populus und Salix.Alfred Burgerstein (1911): Diagnostische Merkmale der Markstrahlen von Populus und Salix. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 29: 679 - 684.
- Alfred Burgerstein (1910): Botanische Bestimmung sibirischer Holzskulpturen des Wiener naturhistorischen Hofmuseums. – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 24: 415 - 418.
- Alfred Burgerstein (1909): Pflanzenkulturen im diffusen Tageslichte. (II. Reihe). – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 59: 67 - 71.
- Alfred Burgerstein (1908): Einfluß des Lichtes verschiedener Brechbarkeit auf die Bildung von Farn-Prothallien. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 26a: 449 - 451.
- Alfred Burgerstein (1908): Pflanzenkulturen im diffusen Tageslichte. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 58: 322 - 329.
- Alfred Burgerstein (1907): Der anatomische Bau de Markstrahlen bei der Gattung Pinus. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 57: 287 - 292.
- Alfred Burgerstein (1906): Über die Wirkung anästhesierender Substanzen auf einige Lebenserscheinungen der Pflanzen. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 56: 243 - 262.
- Alfred Burgerstein (1906): Zur Holzanatomie der Tanne, Fichte und Lärche. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 24: 295 - 299.
- Alfred Burgerstein (1906): Zur Kenntnis der Holzanatomie einiger Coniferen. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 24: 194 - 199.
- Alfred Burgerstein (1904): Die Transpiration der Pflanzen. – Monografien Botanik Blütenpflanzen – 0116: 1 - 283.
- Alfred Burgerstein (1901): Ueber das Keimvermögen von 10-16jährigen Gretreidesamen. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 51: 645 - 646.
- Alfred Burgerstein (1901): A. V. Kerner's Beobachtungen über die Zeit des Oeffnens und Schliessens von Blüten. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 051: 185 - 193.
- Alfred Burgerstein (1901): Mikroskopische Untersuchung prähistorischer Hölzer des k.k. naturhistorischen Hofmuseums in Wien. – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 16: 170 - 177.
- Alfred Burgerstein (1901): Materialien zu einer Monographie betreffend die Erscheinungen der Transpiration der Pflanzen. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 51: 49 - 106.
- Alfred Burgerstein (1901): Geschichte der Botanik: IV. Entwicklung der Anatomie und Physiologie der Pflanzen in Österreich von 1850-1900) (Mit 4 Tafel) – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – SH: 219 - 246.
- Alfred Burgerstein (1900): Ueber das Verhalten der Gymnospermen-Keimlinge im Lichte und im Dunkeln. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 18: 168 - 184.
- Pflanzen und Ameisen. 6 Fig.Alfred Burgerstein (1899): Pflanzen und Ameisen. 6 Fig. – Wien. ill. Gartenztg. – 24(31): 270 - 283.
- Alfred Burgerstein (1899): Beiträge zur Xylotomie der Pruneen. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 49: 28 - 32.
- Alfred Burgerstein (1898): Beiträge zur Kenntniss der Holzstuctur der Pomaceen – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 107: 8 - 22.
- Alfred Burgerstein (1897): Ueber die Transpirationsgrösse von Pflanzen feuchter Tropengebiete – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 15: 154 - 165.
- Alfred Burgerstein (1896): Weitere Untersuchungen über den histologischen Bau des Holzes der Pomaceen, nebst Bemerkungen über das Holz der Amygdaleen – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 105: 552 - 582.
- Alfred Burgerstein (1895): Vergleichend-histologische Untersuchungen des Holzes der Pomaceen – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 104: 723 - 772.
- Alfred Burgerstein (1895): Die zoologischen und botanischen Abhandlungen in den im Jahre 1894 erschienenen Jahresberichten österreichischer Mittelschulen mit deutscher Unterrichtssprache – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 45: 266 - 270.
- Alfred Burgerstein (1895): Beobachtungen über die Keimkraftdauer von ein- bis zehnjährigen Getreidesamen. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 45: 414 - 421.
- Biologie und Culturgeschichte des Feigenbaumes.Alfred Burgerstein (1894): Biologie und Culturgeschichte des Feigenbaumes. – Wien. ill. Gartenztg. – 19(26): 93 - 97.
- Alfred Burgerstein (1894): Anatomie des Holzes von Albizzia moluccana. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 12: 170 - 172.
- Alfred Burgerstein (1894): Zur Anatomie des Albizziaholzes. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 12: 267 - 268.
- Alfred Burgerstein (1893): Vergleichend-anatomische Untersuchungen des Fichten- und Lärchenholzes. – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 60: 395 - 432.
- Die natürlichen Schutzeinrichtungen der Pflanzen.Alfred Burgerstein (1893): Die natürlichen Schutzeinrichtungen der Pflanzen. – Wien. ill. Gartenztg. – 18(25): 132 - 140.
- Alfred Burgerstein (1889): Einige Beobachtungen an den Blüthen der Convolvulaceen – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 7: 370 - 375.
- Alfred Burgerstein (1889): Charles Robert Darwin. Eine Skizze seines Lebens und Schaffens. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 29: 497 - 576.
- Alfred Burgerstein (1889): Materialien zu einer Monographie betreffend die Erscheinungen der Transpiration der Pflanzen. II. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 39: 399 - 464.
- Johann Gaunersdorf, Günther [Gunthero] Ritter von Mannagetta Beck, Alfred Burgerstein (1888): Literaturberichte. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 038: 426 - 429.
- Andreas Georg Kornhuber, Günther [Gunthero] Ritter von Mannagetta Beck, Alfred Burgerstein, Hugo Zukal, Prihoda (1888): Literaturberichte. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 038: 173 - 180.
- Andreas Georg Kornhuber, Alfred Burgerstein, Prihoda (1888): Literaturberichte. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 038: 99 - 105.
- Alfred Burgerstein, Richard Wettstein, Vincenz von Borbas [Borbás], Prihoda (1888): Literaturberichte. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 038: 26 - 33.
- Jan Kritel Kaspar Palacky, Alfred Burgerstein, Richard Wettstein, Hugo Zukal, Ernst F. Moriz (Mauriz) Kronfeld (1887): Literaturberichte. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 037: 213 - 218.
- Alfred Burgerstein, Bronislaw [Bronislaus] Blocki, Ed. Formanec, Eustach Woloszczak (1887): Correspondenz. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 037: 218 - 221.
- Günther [Gunthero] Ritter von Mannagetta Beck, Jan Kritel Kaspar Palacky, Alfred Burgerstein, Richard Wettstein, Prihoda (1887): Literaturberichte. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 037: 248 - 255.
- Alfred Burgerstein, Prihoda (1887): Literaturberichte. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 037: 30 - 34.
- Alfred Burgerstein (1887): Nachruf an Dr. Alois Pokorny. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 037: 77 - 80.
- Alfred Burgerstein (1887): Materialien zu einer Monographie betreffend die Erscheinungen der Transpiration der Pflanzen. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 37: 691 - 782.
- Alfred Burgerstein (1887): Instrumente, Präparationsmethoden etc.etc. – Botanisches Centralblatt – 32: 220 - 222.
- Alfred Burgerstein (1887): Ueber die nyctitropischen Bewegungen der Perianthien (Blumenschlaf). – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 27: 615 - 656.
- Alfred Burgerstein (1887): Dr. Alois Pokorny. Nachruf. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 37: 673 - 678.
- Alfred Burgerstein (1886): Verzeichniss jener botanischen Abhandlungen, welche in den Programmen (Jahresberichten) der österreichischen Mittelschulen in den Jahren 1850-1885 veröffentlicht wurden. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 036: 165 - 167.
- Alfred Burgerstein (1886): Verzeichniss jener botanischen Abhandlungen, welche in den Programmen (Jahresberichten) der österreichischen Mittelschulen in den Jahren 1850-1885 veröffentlicht wurden. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 036: 94 - 97.
- Alfred Burgerstein (1886): Verzeichniss jener botanischen Abhandlungen, welche in den Programmen (Jahresberichten) der österreichischen Mittelschulen in den Jahren 1850-1885 veröffentlicht wurden. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 036: 129 - 131.
- Alfred Burgerstein (1886): Instrumente, Präparationsmethoden etc.etc. – Botanisches Centralblatt – 28: 392.
- Alfred Burgerstein (1885): Das pflanzenphysiologische Institut der k. k. Wiener Universität von 1873 - 1884. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 035: 18 - 23.
- Alfred Burgerstein (1885): Ueber einige physiologische und pathologische Wirkungen des Kampfers auf die Pflanzen, insbesondere auf Laubsprosse. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 34: 543 - 562.
- Alfred Burgerstein (1884): Das pflanzenphysiologische Institut der k. k. Wiener Universität von 1873-1884. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 034: 418 - 422.
- Alfred Burgerstein (1883): Ueber die Aufnahme von Wasser durch die Blüthenköpfe einiger Compositen – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 1: 367 - 370.
- Alfred Burgerstein, L. Simkovics, Vincenz von Borbas [Borbás], Heinrich Sabransky, Josef Murr, Bronislaw [Bronislaus] Blocki, Paul Friedrich August Ascherson (1883): Correspondenz. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 033: 202 - 206.
- Alfred Burgerstein (1882): Einige Bemerkungen zur Darwinschen Wurzelkrümmung. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 032: 386 - 390.
- Alfred Burgerstein (1882): Ueber Parasitismus und andere Formen der Symbiose mit besonderer Berücksichtigung pflanzlicher Organismen. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 22: 337 - 371.
- Alfred Burgerstein (1880): Ueber die Kartoffelpflanze. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 20: 69 - 122.
- Alfred Burgerstein (1879): Arbeiten des pflanzenphysiologischen Institutes der k. k. Wiener Universität. XIV. Untersuchungen über die Beziehungen der Nährstoffe zur Transspiration der Pflanzen. II. Reihe. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 78: 607 - 637.
- Alfred Burgerstein (1879): Ueber Pflanzenfasern. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 19: 245 - 286.
- Alfred Burgerstein (1878): Ueber den Keimungsprocess der Samenpflanzen. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 18: 365 - 409.
- Alfred Burgerstein (1878): Die Nadelhölzer der Jetztzeit und der Vorwelt. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 18: 547 - 597.
- Alfred Burgerstein (1877): Das Chlorophyll. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 17: 591 - 626.
- Alfred Burgerstein (1876): Arbeiten des pflanzenphysiologischen Institutes der k. k. Wiener Universität. VI. Untersuchungen über die Beziehung der Nährstoffe zur Transspiration der Pflanzen. I. Reihe. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 73: 191 - 244.
- Alfred Burgerstein (1876): Dr. Wilhelm Velten. Ein Nachruf. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 026: 373 - 375.
- Alfred Burgerstein (1875): Kleinere Arbeiten des pflanzenphysiologischen Institutes der Wiener Universität. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 025: 183 - 186.
- Alfred Burgerstein (1875): Arbeiten des pflanzenphysiologischen Institutes der k. k. Wiener Universität. III. Untersuchungen über das Vorkommen und die Entstehung des Holzstoffes in den Geweben der Pflanzen. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 70: 338 - 355.