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- Carl Wilhelm von Nägeli, A. Peter (1886): Die Hieracien Mittel-Europas. II. Band Monographische Bearbeitung Archleracien mit besonderer Berücksichtigung der mitteleuropäischen Sippen – Monografien Botanik Blütenpflanzen – 0180: 1 - 340.
- Carl Wilhelm von Nägeli, A. Peter (1885): Die Hieracien Mittel-Europas. Monographische Bearbeitung der Piloselloiden mit besonderer Betrachtung der mitteleuropäischen Sippen – Monografien Botanik Blütenpflanzen – 0172: 1 - 931.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1881): Das Wachsthum der Stärkekörner durch Intussusception – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1881: 391 - 438.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1880): Ernährung der niederen Pilze durch Kohlenstoff- und Stickstoffverbindungen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1880: 277 - 367.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1880): Wärmetönung bei Fermentwirkungen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1880: 129 - 146.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1879): Theorie der Gärung – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 13_2: 75 - 205.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1879): Ueber die Fettbildung bei den niederen Pilzen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1879: 287 - 316.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1879): Ueber die Bewegungen kleinster Körperchen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1879: 389 - 453.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1878): Die chemische Zusammensetzung der Hefe – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1878: 161 - 288.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1877): Die niederen Pilze – Monografien Botanik Pilze – 0033: 1 - 315.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1874): Verdrängung der Pflanzenformen durch ihre Mitbewerber – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1874: 109 - 164.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1872): Das gesellschaftliche Entstehen neuer Spezies – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1872: 305 - 344.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1868): Ueber selbstbeobachtete Gesichtserscheinungen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1868-1: 503 - 532.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1867): Die Piloselloiden als Gattungssektion und ihre systematischen Merkmale – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1867-1: 153 - 192.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1867): Die Piloselliformia – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1867-1: 450 - 478.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Aufzählung einiger Zwischenformen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-1: 222 - 235.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Die Zwischenformen zwischen den Pflanzenarten – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-1: 190 - 221.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Über Versuche, betreffend die Capillarwirkungen bei vermindertem Luftdrucke – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-1: 353 - 376.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Über Versuche, betreffend die Capillarwirkungen bei vermindertem Luftdrucke – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-1: 473 - 492.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Ueber die Entstehung und das Wachsthum der Wurzeln bei den Gefässcryptogamen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-2: 525 - 554.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Die Innovation bei den Hieracien und ihre systematische Bedeutung – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-2: 293 - 327.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Die abgeleiteten Pflanzenbastarde – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-1: 71 - 93.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Die Theorie der Bastardbildung – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-1: 93 - 127.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Die Synonymie und Litteratur der Hieracien – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-1: 575 - 596.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Ueber die systematische Behandlung der Hieracien rücksichtlich des Umfanges der Species – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-1: 437 - 472.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Über die Theorie der Capillarität – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-1: 597 - 627.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Die Innovation bei den Hieracien und ihre systematische Bedeutung – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-2: 496 - 524.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1866): Ueber die systematische Behandlung der Hieracien rücksichtlich der Mittelformen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1866-1: 324 - 353.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1865): Entstehung und Begriff der naturhistorischen Art. Rede in der öffentlichen Sitzung der k. Akademie der Wissenschaften am 28. März 1865 – Bayerische Akademie der Wissenschaften - Diverse Serien – 4-20: 1 - 55.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1865): Die Bastardbildung im Pflanzenreiche – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1865-2: 395 - 443.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1865): Ueber die Bedingungen des Vorkommens von Arten und Varietäten innerhalb ihres Verbreitungsbezirkes – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1865-2: 367 - 395.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1865): Ueber den Einfluß äußerer Verhältnisse auf die Varietätenbildung im Pflanzenreiche – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1865-2: 228 - 284.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1865): Entstehung und Begriff der naturhistorischen Art. Rede in der öffentlichen Sitzung der k. Akademie der Wissenschaften am 28. März 1865 zur Feier ihres einhundert und sechsten Stiftungstages – Bayerische Akademie der Wissenschaften - Diverse Serien – 7-1865: 1 - 53.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1864): Der innere Bau der vegetabilischen Zellenmembranen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1864-2: 114 - 170.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1864): Der innere Bau der vegetabilischen Zellenmembranen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1864-1: 282 - 326.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1863): Die Reaction von Jod auf Stärkekörner und Zellmembranen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1863-1: 483 - 546.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1863): Ueber die ungleiche Vertheilung gelöster Stoffe in dem Wassertropfen eines mikroskopischen Präparates – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1863-2: 293 - 303.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1863): Die Reaction von Jod auf Stärkekörner und Zellmembranen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1863-1: 161 - 199.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1863): Ueber die chemische Zusammensetzung der Stärkekörner und Zellmembranen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1863-2: 119 - 143.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1862): Die crystallähnlichen Proteinkörper und ihre Verschiedenheit von wahren Crystallen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1862-2: 120 - 154.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1862): Die Reaction von Jod auf Stärkekörner und Zellmembranen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1862-2: 280 - 312.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1862): Beobachtungen über das Verhalten des polarisirten Lichtes gegen pflanzliche Organisation – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1862-1: 290 - 324.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1862): Gefrieren und Erfrieren – Flora oder Allgemeine Botanische Zeitung – 45: 203 - 207.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1861): Die Wirkung des Frostes auf die Pflanzenzellen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1861-1: 264 - 271.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1861): Die Siebröhren von Cucurbita – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1861-1: 212 - 238.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1861): Die Verdunstung an der durch Korksubstanz geschützten Oberfläche von lebenden und todten Pflanzentheilen – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1861-1: 238 - 264.
- Carl Wilhelm von Nägeli (1861): Beiträge zur Morphologie und Systematik der Ceramiaceae – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1861-2: 297 - 415.