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- Heinrich Wagner (1986): Musealer Naturschutz oder Landschaftspflege? – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 10: 35 - 37.
- Heinrich Wagner (1986): Zum Geleit – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 1: 7.
- Heinrich Wagner (1986): Die Pflanzendecke von Salzburg und ihre Kartierung – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 1: 13 - 18.
- Die natürliche Pflanzendecke Österreichs; VIII+63 S. , 1KarteHeinrich Wagner (1985): Die natürliche Pflanzendecke Österreichs; VIII+63 S.,1Karte – Österr. Akad. Wiss., Komm. f. Raumforsch., Beitr. zur Regionalforsch. – 6: 1 - 63.
- Heinrich Wagner (1985): Zur Trockenvegetation des Virgentales (Osttirol) – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 123: 239 - 246.
- Heinrich Wagner (1985): Campanula latifolia in den Salzburger Tauerntälern (Vorläufige Mitteilung) – Tuexenia - Mitteilungen der Floristisch-soziologischen Arbeitsgemeinschaft – NS_5: 391 - 394.
- Heinrich Wagner (1983): Gedanken zur Zukunft pflanzensoziologischer Forschung – Tuexenia - Mitteilungen der Floristisch-soziologischen Arbeitsgemeinschaft – NS_3: 529 - 533.
- Heinrich Wagner (1979): Die Aufbauphase des Institutes für Botanik der Universität Salzburg 1967 - 1978 – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – SH_1979: 3 - 24.
- Heinrich Wagner (1978): Astragallus Penduliflorus im mittleren Ennstal, Steiermark – Mitteilungen der Ostalpin-Dinarischen pflanzensoziologischen Arbeitsgemeinschaft – 14_1978: 403 - 410.
- Heinrich Wagner (1977): Bericht über die Vegetationskartierung im Rahmen des MaB-Hochgebirgsprogramms im Glocknergebiet. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 186: 75 - 79.
- Heinrich Wagner (1975): Zum Gesellschaftsanschluß von Betula humilis und Pedicularis sceptrum-carolinum bei Edlach im Paltental, Steiermark – Beiträge zur naturkundlichen Forschung in Südwestdeutschland – 34: 403 - 409.
- Heinrich Wagner (1975): Zum Geleit – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 1: 1 - 2.
- Heinrich Wagner (1975): Kriterien für erhaltenswerte Landschaften und einzelne Naturobjekte – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 2: 2 - 9.
- Heinrich Wagner (1971): Eberhard Fugger als Botaniker. – Mitt(h)eilungen der Gesellschaft für Salzburger Landeskunde – 110_111_2: 493 - 494.
- Heinrich Wagner (1970): Vegetationskartierung als Grundlage planmässigen Naturschutzes. – Mitteilungen aus dem Haus der Natur Salzburg – FS_80: 119 - 123.
- Heinrich Wagner (1970): Zur Abgrenzung der subalpinen gegen die alpine Stufe – Mitteilungen der Ostalpin-Dinarischen pflanzensoziologischen Arbeitsgemeinschaft – 11_1970: 225 - 233.
- Heinrich Wagner (1963): Landschaftsforschung und Vegetationskarlierung – Mitteilungen der Österreichischen Geographischen Gesellschaft – 105: 235 - 242.
- Heinrich Wagner (1961): Grundfragen der Systematik der Waldgesellschaften – Mitteilungen der Ostalpin-Dinarischen pflanzensoziologischen Arbeitsgemeinschaft – 1_1961: 19 - 22.
- Heinrich Wagner (1956): Die pflanzengeographische Gliederung Österreichs – Mitteilungen der Österreichischen Geographischen Gesellschaft – 98: 78 - 92.
- Die Bewertung der Wasserstufen in der Bodenschätzung des GrünlandesHeinrich Wagner (1956): Die Bewertung der Wasserstufen in der Bodenschätzung des Grünlandes – Mitteilungen der Österreichischen Bodenkundlichen Gesellschaft – 2: 4 - 21.
- Heinrich Wagner (1950): Vegetationskartierungen in Oberösterreich imSommer 1948 – Naturkundliche Mitteilungen aus Oberösterreich – 0001: 9.
- Handbuch der Landwirtschaft. Pflanzensoziologie des Acker- und GrünlandesHeinrich Wagner (1950): Handbuch der Landwirtschaft. Pflanzensoziologie des Acker- und Grünlandes – Monografien Botanik Blütenpflanzen – 0112: 1 - 350.
- Die Vegetationsverhältnisse der Donauniederung des MachlandesHeinrich Wagner (1950): Die Vegetationsverhältnisse der Donauniederung des Machlandes – Monografien Botanik Blütenpflanzen – 0417: 1 - 32.
- Heinrich Wagner (1947): Naturschutz und Kulturmaßnahmen in der "feuchten Ebene" des Wiener Beckens – Natur und Land (vormals Blätter für Naturkunde und Naturschutz) – 1947_3-4: 87 - 94.
- Heinrich Wagner (1941): Die Trockenrasengesellschaften am Alpenostrand. Eine Pflanzensoziologische Studie. (Mit 4 Assoziationstabellen, 12 Textfiguren und 1 Tafel.) – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 104: 1 - 81.