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- Johannes Lütkemüller (1917): Die Zellmembran und die Zellteilung von Closterium Nitzsch. – Berichte der Deutschen Botanischen Gesellschaft – 35: 311 - 318.
- Johannes Lütkemüller (1913): Die Gattung Cylindrocystis Menegh.(Tafel 2) – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 63: 212 - 230.
- Johannes Lütkemüller (1910): Zur Kenntnis der Desmidiaceen Böhmens. (Tafel 2-3) – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 60: 478 - 503.
- Johannes Lütkemüller (1905): Zur Kenntnis der Gattung Penium Bréb. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 55: 332 - 337.
- Johannes Lütkemüller (1903): Ueber die Gattung Spirotaenia Bréb. II. Beschreibung neuer Arten und Bemerkungen über bekannte. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 053: 396 - 405.
- Johannes Lütkemüller (1903): Ueber die Gattung Spirotaenia Bréb. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 053: 483 - 488.
- Johannes Lütkemüller (1900): Desmidiaceen aus den Ningpo-Mountains in Centralchina. (Tafel VI) – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 15: 115 - 126.
- Johannes Lütkemüller (1900): Desmidiaceen aus der Umgebung des Millstättersees in Kärnten. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 50: 60 - 84.
- Johannes Lütkemüller (1895): Ueber die Gattung Spirotaenia Breb. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 045: 1 - 6.
- Johannes Lütkemüller (1895): Ueber die Gattung Spirotaenia Breb. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 045: 88 - 94.
- Johannes Lütkemüller (1895): Ueber die Gattung Spirotaenia Breb. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 045: 51 - 57.
- Johannes Lütkemüller (1894): Die Poren der Desmidiaceengattung Closterium Nitzsch. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 044: 11 - 16.
- Johannes Lütkemüller (1894): Die Poren der Desmidiaceengattung Closterium Nietzsch. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 044: 49 - 53.
- Johannes Lütkemüller (1893): Beobachtungen über die Chlorophyllkörper einiger Desmidiaceen. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 043: 41 - 44.
- Johannes Lütkemüller (1893): Beobachtungen über die Chlorophyllkörper einiger Desmidiaceen. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 043: 5 - 11.
- Johannes Lütkemüller (1892): Desmidiaceen aus der Umgebung des Attersees in Oberösterreich. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 42: 537 - 570.