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- Johannes M. Bouchal, Claudia Dojen, Thomas Denk (2017): Die Neubearbeitung der fossilen Flora von Leše/Liescha am Landesmuseum für Kärnten: vorläufige Mitteilung – Carinthia II – 207_127: 395 - 400.
- Thomas Denk (2007): Naturschutzfachliche Erhebungen zum Sandabbau am Wachberg bei Melk (Niederösterreich), Flora und Vegetation. (N.F. 472) – Wissenschaftliche Mitteilungen Niederösterreichisches Landesmuseum – 18: 7 - 25.
- Thomas Denk (2006): Rhododendron ponticum L. var. sebinese (SORDELLI) SORDELLI in the Late Pleistocene flora of Hötting, Northern Calcareous Alps: witness of a climate waremer than today?. – Veröffentlichungen des Tiroler Landesmuseums Ferdinandeum – 86: 43 - 66.
- Thomas Denk, Hannes Seehofer, Hans-Martin Berg, Markus Braun, Thomas Hochebner, Manfred A. Jäch (2005): Biotoperhebung Garnisonsübungsplatz (GÜPl) Völtendorf bei St. Pölten, NÖ. Vegetationskundliche und faunistische Kartierung 2000-2001. (N.F. 463) – Wissenschaftliche Mitteilungen Niederösterreichisches Landesmuseum – 17: 183 - 264.
- Thomas Denk (2005): Flora und Xerothermvegetation der Schotterterrassen im Unteren Traisental. (N.F. 463) – Wissenschaftliche Mitteilungen Niederösterreichisches Landesmuseum – 17: 7 - 182.
- Thomas Denk (2002): Die pannonische Flora im Unteren Traisental. – Lanius – 11_01: 8 - 9.
- Franz Essl, Thomas Denk (2001): Die Trockenflora alpenbürtiger Flußtäler des nördlichen Alpenvorlandes - ein Vergleich mit dem Wiener Neustädter Steinfeld – Stapfia – 0077: 35 - 60.
- Thomas Denk (2000): Flora und Vegetation der Trockenrasen des tertiären Hügellandes nördlich von St. Pölten aus arealkundlicher sowie naturschutzfachlicher Sicht – Stapfia – 0072: 1 - 209.
- Thomas Denk (1999): Die Flora des Gumpenecks und des Walchengrabens in den Wölzer Tauern (Steiermark) – Joannea Botanik – 01: 27 - 114.
- Thomas Denk, Hannes Seehofer, Hans-Martin Berg, Christian O. Dietrich (1999): Die Salzerau. Naturschutzfachliche Grundlagen für eine mögliche Schutzgebietsausweisung - Vegetation und Fauna (Kurzfassung). – Lanius – 08_01-02: 5.