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  • Josef Maria Pernter (1906): Der Formenreichtum der Schneekristalle. (4 Falttafeln unpaginiert.) – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 46: 485 - 499.
  • Josef Maria Pernter (1904): Besondere Gattungen gefürchteter Winde bei uns und anderwärts. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 44: 449 - 475.
  • Josef Maria Pernter (1903): Allerlei Methoden, das Wetter zu prophezeien. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 43: 367 - 402.
  • Josef Maria Pernter (1902): Luftspiegelungen und Fata Morgana. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 42: 359 - 391.
  • Historische Einleitung. (Seiten I- XXX). Josef Maria Pernter
    Josef Maria Pernter (1901): Historische Einleitung. (Seiten I- XXX). – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 73.
  • Josef Maria Pernter (1901): Untersuchungen über die Polarisation des Lichtes in trüben Medien und des Himmelslichtes mit Rücksicht auf die Erklärung der blauen Farbe des Himmels. – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 73: 301 - 328.
  • Josef Maria Pernter (1901): Die scheinbare Gestalt des Himmelsgewölbes und die scheinbare Grösse der Gestirne. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 41: 221 - 253.
  • Josef Maria Pernter (1898): Neues über den Regenbogen. (1 Falttafel.) – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 38: 227 - 260.
  • Josef Maria Pernter (1897): Nachruf an Prof. v. Härdtl. – Berichte des naturwissenschaftlichen-medizinischen Verein Innsbruck – 23: 3 - 6.
  • Josef Maria Pernter (1897): Die Farben des Regenbogens und der weisse Regenbogen. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 106_2a: 135 - 235.
  • Josef Maria Pernter (1896): Beobachtungen am meteorologischen Observatorium der k.k. Universität Innsbruck. Jahr 1893. – Berichte des naturwissenschaftlichen-medizinischen Verein Innsbruck – 22: 193 - 201.
  • Josef Maria Pernter (1896): Die allgemeine Luftdruckvertheilung und die Gradienten bei Föhn – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 105_2a: 117 - 137.
  • Josef Maria Pernter (1895): Über die Häufigkeit, die Dauer und die meteorologischen Eigenschaften des Föhns in Innsbruck. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 104_2a: 427 - 461.
  • Josef Maria Pernter (1894): Beobachtungen am meteorologischen Observatorium der k.k. Universität Innsbruck. – Berichte des naturwissenschaftlichen-medizinischen Verein Innsbruck – 21: 123 - 131.
  • Josef Maria Pernter (1894): Die Niederschlagsverhältnisse der Umgebung von Bozen in den Jahren 1891-1893. – Berichte des naturwissenschaftlichen-medizinischen Verein Innsbruck – 21: 98 - 121.
  • Josef Maria Pernter (1893): Zur Erklärung des täglichen Ganges der Windgeschwindigkeit. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 102_2a: 979 - 993.
  • Josef Maria Pernter (1893): Die Wolken. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 33: 353 - 379.
  • Josef Maria Pernter (1892): Meteorologische Beobachtungen an der k.k. Universität Innsbruck Jahr 1891. – Berichte des naturwissenschaftlichen-medizinischen Verein Innsbruck – 20: 173 - 182.
  • Josef Maria Pernter (1892): Die Wärmevertheilung auf der Erdoberfläche und ihre Ursachen. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 32: 119 - 148.
  • Josef Maria Pernter (1891): Die Windverhältnisse auf dem Sonnblick und einigen anderen Gipfelstationen. – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 58: 203 - 281.
  • Josef Maria Pernter (1891): Über die Höfe und Ringe um Sonne und Mond und verwandte Erscheinungen. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 31: 197 - 226.
  • Josef Maria Pernter (1890): Die blaue Farbe des Himmels. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 30: 197 - 219.
  • Josef Maria Pernter (1889): Die modernen Wetterpropheten. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 29: 163 - 188.
  • Josef Maria Pernter (1887): Ueber die Temperatur der Sonne. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 27: 515 - 534.
  • Josef Maria Pernter (1886): Der Mond und das Wetter. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 26: 1 - 16.
  • Josef Maria Pernter (1886): Tromben und Tornados. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 26: 521 - 550.
  • Josef Maria Pernter (1885): Ueber die Dämmerungserscheinungen. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 25: 219 - 247.