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- Matthias Schultz, Pia-Franziska Paul (2021): Die Flechten des Eichenparks: Auch kleine städtische Parks können ökologisch wertvoll sein – Berichte des Botanischen Vereins zu Hamburg – 32: 3 - 14.
- Pia-Franziska Paul, Matthias Schultz (2021): Vorkommen der Grünalge Trentepohlia spp. in Neugraben-Fischbek (Hamburg) – Berichte des Botanischen Vereins zu Hamburg – 32: 15 - 25.
- Matthias Schultz, Christian Dolnik, Patrick Neumann, Ulf Schiefelbein (2016): Die Flechten auf der Elbinsel Neßsand – Berichte des Botanischen Vereins zu Hamburg – 30: 97 - 114.
- Tassilo Feuerer, Matthias Schultz (2016): Standardliste der Flechten der Freien und Hansestadt Hamburg – Berichte des Botanischen Vereins zu Hamburg – 29: 3 - 56.
- Matthias Schultz (2014): Significant type collections of Lichinaceae and allied lichenized ascomycetes in the herbaria of the Natural History Museum, Vienna (W) and the Institute of Botany, Vienna University (WU) – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 116B: 207 - 246.
- Matthias Schultz, Hans-Helmut Poppendieck (2012): Im Herbarium Hamburgense entdeckt: Ein zweihundertzwanzig Jahre alter Nachweis der Wendelähre (Spiranthes spiralis) für Hamburg-St. Pauli – Berichte des Botanischen Vereins zu Hamburg – 26: 155 - 158.
- Zwackhiomyces namibiensis, a new lichenicolous ascomycete (Xanthopyreniaceae) on Psorotichia from…Paul Diederich, Matthias Schultz (2009): Zwackhiomyces namibiensis, a new lichenicolous ascomycete (Xanthopyreniaceae) on Psorotichia from Namibia – Herzogia – 22: 173 - 176.
- Diversity of epiphytic lichens in the savannah biome of NamibiaLuciana Zedda, Matthias Schultz, Gerhard Rambold (2009): Diversity of epiphytic lichens in the savannah biome of Namibia – Herzogia – 22: 153 - 164.
- André Aptroot, Matthias Schultz (2008): Notizen über kaum bekannte, kleine cyanobakterielle Flechten überwiegend aus den feuchten Tropen und Subtropen – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 15: 433 - 458.
- Matthias Schultz (2007): Beobachtungen an Flechten im Park des Klinikums Ochsenzoll sowie in angrenzenden Grün- und Wohnanlagen in Hamburg-Langenhorn – Berichte des Botanischen Vereins zu Hamburg – 23: 89 - 97.
- Erstfunde von Flechten und lichenicolen Pilzen in DeutschlandMatthias Schultz, Tassilo Feuerer, Volkmar Wirth (2007): Erstfunde von Flechten und lichenicolen Pilzen in Deutschland – Herzogia – 20: 329 - 334.
- Notes on the lichens and lichenicolous fungi of western Crete (Greece)Toby [Tobi] Spribille, Matthias Schultz, Othmar Breuss, Erwin Bergmeier (2006): Notes on the lichens and lichenicolous fungi of western Crete (Greece) – Herzogia – 19: 125 - 148.