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- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1929): Nachtrag zum Carpus und Tarsus der Pterosaurier – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1929: 175 - 177.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1929): Über Anurognathus Ammoni Döderlein – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1929: 47 - 63.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1929): Ein Pterodactylus mit Kehlsack und Schwimmhaut – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1929: 65 - 76.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1929): Über Rhamphorhynchus und sein Schwanzsegel – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1929: 1 - 46.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1928): 8.) Kreisförmige Stoßzähne bei einem rezenten Elefanten. – Mammalian Biology (früher Zeitschrift für Säugetierkunde) – 3: 213 - 230.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1927): Die Abwürfe des zahmen Edelhirsches "Hans" – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 31: 1 - 27.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1927): Indopacifische Euryalae – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 31: 1 - 105.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1923): Anurognathus Ammoni, ein neuer Flugsaurier – Sitzungsberichte der mathematisch-physikalischen Klasse der Bayerischen Akademie der Wissenschaften München – 1923: 117 - 164.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1921): Betrachtungen über die Entwicklung der Nahrungsaufnahme bei Wirbeitieren – Zoologica (bis Bd 8 unter dem Namen Bibliotheca Zoologica) – 27_71: 1 - 59.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1917): Über die Gattung Oreaster und Verwandte. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 40: 409 - 440.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1915): Die Arten der Asteroiden-Gattung Anthenea Gray. – Jahrbücher des Nassauischen Vereins für Naturkunde – 68: 21 - 55.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1913/14): Die Steinkorallen aus dem Golf von Neapel. – Mittheilungen aus der Zoologischen Station zu Neapel – 21: 105 - 152.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1912): Über Wassertiere und Landtiere. – Zoologischer Anzeiger – 40: 85 - 93.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1911-1913): Über Echinoidea von den Aru-Inseln. – Abhandlungen der Senckenbergischen Naturforschenden Gesellschaft – 34_1911-1913: 235 - 248.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1910): B) Asteroiden Ophiuroidea, Echinoidea. – Denkschriften der medicinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena – 16: 245 - 258.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1910-1914): Über japanische und andere Euryalae – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – Supp-II-1910: 1 - 123.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1908): Asterina lüderitziana, eine neue Art aus Südwest-Afrika. – Jahrbücher des Nassauischen Vereins für Naturkunde – 61: 296 - 298.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1906): Die polyporen Echinoiden von Japan. – Zoologischer Anzeiger – 30: 515 - 521.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1904): Über Seeigel der deutschen Tiefsee-Expedition. – Zoologischer Anzeiger – 28: 621 - 624.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1902-1905): Die Korallengattung Fungia. – Abhandlungen der Senckenbergischen Naturforschenden Gesellschaft – 27_1902-1905: 1 - 162.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1901): Über die Erwerbung des Flugvermögens bei Wirbelthieren. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 14: 49 - 61.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1901): Diagnosen einiger von der Vaidivia-Expedition gesammelter Seeigel-Arten aus dem Indischen Ocean. – Zoologischer Anzeiger – 24: 19 - 23.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1901): Die Korallen-Gattung Fungia. – Zoologischer Anzeiger – 24: 353 - 360.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1901): Japanische Seesterne. – Zoologischer Anzeiger – 25: 326 - 335.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1901): Japanische Euryaliden. – Zoologischer Anzeiger – 25: 320 - 326.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1899): Einige Beobachtungen an arktischen Seesternen. – Zoologischer Anzeiger – 22: 337 - 339.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1899-1902): 2. Das Gastralskelett (Bauchrippen oder Parasternum) – Abhandlungen der Senckenbergischen Naturforschenden Gesellschaft – 26_1899-1902: 328 - 336.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1898): Über die Lithonina, eine neue Gruppe von Kalkschwämmen. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 10: 15 - 32.
- Otto [Johann Adam] Bütschli, Julius Viktor Carus, Ludwig Heinrich Philipp Döderlein, Ernst Heinrich Ehlers, H.W. Ludwig, Karl August Möbius, F. E. Schulze, Johann Wilhelm Spengel (1895): Regeln für die wissenschaftliche Benennung der Thiere im Auftrage der Deutschen Zoologischen Gesellschaft. – Archiv für Naturgeschichte – 61-1: 362 - 371.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1894-1903): Bericht über die von Herrn Professor Semon bei Amboina und Thursday Island gesammelten Ophiuroidea. – Denkschriften der medicinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena – 8: 277 - 300.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1894-1903): Ueber „Krystallkörper" bei Seesternen und über die Wachsthumserscheinungen und Verwandtschaftsbeziehungen von Goniodiscus sebae. – Denkschriften der medicinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena – 8: 489 - 503.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1894-1903): Bericht über die von Herrn Professor Semon bei Amboina und Thursday Island gesammelten Echinoidea. – Denkschriften der medicinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena – 8: 683 - 726.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1894-1903): Bericht über die von Herrn Professor Semon bei Amboina und Thursday Island gesammelten Crinoidea. – Denkschriften der medicinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena – 8: 473 - 480.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1894-1903): Ueber einige epizoisch lebende Ophiuroidea. – Denkschriften der medicinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena – 8: 481 - 488.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1894-1903): Bericht über die von Herrn Professor Semon bei Amboina und Thursday Island gesammelten Asteroidea. – Denkschriften der medicinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena – 8: 301 - 322.
- Otto [Johann Adam] Bütschli, Julius Viktor Carus, Ludwig Heinrich Philipp Döderlein, Ernst Heinrich Ehlers, Hubert Ludwig, Karl August Möbius, Johann Wilhelm Spengel, Franz Eilhard Schulze (1894): Dritter Entwurf von Regeln für die wissenschaftliche Benennung der Thiere im Auftrage der Deutschen Zoologischen Gesellschaft – Verhandlungen der Deutschen Zoologischen Gesellschaft – 3: 89 - 98.
- Julius Viktor Carus, Ludwig Heinrich Philipp Döderlein, Karl August Möbius (1892): 3. Deutsche Zoologische Gesellschaft – Zoologischer Anzeiger – 15: 260.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1889): 4. Das Skelet von Pleuracanthus – Zoologischer Anzeiger – 12: 123 - 127.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1888): Echinodermen von Ceylon. Bericht über die von den Herren D. Sarasin gesammelten Asteroidea, Ophiuroidea und Echinoidea. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 3: 821 - 846.
- Franz Steindachner, Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1887): Beiträge zur Kenntniss der Fische JapanŽs. (IV.) (Mit 4 Tafeln.) – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 53_1: 257 - 296.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1887): 4. Über schanzlose Katzen – Zoologischer Anzeiger – 10: 606 - 608.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1887-1888): Phylogenetische Betrachtungen. – Biologisches Zentralblatt – 7: 394 - 402.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1887): Eine Eigenthümlichkeit triassischer Echinoideen – Neues Jahrbuch für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1887_2: 1 - 4.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1886): Eine recente ,,Cidaris Buchi" – Neues Jahrbuch für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1886: 192 - 194.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1885): Seeigel von Japan und den Liu-Kiu-Inseln. – Archiv für Naturgeschichte – 51-1: 73 - 112.
- Franz Steindachner, Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1885): Beiträge zur Kenntniss der Fische JapanŽs. (III.) (Mit 7 Tafeln.) – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 49_1: 171 - 212.
- Franz Steindachner, Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1884): Beiträge zur Kenntniss der Fische JapanŽs. (II.) (Mit 7 Tafeln.) – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 48_1: 1 - 40.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1884): Studien an japanischen Litbistiden. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 40: 62 - 104.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1883): Faunistische Studien in Japan. Enoshima und die Sagami-Bai. – Archiv für Naturgeschichte – 49-1: 102 - 123.
- Franz Steindachner, Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1883): Beiträge zur Kenntniss der Fische JapanŽs. (I.) (Mit 7 Tafeln.) – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 47_1: 211 - 242.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1882): Ein Stomiatide aus Japan. – Archiv für Naturgeschichte – 48-1: 26 - 31.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1881): Wissenschaftliche Original-Mittheilungen. Botanische Mittheilungen aus Japan. – Botanisches Centralblatt – 8: 27 - 31.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1878): Über das Skelet des Tapirus Pinchacus. – Archiv für Naturgeschichte – 44-1: 37 - 90.
- Ludwig Heinrich Philipp Döderlein (1837-1838): Dissertatio de Sophoclis Ajace – Abhandlungen der Bayerischen Akademie der Wissenschaften - Philosophisch-philologische Classe = I. Classe – 2-1837: 107 - 130.
- InsektenlarvenLudwig Heinrich Philipp Döderlein: Insektenlarven – Manuskript – : 2 - 11.