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- Johannes Felix (1922-1925): Über die Gattung Phyllocoenia – Sitzungsberichte der Naturforschenden Gesellschaft zu Leipzig – 49-52: 71 - 77.
- Johannes Felix (1914): Fossilium Catalogus I. Animalia – Fossilium Catalogus I. Animalia – 5: 1 - 84.
- Johannes Felix (1914): Fossilium Catalogus I. Animalia – Fossilium Catalogus I. Animalia – 7: 145 - 273.
- Johannes Felix (1913): Die fossilen Anthozoen aus der Umgegend von Trinil. – Palaeontographica - Beiträge zur Naturgeschichte der Vorzeit – 60: 311 - 365.
- Johannes Felix (1913): Beiträge zur Paläontologie und Geologie von Palästina und Syrien. – Neues Jahrbuch für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1913_2: 93 - 116.
- Johannes Felix (1910): Ueber Hippuritenhorizonte in den Gosauschichten der nordöstlichen Alpen. – Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1910: 396.
- Johannes Felix (1909): Über eine untertertiäre Korallenfauna aus der Gegend von Barcelona. – Palaeontographica - Beiträge zur Naturgeschichte der Vorzeit – 56: 113 - 136.
- Johannes Felix (1908): Beiträge zur Kenntnis der Korallenfauna des syrischen Cenoman – Beiträge zur Paläontologie von Österreich = Mitteilungen des Geologischen und Paläontologischen Institutes der Universität Wien – 022: 169 - 175.
- Johannes Felix (1907): Ueber Hippuritenhorizonte in den Gosauschichten der nordöstlichen Alpen. – Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1907: 417 - 422.
- Johannes Felix (1907-08): Studien über die Schichten der oberen Kreideformation in den Alpen und den Mediterrangebieten. – Palaeontographica - Beiträge zur Naturgeschichte der Vorzeit – 54: 251 - 338.
- Johannes Felix (1906): 2. Über eine Korallenfauna ans der Kreideformation Ost-Galiziens. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 58: 38 - 52.
- Johannes Felix (1905): Ueber Hippuritenhorizonte in den Gosauschichten der nordöstlichen Alpen. – Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1905: 77 - 81.
- Johannes Felix (1904): 4. Studien über tertiäre und quartäre Korallen und Riffkalke aus Ägypten und der Sinai-halbinsel. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 56: 168 - 206.
- Johannes Felix, Hermann Rauff, Max Ludwig Paul Blanckenhorn (1903): DIE FOSSILE FAUNA DES LIBANESISCHEN JURAKALKES. – Beiträge zur Paläontologie von Österreich = Mitteilungen des Geologischen und Paläontologischen Institutes der Universität Wien – 015: 165 - 183.
- Johannes Felix (1903): Verkieselte Korallen als Geschiebe im Diluvium von Schlesien und Mähren. – Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1903: 561 - 577.
- Johannes Felix (1903): 3. Korallen aus portugiesischem Senon. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 55: 45 - 55.
- Johannes Felix (1903): 1. Korallen ans ägyptischen Miocänbildungen. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 55: 1 - 22.
- Johannes Felix, H. Lenk (1902): Zur Frage der Abhängigkeit der Vulkane von Dielocationen. – Centralblatt für Mineralogie, Geologie und Paläontologie – 1902: 449 - 460.
- Johannes Felix (1902): Studien über die korallenführenden Schichten der oberen Kreideformation in den Alpen und den Mediterrangebieten – Palaeontographica - Beiträge zur Naturgeschichte der Vorzeit – 49: 163 - 360.
- Johannes Felix, H. Lenk (1902): 11. Bemerkungen zur Topographie und Geologie von Mexico. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 54: 426 - 440.
- Johannes Felix (1899): 2. Studien an cretaceischen Anthozoen. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 51: 378 - 387.
- Johannes Felix (1898): Beiträge zur Kenntniss der Astrocoeninae. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 50: 247 - 256.
- Johannes Felix (1897): Untersuchungen über den Versteinerungsprocess und Erhaltungszustand pflanzlicher Membranen. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 49: 182 - 192.
- Johannes Felix (1896): Untersuchungen über fossile Hölzer. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 48: 249 - 260.
- Johannes Felix (1894): Untersuchungen über fossile Hölzer. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 46: 79 - 110.
- Johannes Felix (1894): Studien über fossile Pilze. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 46: 269 - 280.
- Johannes Felix (1892): Ueber die tektonischen Verhältnisse der Republik Mexico. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 44: 303 - 323.
- Johannes Felix (1890): Beiträge zur Kenntniss der Gattung Protosphyraena Leidy. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 42: 278 - 302.
- Johannes Felix, H. Lenk (1890-91): Uebersicht über die geologischen Verhältnisse des mexicanischen Staates Puebla – Palaeontographica - Beiträge zur Naturgeschichte der Vorzeit – 37: 117 - 139.
- Johannes Felix (1890-91): Versteinerungen aus der mexicanischen Jura und Kreide-Formation – Palaeontographica - Beiträge zur Naturgeschichte der Vorzeit – 37: 140 - 199.
- Johannes Felix (1887): Untersuchungen über fossile Hölzer. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 39: 517 - 528.
- Johannes Felix (1886): Untersuchungen über fossile Hölzer. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 38: 483 - 492.
- Johannes Felix (1885): Kritische Studien über die tertiäre Korallen-Fauna des Viecntins nebst Beschreibung einiger neuer Arten. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 37: 379 - 421.
- Johannes Felix (1883): Untersuchungen über fossile Hölzer. – Zeitschrift der Deutschen Geologischen Gesellschaft – 35: 59 - 91.
- Johannes Felix (1882): Beiträge zur Kenntniss fossiler Coniferen-Hölzer – Botanische Jahrbücher für Systematik, Pflanzengeschichte und Pflanzengeographie – 3: 260 - 280.