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- Werner Schwarzhans, Helmut Keupp (2022): Early teleost otolith morphogenesis observed in the Jurassic of Franconia, Bavaria, southern Germany – Zitteliana Serie A+B gemeinsam – 96: 51 - 67.
- Helmut Keupp, Franz-Josef Scharfenberg, Johann Schobert (2022): A possible terrestrial egg cluster in driftwood from the Lower Jurassic (Late Pliensbachian) of Buttenheim (Franconia, Germany) – Zitteliana Serie A+B gemeinsam – 96: 135 - 143.
- Joachim Gründel, Helmut Keupp, Fritz Lang, Alexander Nützel (2022): Late Jurassic (Upper Kimmeridgian) Heterobranchia (Gastropoda) of the coral-facies of Saal near Kelheim and the viciniy of Nattheim (Germany) – Zitteliana Serie A+B gemeinsam – 96: 179 - 221.
- Joachim Gründel, Helmut Keupp, Fritz Lang (2019): Arten der Unterklasse Caenogastropoda aus der Korallenfazies des oberen Kimmeridgiums (Ober-Jura) von Saal bei Kelheim und dem Gebiet Nattheim (Süddeutschland) – Zitteliana Serie A+B gemeinsam – 93: 97 - 142.
- Joachim Gründel, Helmut Keupp (2017): Die Arten der Patellogastropoda und Vetigastropoda (Gastropoda) aus den Korallenriffen des oberen Kimmeridgiums (oberer Jura) von Saal bei Kelheim und dem Gebiet Nattheim (Süddeutschland) – Zitteliana Serie A+B gemeinsam – 89: 171 - 228.
- Helmut Keupp, Kristin Mahlow (2017): Eine neue Isopoden-Art (Palaega johannschoberti n. sp.) aus dem Amaltheenton (Unter-Jura, Ober-Pliensbachium) von Buttenheim in Oberfranken – Zitteliana Serie A+B gemeinsam – 89: 161 - 170.
- Joachim Gründel, Helmut Keupp, Fritz Lang (2015): Die Arten der Unterklasse Neritimorpha Koken, 1896 (Gastropoda) aus der Korallenfazies des oberen Kimmeridgiums (oberer Jura) von Saal bei Kelheim und dem Gebiet Nattheim (Süddeutschland) – Zitteliana Serie A – 55: 77 - 106.
- Juraphyllites mimatensis (d’Orbigny, 1845) (Ammonoidea: Phylloceratida), a Tethyan immigrant…Helmut Keupp, Günter Schweigert (2008): Juraphyllites mimatensis (d’Orbigny, 1845) (Ammonoidea: Phylloceratida), a Tethyan immigrant in the Upper Pliensbachian of Franconia (Jurassic, Southern Germany) – Palaeodiversity – 1: 133 - 140.
- Antonio G. Checa, Helmut Keupp (1999): Regulation of coiling in planispiral ammonites, inferred from cases of infestation in vivo by epizoans – Berichte der Geologischen Bundesanstalt – 46: 27.
- Helmut Keupp (1999): Injuries: A key to understanding life modes of ammonoids – Berichte der Geologischen Bundesanstalt – 46: 56.
- Helmut Keupp, Ulrike Kienel (1994): Wandstrukturen bei Pithonelloideae (Kalkige Dinoflagellaten-Zysten): Biomineralisation und systematische Konsequenzen – Abhandlungen der Geologischen Bundesanstalt in Wien – 50: 197 - 217.
- Helmut Keupp (1993): Kalkige Dinoflagellaten-Zysten in Hell-DunkelRhythmen des Ober-Hauterive/Unter-Barrême NW-Deutschlands – Zitteliana - Abhandlungen der Bayerischen Staatssammlung für Paläontologie und Histor. Geologie – 20: 25 - 39.
- Helmut Keupp, Dieter Freitag (1992): Kiellos - und doch ein Pleuroceras? – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1992: 131 - 136.
- Helmut Keupp (1986): Perlen (Schalenkonkretionen) bei Dactylioceraten aus dem fränkischen Lias – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1986: 97 - 102.
- Helmut Keupp (1980): Ein Pachycormus in „Schlafstellung" aus dem unteren Lias-Epsilon von Altdorf – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1980: 33 - 41.
- Helmut Keupp (1979): Die Blätterton-Fazies der nordwestdeutschen Unterkreide — Teil 1 Calciodinelloidea aus der Blätterton-Fazies des nordwestdeutschen Unter-Barremium – Berichte der Naturhistorischen Gesellschaft Hannover – 122: 7 - 69.
- Helmut Keupp (1978): Biogen beeinflußte Beachrock-Zementation auf Rarotonga / Cook Inseln – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1978: 35 - 40.
- Helmut Keupp (1977): Ultrafazies und Genese der Solnhofener Plattenkalke (Oberer Malm, Südliche Frankenalb) – Abhandlungen der Naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg – 37: 1 - 128.
- Helmut Keupp (1977): Strukturveränderung im eozänen Fischschiefer von Monte Bolca (Oberitalien) – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1977: 33 - 41.
- Helmut Keupp (1976): Skelettbildende Einzeller in der Paläontologie – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1976: 27 - 34.
- Helmut Keupp (1975): Der Solnhofener Plattenkalk — Ein neues Modell seiner Entstehung – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1975: 19 - 36.
- Helmut Keupp (1974): Die Geschichte von Delphi aus geologischer Sicht – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1974: 51 - 56.
- Helmut Keupp (1973): Der Einfluß von Organismen auf den Kreislauf der Gesteine – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1973: 57 - 63.
- Harald Plachter, Helmut Keupp (1972): Periglaziale Vereisung im Windlock bei Sackdilling (Franken, Deutschland) – Die Höhle – 023: 100 - 111.
- Helmut Keupp (1971): Neue Erkenntnisse in der Karst-Geologie durch Lackabzüge – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1971: 37 - 38.
- Helmut Keupp (1970): Ein Ichthyosaurus-Fund bei Altdorf – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1970: 85 - 88.
- Helmut Keupp (1969): Saurierspuren über der Treppe des Luitpoldhauses – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1969: 34.
- Helmut Keupp (1968): Klein-Fossilien in der Fränkischen Schweiz – Jahresbericht der Naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg – 1968: 25 - 28.
- Helmut Keupp, Spyridon Bellas (2001): Zur Paläontologie der Jungtertiär-Becken in NW-Kreta (Prov. Chania, Griechenland) – Natur und Mensch - Jahresmitteilungen der naturhistorischen Gesellschaft Nürnberg e.V. – 1801-2001: 109 - 126.