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Otto Koller (1935): Die Rassen des westafrikanischen Rotbüffels. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 144: 419 - 453.
Otto Koller (1934): Säugetiere von Costa Rica (Ein tiergeographischer Beitrag). – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 143: 169 - 194.
Otto Koller (1931): Die Säugetierfauna der Pityusen (Spanien). – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 140: 57 - 65.
Otto Koller (1930): Säugetiere aus Tunis, gesammelt von Alfred Weidholz, 1912. – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 44: 1 - 4.
Moritz Sasi, Georg Cufodontis, Hans Rebel, Eduard Reimoser, Otto Koller (1929): Wissenschaftliche Ergebnisse einer Reise nach Norddalmatien im Jahre 1928. Tafel VII-VIII. – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 43: 187 - 228.
Otto Koller (1928): Die geographische Verbreitung der Süßwasserfische in Südeuropa – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 137: 627 - 642.
Otto Koller (1928): Bericht über eine zoologische Sammelreise nach der Incoronata-Insel (Dalmatien). Seite(4)-(8) – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 42: 4 - 8.
Otto Koller, Karl Lohberger (1927): Fische aus dem Thian-Schan Gesammelt von Prof. Dr. Stummer von Traunfels (Graz) – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 136: 151 - 158.
Otto Koller (1927): Fische von der Insel Hai-nan.(Tafel I.) – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 41: 25 - 49.
Otto Koller (1925): Eine kritische Übersicht über die bisher beschriebenen mittel- und südeuropäischen Arten der Cyprinidengattung Barbus Cu v. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 135: 167 - 202.
Otto Koller (1925): Arbeiten aus der ichthyologischen Sammlung. I. Beiträge zur Kenntnis des inneren Baues von Cyclothone signata (Garman). – Annalen des Naturhistorischen Museums in Wien – 38: 123 - 133.- Otto Koller (1912): Weisse Bekassine. – Ornithologisches Jahrbuch – 23: 230.
- Otto Koller (1911): Wieder eine Somateria mollissima in Oberösterreich erlegt. – Ornithologisches Jahrbuch – 22: 226.
- Otto Koller (1909): Somateria mollissima in Oberösterreich erlegt. – Ornithologisches Jahrbuch – 20: 153.
