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- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain, Hermann Kohl (1974): Karte des historischen Weinbaues in Oberösterreich. – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 119a: 131 - 144.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1966): Die heiligen drei Jungfrauen von Brunnental bei Schärding, Oberösterreich, ihre Vorläufer und Nachfolger. – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 111: 337 - 342.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1963): Die Stammformen der Bodenständigen Mostbirnen in Oberösterreich, Niederösterreich und der Steiermark (Nachtrag) – Naturkundliches Jahrbuch der Stadt Linz (Linz) – 9: 119 - 122.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1962): Die Stammformen der Bodenständigen Mostbirnen in Oberösterreich, Niederösterreich und in der Steiermark – Naturkundliches Jahrbuch der Stadt Linz (Linz) – 8: 85 - 264.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1962): Die Wurzel- und Kernechten Stammformen der Pflaumen in Oberösterreich (Nachtrag 1962) – Naturkundliches Jahrbuch der Stadt Linz (Linz) – 8: 265 - 273.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1961): Die Wurzel- und kernechten Stammformen der Pflaumen in Oberösterreich – Naturkundliches Jahrbuch der Stadt Linz (Linz) – 7: 7 - 150.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain, Josef Traunmüller (1961): Die Grünerle (Alnus viridis CHAIX-DC) im Bereiche des südlichen Böhmerwaldes – Naturkundliches Jahrbuch der Stadt Linz (Linz) – 7: 151 - 174.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1960): Bodenständige Obsthölzer der Gegenwart, Früh- und Urgeschichte in den Ostalpen. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 100: 181 - 221.
- Elise [Elisabeth] Hofmann, Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1956): Sammelfrüchte und Getreidebau aus der Bronzezeit zu Traun bei Linz – Naturkundliches Jahrbuch der Stadt Linz (Linz) – 2: 7 - 11.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1956): Römischer und vorrömischer Wein- und Obstbau im österreichischen Donauraum – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 96: 114 - 131.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1955): Spätantike Reste von Kulturpflanzen in Lavant in Osttirol. – Veröffentlichungen des Tiroler Landesmuseums Ferdinandeum – 35: 131 - 134.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1955): Das Steinobst vom römischen Erdkastell zu Linz-Donau – Naturkundliches Jahrbuch der Stadt Linz (Linz) – 1: 41 - 54.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1955): Der Obstweihefund im Vorraum des Mithraeums zu Linz-Donau, Oberösterreich – Naturkundliches Jahrbuch der Stadt Linz (Linz) – 1: 9 - 39.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1955): Kahlschlag und Fichtenreinkultur- Die Ursachen zum Untergange der Wildobsthölzer und damit des Obstbaues auf bodenständigen Unterlagen. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 95: 88 - 103.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1955): Orts- und Flurnamen aus Gehölzen, Grasfluren und Ödland in Oberösterreich – Oberösterreichische Heimatblätter – 1955_1: 54 - 66.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1954): Die Formenkreise des Sandhafers (Avena strigosa Schreb.) in Oberösterreich. Ein neuer Mannigfaltigkeits-Mittelpunkt im unteren Mühlviertel – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 94: 97 - 113.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1953): Die Formenkreise der bodenständigen Wildnuß in Ober- und Niederösterreich – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 93: 112 - 119.
- Friedrich Morton, Max Onno, Gustav Wendelberger, Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1949): Festschrift Karl Ronniger. Inhalt: Morton, Friedrich (Hallstatt): Weitere Untersuchungen über dasnVorkommen von Juniperus Sabina L. im Salzkammergute. Dritte Mitteilung. Onno, Max (Wien): Purpurroter Geisklee (Cytisus purpureus Scop.) Exkursion in die heiser Berge (1933). Wendelberger, Gustav (Wien): Die Schachblume (Fritillaria Meleagris Ii) im südlichen Burgenland. Zur Verbreitung von Najas marina L. in Niederösterreich. Werneck-Willingrain (Linz a.D.): Die senfblättrige Zackenschote (Bunias Erucago L.) als bodenständiges Ackerunkraut in Oberösterreich, (Arbeiten der Botanischen Station in Hallstatt Nr. 86) – Arbeiten aus der Botanischen Station in Hallstatt – 086: 1 - 47.
- Bruno Weinmeister, Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1949): Wissenschaftliche Tätigkeit und Heimatpflege in Oberösterreich. Landesmuseum. Naturwissenschaftliche Abteilung. Botanische Arbeitsgemeinschaft. – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 94: 33 - 35.
- Friedrich Morton, Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain, Gustav Wendelberger (1948): Festschrift Martin Rikli. Enthält: Friedrich Morton (Hallstatt) Phänologisches vom Hallstätter Seegestade in 0Ö. (Vorarbeiten zu einer Pflanzengeographie des Salzkammergutes X). Werneck-Willingrain, Heinrich (Linz a,D): Der Formenkreis von Avena strigosa Schreb. in Oberösterreich. (Vorläufige Mitteilung). Wendelberger,Gustav (Wien): Die Salzpflanzen des pannonischen Raumes, (Arbeiten aus der Botanischen Station in Hallstatt Nr. 84) – Arbeiten aus der Botanischen Station in Hallstatt – 084: 1 - 17.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1948): Zur Geschichte des Rotkleebaues in Oberösterreich – Oberösterreichische Heimatblätter – 1948_2: 174 - 179.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1947): Franz von Schrank - Ein Mitbegründer der naturwissenschaftlichen Forschung in Oberösterreich – Oberösterreichische Heimatblätter – 1947_3: 235 - 240.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1940): Berichte über wissenschaftliche Tätigkeit im Gau (1939). Landesarchiv. Landwirtschaftlich-chemische Staats-Versuchsanstalt. – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 89: 323 - 330.
- Zur Frage der Entstehungsmittelpunkte des Spelzbaues im deutschen Sprachgebiete MitteleuropasHeinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1938): Zur Frage der Entstehungsmittelpunkte des Spelzbaues im deutschen Sprachgebiete Mitteleuropas – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 087: 62 - 68.
- Getreidefunde von Wels in Oberösterreich aus der Zeit zwischen 200 und 400 n. Chr. Geb.Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1937): Getreidefunde von Wels in Oberösterreich aus der Zeit zwischen 200 und 400 n. Chr. Geb. – Österreichische Botanische Zeitschrift = Plant Systematics and Evolution – 086: 222 - 226.
- Heinrich Ludwig Werneck-Willingrain (1935): Die naturgesetzlichen Grundlagen der Land- und Forstwirtschaft in Oberösterreich. Versuch zu einer Pflanzengeographie und -Ökologie. – Jahrbuch des Oberösterreichischen Musealvereines – 86: 165 - 440.