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- Monika Kriechbaum, Josef Pennerstorfer (2023): Landschaft(spflege) im Wandel – Rückblick und Ausblick – Naturschutz - Nachrichten d. Niederösterr. Naturschutzbundes (fr. Naturschutz bunt) – 2023_3: 3 - 5.
- Josef Pennerstorfer (2021): Förderpreis der Privatstiftung Sparkasse Krems Zuerkennung des Förderpreises 2020 an LANIUS – Lanius – 30: 18.
- Josef Pennerstorfer (2021): Förderpreis der Privatstiftung Sparkasse Krems Zuerkennung des Förderpreises 2020 an LANIUS – Lanius – 30: 18.
- Michaela Neubauer, Monika Kriechbaum, Matthias Kropf, Josef Pennerstorfer (2021): Neufund des Narbigen Maiwurms, Meloe cicatricosus (Leach, 1815) (Coleoptera: Meloidae), im Naturschutzgebiet Eichkogel in Niederösterreich – Beiträge zur Entomofaunistik – 22: 334 - 338.
- Störfaktor Borkenkäfer – Monitoring und Risikoabschätzung von Buchdruckergradationen in…Peter Baier, Josef Pennerstorfer (2021): Störfaktor Borkenkäfer – Monitoring und Risikoabschätzung von Buchdruckergradationen in nutzungsfreien Schutzgebieten – Schriften des Nationalparks Gesäuse – 16: 90 - 93.
- Heinz Wiesbauer, Josef Pennerstorfer, Rudolf Schuh, Herbert Zettel (2020): Der Schwarzblaue Ölkäfer (Meloe proscarabaeus Linnaeus, 1758), das Insekt des Jahres 2020, und einige bemerkenswerte Ölkäferfunde – Beiträge zur Entomofaunistik – 21: 245 - 258.
- Josef Pennerstorfer, Hannes Seehofer, Andreas Wenger (2019): Trockenmauersanierungen am Naturdenkmal Sommerl in Schwallenbach – Lanius – 28_01-02: 9 - 11.
- Josef Pennerstorfer, Monika Kriechbaum (2018): Erstnachweis von Neoclytus acuminatus (Fabricius, 1775) (Coleoptera: Cerambycidae) für Österreich – Beiträge zur Entomofaunistik – 19: 140 - 143.
- Stefanie Stadler, Monika Kriechbaum, Josef Pennerstorfer (2017): Habitatausstattung von Steinkauzrevieren Athene noctua (Scopoli, 1769) in der Weinbaulandschaft östlich von Krems (Niederösterreich) – Egretta – 55: 118 - 132.
- Erich Steiner, Thomas Holzer, Josef Pennerstorfer (2013): Schmetterlinge. – Ausstellungskataloge Niederösterreichisches Landesmuseum – SB08: 3 - 98.
- Josef Pennerstorfer, Monika Kriechbaum (2011): Eine der letzten Feuchtwiesen des südlichen Waldviertels gerettet? – Lanius – 20_03-04: 9 - 10.
- Josef Pennerstorfer (2010): Neuer Aufwind für den Apollofalter in der Wachau. – Lanius – 19_01-02: 9 - 10.
- Monika Kriechbaum, Josef Pennerstorfer (2009): Eine Chance für ein Schmetterlingsparadies in Schwallenbach. – Lanius – 18_01-02: 3 - 4.
- Monika Kriechbaum, Josef Pennerstorfer, Susanne Rest (2008): Veränderungen der Kulturlandschaft im Bundesland Salzburg und mögliche Auswirkungen auf naturschutzrelevante Grünlandelemente am Beispiel der Gemeinde Krispl – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 16: 379 - 383.
- Einleitung und Danksagung.Rainer Raab, Andreas Chovanec, Josef Pennerstorfer (2006): Einleitung und Danksagung. – In: RAAB Rainer, CHOVANEC Andreas & Josef PENNERSTORFER (Hrsg.), Libellen Österreichs – : 1 - 3.
- Bearbeitungsraum.Josef Pennerstorfer (2006): Bearbeitungsraum. – In: RAAB Rainer, CHOVANEC Andreas & Josef PENNERSTORFER (Hrsg.), Libellen Österreichs – : 35 - 45.
- Datengrundlagen.Josef Pennerstorfer, Rainer Raab (2006): Datengrundlagen. – In: RAAB Rainer, CHOVANEC Andreas & Josef PENNERSTORFER (Hrsg.), Libellen Österreichs – : 47 - 51.
- Datenauswertungen.Josef Pennerstorfer, Rainer Raab (2006): Datenauswertungen. – In: RAAB Rainer, CHOVANEC Andreas & Josef PENNERSTORFER (Hrsg.), Libellen Österreichs – : 53 - 55.
- Libellen Österreichs.Rainer Raab, Andreas Chovanec, Josef Pennerstorfer (2006): Libellen Österreichs. – Publikationen des Umweltbundesamtes, Wien – REP_035: 1 - 345.
- Libellen Österreichs.Rainer Raab, Andreas Chovanec, Josef Pennerstorfer (2006): Libellen Österreichs. – Monografien Entomologie Gemischt – 0033: 1 - 355.
- Verbreitungskarten der Tagschmetterlinge der Stadt Wien (Lepidoptera: Papilionoidea &…Helmut Höttinger, Josef Pennerstorfer, Manfred Pendl, Martin Wiemers, Gernot Räuschl (2006): Verbreitungskarten der Tagschmetterlinge der Stadt Wien (Lepidoptera: Papilionoidea & Hesperioidea). – Beiträge zur Entomofaunistik – 7: 69 - 104.
- Helmut Höttinger, Josef Pennerstorfer, Manfred Pendl, Martin Wiemers, Gernot Räuschl (2006): Verbreitungskarten der Tagschmetterlinge der Stadt Wien (Lepidoptera: Papilionoidea & Hesperioidea) – Beiträge zur Entomofaunistik – 7: 69 - 104.
- Michael J. McGrady, Josef Pennerstorfer (2006): GIS-supported analyses of Golden Eagle (Aquila chrysaetos) habitats: characteristics of some eagle ranges in Austria – Diverse Verlagsschriften des Naturhistorischen Museums Wien – 10: 61 - 68.
- Peter Huemer, Josef Pennerstorfer (2004): Endemische Schmetterlinge in Österreich – Denisia – 0013: 317 - 324.
- Helmut Höttinger, Josef Pennerstorfer (2001): Aufruf zur Mitarbeit .... Neufassung der Roten Liste gefährdeter Tagfalter Österreichs. – Entomologica Austriaca – 0002: 21.
- Helmut Höttinger, Josef Pennerstorfer (2001): Neufassung der Roten Liste gefährdeter Tagfalter Österreichs: Aufruf zur Mitarbeit. – Beiträge zur Entomofaunistik – 2: 125 - 126.
- Helmut Höttinger, Josef Pennerstorfer (1999): Tagfalter: Rhopalocera & Hesperiidae. Eine Rote Liste der in Niederösterreich gefährdeten Arten. – Rote Listen ausgewählter Tiergruppen Niederösterreichs – 5: 1 - 128.
- Rote Listen ausgewählter Tiergruppen Niederösterreichs Tagfalter (Lepidoptera: Rhopalocera &…Helmut Höttinger, Josef Pennerstorfer (1999): Rote Listen ausgewählter Tiergruppen Niederösterreichs Tagfalter (Lepidoptera: Rhopalocera & Hesperiidae). – unbekannt – 128..
- Hans-Martin Berg, Josef Pennerstorfer, Hannes Seehofer (1997): Teich- und Flußwanderung im Waldviertel. Bericht über die Lanius-Exkursion am 28.September 1997. – Lanius – 06_02-03: 8 - 10.
- Josef Pennerstorfer (1996): Ölkäfer (Meloidae). – Lanius – 06_01: 5 - 6.