Species (15.149)
- Calpionellopsis simplex Colom ()
- Remaniella filipescui Pop
- Tintinnopsella carpathica Murgeanu & Filipescu ()
- Cadosina fusca Wanner 1940 ssp. fusca
- Paramaecium caudatum
- Peridinium lomnickii
- Peridinium bipes
- Peridinium palatinum
- Peridinium aciculiferum
- Peridinium umbonatum
- Peridinium volzii
- Amphisiella procera Foissner, Agatha & Berger 2002
- Balantidium duodeni Stein 1867
- Balantidium elongatum Stein 1867
- Pseudovorticella difficilis Kahl 1933 ssp. difficilis
- Amphisiella namibiensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Amphisiella multinucleata Foissner, Agatha & Berger 2002
- Acineta ferrum ssp. ferrum
- Spathidium seppelti Petz & Foissner 1997
- Spetazoon australis
- Tachysoma granulifera Berger & Foissner 1987
- Amphisiella elegans Foissner, Agatha & Berger 2002
- Thylakidium pituitosus Foissner 1980
- Tintinnidium cylindrata nonZR
- Tracheloraphis longicollis Dragesco 1960
- Amphisiella binucleata Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. multicirrata
- Afrothrix multinucleata Foissner, Agatha & Berger 2002
- Epistylis botrytis Ehrenberg 1831
- Sterkiella nova Foissner & Berger 1999
- Opalina secans Stein 1859
- Strombidium rhyticollare Corliss & Snyder 1986
- Strombidium viride Stein 1867 ssp. viride
- Strongylidium granuliferum Foissner 1987
- Trachelolophos binucleatus Dragesco 1999
- Trachelolophos gigas Foissner & Dragesco 1996
- Tracheloraphis flexuosa Raikov & Kovaleva 1968
- Amphisiella longiseries Foissner, Agatha & Berger 2002
- Afroamphisiella multinucleata Foissner, Agatha & Berger 2002
- Uroleptoides vitiphila Foissner 1987
- Apertospathula inermis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Spirochaeta pallida
- Caenomorpha medusula ssp. dentata
- Enchelaria multinucleata Foissner, Agatha & Berger 2002
- Strobilidium veniliae Montages & Taylor 1994
- Hemiurosoma goertzi Foissner, Agatha & Berger 2002
- Dragescozoon terricola Foissner, Agatha & Berger 2002
- Enchelyodon armatides Foissner, Agatha & Berger 2002
- Holophrya salinarum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Bicoronella costaricana Foissner 1995
- Blepharisma americana Suzuki 1954
- Brachyosoma brachyosoma ssp. mucosa
- Enchelyodon megastoma Foissner, Agatha & Berger 2002
- Colpoda steini Maupas 1883
- Epispathidium polynucleatum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Bursellopsis plankticola nonZR
- Cercaria armata
- Enchelydium blattereri Foissner, Agatha & Berger 2002
- Chilodon campylum
- Dexiostoma campyla Stokes 1886
- Enchelyodon minutus Foissner, Agatha & Berger 2002
- Dileptus armatus Foissner & Schade in Foissner 2000
- Dileptus conspicuus Kahl 1931
- Dopedophrya flexilis
- Enchelyotricha jesnerae Foissner, Agatha & Berger 2002
- Enchelys longitricha Foissner, Agatha & Berger 2002
- Hemiurosoma terricola Foissner, Agatha & Berger 2002
- Holosticha brachysticha Foissner, Agatha & Berger 2002
- Enchelys geleii Foissner 1981
- Epalxis exigua
- Wolfkosia loeffleri Foissner, Agatha & Berger 2002
- Euplotopsis incisa Foissner, Agatha & Berger 2002
- Erimophrya glatzeli Foissner, Agatha & Berger 2002
- Wallackia elegans Foissner, Agatha & Berger 2002
- Etoschophrya oscillatoriophaga Foissner, Agatha & Berger 2002
- Grossglockneria ovata Foissner 1999
- Gonostomum namibiense Foissner, Agatha & Berger 2002
- Etoschothrix terricola Foissner, Agatha & Berger 2002
- Rimostrombidium veniliae Montages & Taylor 1994
- Hemisincirra rariseta Foissner, Agatha & Berger 2002
- Hemisincirra namibiensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Orthodonella shenae Song & Wilbert 2002
- Glaucoma colpoda
- Glaucoma cyclidium Penard 1922
- Glaucoma euplotes
- Condylostoma longicaudata Dragesco 1996
- Eschaneustyla lugeri Foissner, Agatha & Berger 2002
- Holophrya chlorelligera Foissner, Berger & Schaumburg 1999
- Aegyriana paroliva Song & Wilbert 2002
- Tracheloraphis poljanskyi Raikov 1963
- Lacrymaria robusta Vuxanovici 1959
- Heterostentor coeruleus Song & Wilbert 2002
- Frontonia angusta Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. obovata
- Erimophrya arenicola Foissner, Agatha & Berger 2002
- Apertospathula armata Foissner, Agatha & Berger 2002
- Colpodidium microstoma Foissner, Agatha & Berger 2002
- Litonotus antarcticus Song & Wilbert 2002
- Arcuospathidium cultriforme Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. megastoma
- Apourosomoida halophila Foissner, Agatha & Berger 2002
- Metaurostylopsis rubra Song & Wilbert 2002
- Apoenchelys bamforthi Foissner, Agatha & Berger 2002