Species (350)
- Corticocolpoda kaneshiroe Foissner 1993
- Woodrufia spumacola nonZR
- Woordruffia metabolica
- Pseudoglaucoma digitata Bhatia 1936
- Bursaria virens Perty 1852
- Exocolpoda augustini Foissner 1987
- Ilsiella terricola
- Plesiocaryon elongatum Schewiakoff 1892
- Fungiphrya stobili Foissner 1999
- Bursaria caudata Dragesco 1972
- Aristerostoma minuta
- Pentahymena corticola
- Paracondylostoma clavistoma Foissner & Kreutz 1998 ssp. oligostriatum
- Ottowphrya magna Foissner 1993
- Thylakidium pituitosus Foissner 1980
- Dragescozoon terricola Foissner, Agatha & Berger 2002
- Etoschophrya oscillatoriophaga Foissner, Agatha & Berger 2002
- Grossglockneria ovata Foissner 1999
- Maryna namibiensis Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. namibiensis
- Ilsiella elegans Foissner, Agatha & Berger 2002
- Bursaria intestinalis Bloch 1782
- Woodruffides metabolica Johnson & Larson
- Rostrophryides africana Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. etoschensis
- Colpoda cavicola Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. amicronucleata
- Colpoda formisanoi Foissner, Agatha & Berger 2002
- Rostrophrya namibiensis Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. namibiensis
- Kuehneltiella namibiensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Pseudokreyella etoschensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Rostrophrya fenestrata Foissner, Agatha & Berger 2002
- Platyophrya spumacola Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. hexasticha
- Plesiocaryon terricola Foissner, Agatha & Berger 2002
- Parabryophrya etoschensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Maryna namibiensis Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. costaricensis
- Rostrophrya namibiensis Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. maldivensis
- Fungiphrya strobili Foissner 1999
- Platyophrya terricola Foissner 1987
- Ottowphrya dragescoi Foissner 1987
- Rostrophryides africana Foissner 1987 ssp. africana
- Platyophrya spumacola Kahl 1927 ssp. spumacola
- Colpoda cavicola Kahl 1935 ssp. cavicola
- Cirrophrya australis Foissner 1993
- Cirrophrya haptica Gellert 1950
- Cirrophrya terricola Foissner 1987
- Colpoda parvifrons Claparède & Lachmann 1859
- Colpoda patella Kahl 1931
- Colpoda penardi Kahl 1931
- Colpoda pigerrima Cohn 1866
- Colpoda praestans Kahl 1931
- Colpoda pirum Müller 1786
- Colpoda quinquecirrata Gellert 1955
- Colpoda ren Müller 1773
- Colpoda reniformis Kahl 1931
- Colpoda rotunda Foissner 1980
- Colpoda rouxi Kahl 1926
- Colpoda spiralis Novotny, Lynn & Evans 1977
- Colpoda saprophila
- Colpoda steinii Maupas 1883
- Corticocolpoda kaneshiroae Foissner 1993
- Cosmocolpoda naschbergeri Foissner 1993
- Corallocolpoda grelli Foissner 1993
- Corallocolpoda pacifica Alekperov 1991
- Corallocolpoda terricola Foissner 1993
- Colpoda simulans Kahl 1931
- Colpoda steni
- Colpoda striata Müller
- Colpoda tripartita Kahl 1931
- Colpoda triquetra Müller 1786
- Colpoda variabilis Foissner 1980
- Colpoda acuta Buitkamp 1977
- Colpoda aspera Kahl 1926
- Colpoda assimilis Müller 1786
- Colpoda atra Alekperov 1993
- Colpoda californica Kahl 1931
- Colpoda augustini Foissner 1987
- Colpoda bifurcata Alekperov 1993
- Colpoda cavicola Kahl 1935
- Colpoda critina Fromentel 1876
- Colpoda colpidiopsis Kahl 1931
- Colpoda cucullio Müller 1786
- Colpoda cuneus Müller 1786
- Colpoda cucullulus Ehrbg.
- Colpoda discoidea Gellert 1956
- Colpoda discoides Gellert 1956
- Colpoda distincta Smith 1899
- Colpoda duodenaria Taylor & Furgason 1938
- Colpoda dragescoi Chardez 1981
- Colpoda gigas Conn 1905
- Colpoda grandis Smith 1899
- Colpoda inflata Stokes 1884
- Colpoda lamella
- Colpoda irregularis Kahl 1931
- Colpoda lucida Greeff 1888
- Colpoda matritensis Ocariz, Rico & Munoz 1965
- Colpoda magna Gruber 1879
- Colpoda maupasi Enriques 1908
- Colpoda mucronata Müller
- Colpoda minima Alekperov 1985
- Colpoda n.sp.
- Colpoda ochrea Müller
- Colpoda ecaudata Liebmann 1936