Species (15.149)
- Apospathidium terricola Foissner, Agatha & Berger 2002
- Apocolpodidium macrostoma Foissner, Agatha & Berger 2002
- Balantidium coli Malmsten 1857
- Apocolpodidium etoschense Foissner, Agatha & Berger 2002
- Odontochlamys wisconsinensis Kahl 1931
- Peridinium tabulatum Ehrenberg ()
- Apobryophyllum vermiforme Foissner, Agatha & Berger 2002
- Peridinium fuscum
- Peridinium cinctum Ehrenberg
- Pelodinium penardi nonZR
- Apertospathula dioplites Foissner, Agatha & Berger 2002
- Arcuospathidium namibiense Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. namibiense
- Anatoliocirrus capari Özbek & Foissner in FAB 2002
- Vorticella flosculosa
- Maryna namibiensis Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. namibiensis
- Benthontophrys fluviatilis Foissner & Gschwind 1998
- Gastronauta fontzoui Nie Dashu & Ho Yün-Luan 1943
- Dileptus beersi Jones 1956
- Hemiophrys avellens Canella 1960
- Stentor igneus sensu Johnson 1893
- Clavoplites edaphicus Foissner, Agatha & Berger 2002
- Dioplitophrya otti Foissner, Agatha & Berger 2002
- Urceolus cyclostomus Stein ()
- Condylostomides trinucleatus Foissner, Agatha & Berger 2002
- Condylostomides etoschensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Loxophyllum australis Foissner & O'Donoghue 1990
- Colpodidium trichocystiferum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Monodinium balbianii ssp. nanum
- Strombidinopsis minima Gruber 1884
- Ilsiella elegans Foissner, Agatha & Berger 2002
- Urceolus entzii Szabados ()
- Colpodidium horribile Foissner, Agatha & Berger 2002
- Bursaria intestinalis Bloch 1782
- Euplotoides plumipes Stokes 1884
- Coleps hirtus Müller 1786
- Colpodidium bradburyarum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Didinium bosporicum Hovasse 1932
- Woodruffides metabolica Johnson & Larson
- Pseudocohnilembus binucleatus Foissner, Agatha & Berger 2002
- Parapodophrya denticulata Kahl 1931
- Acineta elegans
- Rostrophryides africana Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. etoschensis
- Podophrya tristriata Foissner, Agatha & Berger 2002
- Arcuospathidium etoschense Foissner, Agatha & Berger 2002
- Colpoda cavicola Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. amicronucleata
- Diplites arenicola Foissner, Agatha & Berger 2002
- Amphileptus carchesii ssp. carchesii
- Clavoplites australiensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Bryophyllum paucistriatum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Bryophyllum lingua Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. multistriatum
- Bilamellophrya hawaiiensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Bilamellophrya etoschensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Bakuella granulifera Foissner, Agatha & Berger 2002
- Bilamellophrya australiensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Arcuospathidium novaki Foissner, Agatha & Berger 2002
- Colpoda formisanoi Foissner, Agatha & Berger 2002
- Cyclidium varibonneti Song 2000
- Uroleptus caudatus Stokes 1886
- Rostrophrya namibiensis Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. namibiensis
- Plagiocampa pentadactyla Foissner, Agatha & Berger 2002
- Lamtostyla halophila Foissner, Agatha & Berger 2002
- Phialinides armatus Foissner, Agatha & Berger 2002
- Kuehneltiella namibiensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Spathidium etoschense Foissner, Agatha & Berger 2002
- Urosomoida deserticola Foissner, Agatha & Berger 2002
- Spathidium turgitorum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Pseudouroleptus caudatus Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. namibiensis
- Pseudomonilicaryon angustistoma Foissner, Agatha & Berger 2002
- Pseudomonilicaryon japonicum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Pseudokreyella etoschensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Pseudoholophrya minuta Foissner, Agatha & Berger 2002
- Perisincirra longicirrata Foissner, Agatha & Berger 2002
- Arcuospathidium namibiense Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. tristicha
- Rostrophrya fenestrata Foissner, Agatha & Berger 2002
- Protospathidium namibicola Foissner, Agatha & Berger 2002
- Paradileptus elephantinus
- Epistylis pusilla Schmarda 1850
- Pseudocohnilembus persalinus Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. hexakineta
- Trichophrya epistylides
- Euplotoides woodruffi Gaw 1939
- Urnula epistylides
- Uroleptus paranotabilis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Vorticella rotatoria
- Trachelophyllum pannonicum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Supraspathidium etoschense Foissner, Agatha & Berger 2002
- Trachelophyllum costaricanum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Trachelophyllum africanum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Platyophrya spumacola Foissner, Agatha & Berger 2002 ssp. hexasticha
- Plagiocampides halophilus Foissner, Agatha & Berger 2002
- Enchellyodon elegans
- Plesiocaryon terricola Foissner, Agatha & Berger 2002
- Metacineta namibiensis Foissner, Agatha & Berger 2002
- Lamtostyla decorata Foissner, Agatha & Berger 2002
- Nassula granata Foissner, Agatha & Berger 2002
- Aspidisca major ssp. major
- Paragonostomum caudatum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Aspidisca tetracirrata ssp. tetracirrata
- Paragonostomum multinucleatum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Paragonostomum rarisetum Foissner, Agatha & Berger 2002
- Paragonostomum binucleatum Foissner, Agatha & Berger 2002