Species (161)
- Aproteles bulmerae Menzies, 1977
- Boneia bidens Jentink, 1879
- Cynopterus archipelagus Taylor, 1934
- Casinycteris argynnis Thomas, 1910
- Cynopterus brachyotis (Muller, 1838)
- Dobsonia inermis K. Andersen, 1909
- Dobsonia pannietensis (De Vis), 1905)
- Dobsonia remota Cabrera, 1920
- Dyacopterus spadiceus (Thomas, 1890)
- Eidolon helvum (Kerr, 1792)
- Eonycteris rosenbergi (Jentink, 1899)
- Eonycteris spelaea (Dobson, 1871)
- Epomophorus crypturus Peters, 1852
- Epomophorus gambianus (Ogilby, 1835)
- Epomophorus pousarguesi Trouessart, 1904
- Epomops buettikoferi (Matschie, 1899)
- Epomophorus reii Aellen, 1950
- Epomophorus minor Dobson, 1880
- Haplonycteris fischeri Lawrence, 1939
- Harpyionycteris whiteheadi Thomas, 1896
- Macroglossus sobrinus K. Andersen, 1911
- Macroglossus minimus (E. Geoffroy, 1810)
- Megaerops kusnotoi Hill & Beckon, 1978
- Megaerops wetmorei Taylor, 1934
- Melonycteris melanops Dobson, 1877
- Megaloglossus woermanni Pagenstecher, 1885
- Melonycteris woodfordi (Thomas, 1887)
- Micropteropus pusillus (Peters, 1867)
- Myonycteris torquata (Dobson, 1878)
- Pteropus anetianus Gray, 1870
- Acerodon humilis K. Andersen, 1909
- Acerodon celebensis (Peters, 1867)
- Acerodon mackloti (Temminck, 1837)
- Alionycteris paucidentata Kock, 1969
- Cynopterus horsfieldi Gray, 1843
- Cynopterus sphinx (Vahl, 1797)
- Dobsonia exoleta K. Andersen, 1909
- Dobsonia crenulata K. Andersen, 1909
- Dobsonia moluccensis (Quoy & Gaimard, 1830)
- Dobsonia praedatrix K. Andersen, 1909
- Epomops dobsoni (Bocage, 1899)
- Pteropus niger (Kerr, 1792)
- Pteropus nitendiensis Sanborn, 1930
- Pteropus ornatus Gray, 1870
- Pteropus pilosus K. Andersen, 1908
- Pteropus personatus Temminck, 1825
- Pteropus poliocephalus Temminck, 1825
- Pteropus pohlei Stein, 1933
- Pteropus pselaphon Lay, 1829
- Pteropus rayneri Gray, 1870
- Pteropus samoensis Peale, 1848
- Pteropus rodricensis Dobson, 1878
- Pteropus tablasi Taylor, 1934
- Pteropus temmincki Peters, 1867
- Pteropus tonganus Quoy & Gaimard, 1830
- Pteropus tuberculatus Peters, 1869
- Pteropus vetulus Jouan, 1863
- Pteropus woodfordi Thomas, 1888
- Rousettus aegyptiacus (E. Geoffroy, 1810)
- Rousettus celebensis K. Andersen, 1907
- Rousettus angolensis (Bocage, 1898)
- Rousettus madagascariensis G. Grandidier, 1928
- Rousettus leschenaulti (Desmarest, 1820)
- Rousettus obliviousus Kock, 1978
- Scotonycteris ophiodon Pohle, 1943
- Styloctenium wallacei (Gray, 1866)
- Scotonycteris zenkeri Matschie, 1894
- Syconycteris australis (Peters, 1867)
- Hypsignathus monstrosus H. Allen, 1861
- Latidens salimalii Thonglongya, 1972
- Micropteropus intermedius Hayman, 1963
- Myonycteris relicta Bergmans, 1980
- Notopteris macdonaldi Gray, 1859
- Nyctimene cyclotis K. Andersen, 1910
- Nyctimene cephalotes (Pallas, 1767)
- Nyctimene albiventer (Gray, 1863)
- Nyctimene draconilla Thomas, 1922
- Nyctimene minutus K. Andersen, 1910
- Nyctimene malaitensis Phillips, 1968
- Otopteropus cartilagonodus Kock, 1969
- Nyctimene sanctacrucis Troughton, 1931
- Penthetor lucasi (Dobson, 1880)
- Pteralopex acroconta Hill & Beckon, 1978
- Ptenochirus jagori (Peters, 1861)
- Pteralopex anceps K. Andersen, 1909
- Pteropus admiralitatum Thomas, 1894
- Pteropus alecto Temminck, 1837
- Pteropus argentatus Gray, 1844
- Pteropus caniceps Gray, 1870
- Pteropus balutus Hollister, 1913
- Pteropus conspicillatus Gough, 1850
- Pteropus fundatus Felten & Kock, 1972
- Pteropus dasymallus Temminck, 1825
- Pteropus griseus (E. Geoffroy, 1810)
- Pteropus giganteus (Brunnich, 1782)
- Pteropus leucopterus Temminck, 1853
- Pteropus howensis Troughton, 1931
- Pteropus hypomelanus Temminck, 1853
- Pteropus leucotis Sanborn, 1950
- Pteropus livingstonei Gray, 1866