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- Carl Gottfried Semper (1891): Beobachtungen aus den Aquarien des neuen zoologischen Instituts – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 10: 14 - 36.
- Carl Gottfried Semper (1888): Ueber Brock's Ansichten über Entwickelung des Mollusken- Genitalsystems. – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 8: 213 - 222.
- Carl Gottfried Semper (1887): 2. Anzeige – Zoologischer Anzeiger – 10: 245.
- Carl Gottfried Semper (1885): Zoologie und Anatomie – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 7: 29 - 40.
- Carl Gottfried Semper (1882): Herr Professor Fürbringer als Philosoph. – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 5: 93 - 119.
- Carl Gottfried Semper (1882): 1. Bemerkungen zu Herrn Dr. Riehm's Notiz "Eine neue Methode der Trockenpräparation." Zool. Anz. No. 100 – Zoologischer Anzeiger – 5: 144 - 146.
- Carl Gottfried Semper, C. R. Osten Sacken (1881): Diptera from the Philippine Islands (Fortsetzung aus Bd. XXVI Heft I ) – Berliner Entomologische Zeitschrift – 26: 187 - 252.
- Carl Gottfried Semper, C. R. Osten Sacken (1881): Diptera from the Philippine Islands – Berliner Entomologische Zeitschrift – 26: 83 - 120.
- Carl Gottfried Semper (1880): Einige Bemerkungen über den Kalksack des Samenleiters der Zonitiden. – Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft – 12: 8 - 12.
- Carl Gottfried Semper (1880): Anatomische Beschreibung von Caracollus marginella. – Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft – 12: 37 - 40.
- Carl Gottfried Semper (1880): Anatomische Beschreibung von Helicophanta maguifica Fer, – Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft – 12: 60 - 61.
- Carl Gottfried Semper (1878): Ueber die Lunge von Birgus latro. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 30: 282 - 287.
- Carl Gottfried Semper (1878): Reisen im Archipel der Philippinen – Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft – 10: 154 - 155.
- Carl Gottfried Semper (1878): Ueber eine Methode, Axolotl-Eier jederzeit zu erzeugen – Zoologischer Anzeiger – 1: 176 - 179.
- Carl Gottfried Semper (1878): Sind die Segmentalorgane der Anneliden homolog mit denen der Wirbelthiere ? Eine Erwiderung an Herrn Dr. Fürbringer – Gegenbaurs Morphologisches Jahrbuch - Eine Zeitschrift für Anatomie und Entwicklungsgeschichte – 4: 322 - 327.
- Carl Gottfried Semper (1877-1878): Beiträge zur Biologie der Oligochaeten. – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 4: 65 - 112.
- Carl Gottfried Semper (1876-1877): Die Verwandtschaftsbeziehungen der gegliederten Thiere. – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 3: 115 - 404.
- Carl Gottfried Semper (1876-1877): Einige Bemerkungen über die "Nephropneusten" v. Ihering's. – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 3: 480 - 488.
- Der Haeckelismus in der ZoologieCarl Gottfried Semper (1876): Der Haeckelismus in der Zoologie – Mauke's Söhne, Hamburg – : 1 - 36.
- Carl Gottfried Semper (1875): Das Urogenitalsystem der Plagiostomen und seine Bedeutung für das der übrigen Wirbelthiere. – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 2: 195 - 509.
- Carl Gottfried Semper (1875): Ueber die Entstehung der geschichteten Cellulose-Epidermis der Ascidien. – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 2: 1 - 24.
- Carl Gottfried Semper (1875): Die Stammesverwandtschaft der Wirbelthiere und Wirbellosen. – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 2: 25 - 76.
- Carl Gottfried Semper (1875): Ueber die Götte'sche Discontinuitätslehre des organischen Lebens. – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 2: 167 - 192.
- Carl Gottfried Semper (1874): Kurze anatomische Bemerkungen über Comatula – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 1: 259 - 263.
- Carl Gottfried Semper (1874): Ueber die Wachsthums- Bedingungen des Lymnaeus stagnalis. – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 1: 137 - 167.
- Carl Gottfried Semper (1874): Kritische Gänge. - Fortsetzung – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 1: 208 - 238.
- Carl Gottfried Semper (1874): Ueber Pycnogoniden und ihre in Hydroiden schmarotzenden Larvenformen. – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 1: 264 - 286.
- Carl Gottfried Semper (1874): Das zoologisch-zootomische Institut der Universität Würzburg – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 1: 1 - 8.
- Carl Gottfried Semper (1874): Kritische Gänge – Arbeiten aus dem Zoologisch-Zootomischen Institut in Würzburg – 1: 73 - 82.
- Carl Gottfried Semper (1872): Ueber Stoliczka – Malakozoologische Blätter – 19: 177 - 183.
- Carl Gottfried Semper (1872): Zoologische Aphorismen. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 22: 305 - 322.
- Carl Gottfried Semper (1872): Über Generationswechsel bei Steinkorallen und über das M. Edwards`sche Wachstthumsgesetz der Polypen. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 22: 235 - 280.
- David Friedrich Heynemann, Carl Gottfried Semper (1871): Die Kiefer vou Philomyens carolinensis Bosc und australis Bergh. – Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft – 3: 1 - 2.
- Carl Gottfried Semper (1871): Australische Tesstacelliden. – Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft – 3: 124 - 125.
- Carl Gottfried Semper (1870): Rhytida Strangei eine Testacellide. – Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft – 2: 102 - 103.
- Carl Gottfried Semper (1870): Hoffentlich zum letzten Mal Rhytida inaequalis. – Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft – 2: 41 - 42.
- Carl Gottfried Semper (1869): Zur Anatomie der Glandina algira. Brug. – Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft – 1: 80 - 81.
- Carl Gottfried Semper (1869): Eine neue Testacellidengattung in Australien, – Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft – 1: 170 - 171.
- Carl Gottfried Semper (1869): Nochmals Rhytida inaequalis. – Nachrichtsblatt der Deutschen Malakozoologischen Gesellschaft – 1: 218.
- Carl Gottfried Semper (1869): Eine neue Testacellidengattung in Australien. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 19: 625 - 626.
- Carl Gottfried Semper (1868): Ophiocrinus, eine neue Comatuliden-Gattung. – Archiv für Naturgeschichte – 34-1: 68 - 69.
- Carl Gottfried Semper (1867): Einige Worte über Euplectella aspergillum Owen und seine Bewohner. – Archiv für Naturgeschichte – 33-1: 84 - 89.
- Carl Gottfried Semper (1866-1867): Ueber einige tropische Larvenformen. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 17: 407 - 428.
- Carl Gottfried Semper (1864): Reisebericht – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 14: 417 - 426.
- Carl Gottfried Semper (1863): Reisebericht – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 13: 558 - 570.
- Heinrich Dohrn, Carl Gottfried Semper (1862): Neue Landschnecken – Malakozoologische Blätter – 9: 205 - 208.
- Carl Gottfried Semper (1861-1862): Kleinere Mittheilungen. Reisebericht des Herrn Dr. Semper. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 11: 100 - 108.
- Carl Gottfried Semper (1859-1860): Kleinere Mittheilungen und Correspondenz-Nachrichten. Reiseberichte des Herrn Dr. Carl Semper. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 10: 179 - 182.
- Carl Gottfried Semper (1858): Zoologische Notiz. – Archiv für Naturgeschichte – 24-1: 209 - 210.
- Carl Gottfried Semper (1857-1858): Zur Anatomie und Entwickelungsgeschichte der Gattung Myzostoma Leuckart. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 9: 48 - 64.
- Carl Gottfried Semper (1857-1858): Nachschrift – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 9: 146.
- Carl Gottfried Semper (1857-1858): Ueber die Entwickelung der Eucharis multicornis. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 9: 234 - 239.
- Carl Gottfried Semper (1857-1858): Zum feineren Baue der Molluskenzunge. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 9: 270 - 283.
- Carl Gottfried Semper (1856-1857): Beiträge zur Anatomie und Physiologie der Pulmonaten. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 8: 340 - 399.
- Carl Gottfried Semper (1856-1857): Ueber die Bildung der FIügel, Schuppen and Haare bei den Lepidopteren. – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 8: 326 - 339.