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- Heinz Quitt zum 90. GeburtstagUwe Wegener, Hans-Ulrich Kison, Otfried Wüstemann (2018): Heinz Quitt zum 90. Geburtstag – Abhandlungen und Berichte aus dem Museum Heineanum – 11_2018: 147 - 151.
- Vegetationswandel des Berggrünlands nach Untersuchungen von 1954 bis 2016 - Wege zur Erhaltung…Uwe Wegener (2018): Vegetationswandel des Berggrünlands nach Untersuchungen von 1954 bis 2016 - Wege zur Erhaltung der Bergwiesen Mountain grasslands vegetation change after research from 1954 to 2016 - ways to preserve mountain meadows – Abhandlungen und Berichte aus dem Museum Heineanum – 11_2018: 35 - 101.
- Uwe Wegener (2015): Untersuchungen zur Förderung von Diptam (Dictamus albus L.) im Nordharzvorland – Braunschweiger Geobotanische Arbeiten – 11: 53 - 60.
- Gunter Karste, Uwe Wegener, Hans-Ulrich Kison (2014): Die Vegetationskarte des Nationalparks Harz (Niedersachsen, Sachsen-Anhalt) und einige Auswertungsmöglichkeiten – Tuexenia - Mitteilungen der Floristisch-soziologischen Arbeitsgemeinschaft – NS_34: 71 - 88.
- Uwe Wegener, Gunter Karste (2011): Das „Wernigeröder Modell“ - Zusammenarbeit der Naturschutzverbände auf Landkreisebene einst und heute – Naturhistorica - Berichte der Naturhistorischen Gesellschaft Hannover – 153: 181 - 186.
- Günther Hamel, Uwe Wegener (2011): Der Arbeitskreis zum Schutz und zur Beobachtung heimischer Orchideen im Kulturbund der DDR – Pulsatilla - Zeitschrift für Botanik und Naturschutz – 10: 25 - 34.
- Erinnerungen an Norbert WišniewskiUwe Wegener (2011): Erinnerungen an Norbert Wišniewski – Pulsatilla - Zeitschrift für Botanik und Naturschutz – 10: 21 - 34.
- Heinz Quitt zum 80. GeburtstagHans-Ulrich Kison, Uwe Wegener (2009): Heinz Quitt zum 80. Geburtstag – Abhandlungen und Berichte aus dem Museum Heineanum – 8_2009: 129 - 134.
- Heino John, Uwe Wegener (2009): Zur aktuellen Verbreitung von Gagea bohemica (ZAUSCHN.) SCHULT. & SCHULT. f. in Sachsen-Anhalt – Mitteilungen zur floristischen Kartierung in Sachsen-Anhalt – 14: 55 - 63.
- Vorkommen und Erhaltungsmaßnahmen für die Sand-Silberscharte Jurinea cyanoides (L. ) Rchb. im…Uwe Wegener, Hagen Herdam (2009): Vorkommen und Erhaltungsmaßnahmen für die Sand-Silberscharte Jurinea cyanoides (L.) Rchb. im Nordharz-Vorland Occurences and preservation measures for the Jurinea Jurinea cyanoides (L.) Rchb. in the northern Harz Foreland – Abhandlungen und Berichte aus dem Museum Heineanum – 8_2009: 1 - 10.
- Uwe Wegener (2007): Die Entwicklung der Wiesen-Kuhschelle (Pulsatilla pratensis L.) MILL. im Nordharzvorland nach Pflegemaßnahmen in den Jahren 1996-2006 – Pulsatilla - Zeitschrift für Botanik und Naturschutz – 9: 29 - 36.
- Volker Lüderitz, Uta Langheinrich, Christian Kunz, Uwe Wegener (2006): Die Ecker - Referenzgewässer für den grobmaterialreichen, silikatischen Mittelgebirgsbach The Ecker - A reference for the stream type: small coarse substrate dominated siliceous highland rivers – Abhandlungen und Berichte aus dem Museum Heineanum – 7_2006: 95 - 112.
- Uwe Wegener (2006): Grundlagen der botanischen Forschung im Nationalpark - Rückblick und Ausblick – Abhandlungen und Berichte aus dem Museum Heineanum – SH_7_1: 45 - 58.
- Uwe Wegener, Gunter Karste (2003): Sukzessionsuntersuchungen bei der Anlage, während des Betriebs und nach Auflassung eines Mattengartens im Hochharz – Hercynia – 36: 197 - 216.
- Gunter Karste, Rudolf Schubert, Uwe Wegener (2003): Die Wiederbesiedelung vegetationsfreier Flächen im Brockengebiet im Nationalpark Hochharz – Hercynia – 36: 217 - 233.
- Uwe Wegener, Hans-Ulrich Kison (2002): Die Vegetation des Brockens im Nationalpark Hochharz (Exkursion G) – Tuexenia - Mitteilungen der Floristisch-soziologischen Arbeitsgemeinschaft – NS_22: 243 - 267.
- Uwe Wegener (2002): Botanische Kostbarkeiten in Deutschland: Das Kleine Zweiblatt (Listera cordata (L.) R. BR. – Pulsatilla - Zeitschrift für Botanik und Naturschutz – 5: 51 - 57.
- Dieter Frank, Uwe Wegener, Friedrich Ebel (2002): Prof. Dr. Rudolf Schubert zum 75. Geburtstag – Hercynia – 35: 145 - 146.
- Uwe Wegener, Wolfgang Eberspach (2000): Die Populationsdynamik einiger Orchideenarten von Waldrandökotonen des Huy nach Pflegeeingriffen – Mitteilungen zur floristischen Kartierung in Sachsen-Anhalt – 5: 199 - 210.
- Uwe Wegener (1998): Nachweise zur Flora Sachsen-Anhalts 2. Mitteilung – Mitteilungen zur floristischen Kartierung in Sachsen-Anhalt – 3: 133 - 143.
- Uwe Wegener (1997): Entwicklungsnationalparke im Harz Schutzziele, Perspektiven, Chancen – Berichte der Naturhistorischen Gesellschaft Hannover – 139: 19 - 30.
- Feuereinsatz zur Pflege von TrockenrasenUwe Wegener (1997): Feuereinsatz zur Pflege von Trockenrasen – NNA-Berichte – 10_5_1997: 54 - 58.
- Uwe Wegener (1997): Nachweise zur Flora Sachsen-Anhalts – Mitteilungen zur floristischen Kartierung in Sachsen-Anhalt – 2: 39 - 52.
- Uwe Wegener, Wolfgang Eberspach (1996): Die Wiesenkuhschelle Pulsatilla pratensis (L.) MILL. im Nordharzvorland - ihre Förderung durch Pflegemaßnahmen – Mitteilungen zur floristischen Kartierung in Sachsen-Anhalt – 1: 22 - 27.
- Ökologie. 2. Aufl.Uwe Wegener (1991): Ökologie. 2. Aufl. – Fischer Verl., Jena – : 1 - 415.
- Uwe Wegener, Rudolf Schubert, Gerrit Stohr, Friedrich Ebel (1990): 100 Jahre Brockengarten – Hercynia – 27: 309 - 325.
- Die Vitalität der aus verschiedenen Larvenformen hervorgegangene Adulten von Mocydia crocera (H.…Uwe Wegener (1988): Die Vitalität der aus verschiedenen Larvenformen hervorgegangene Adulten von Mocydia crocera (H.S.)(Homoptera Auchenorrhyncha: Cicadellidae) bei der Überwinterung – Zool. Jb. Syst. – 115: 117 - 127.
- Uwe Wegener, Lutz Reichhoff (1989): Zustand, Entwicklungstendenzen und Pflege der Bergwiesen – Hercynia – 26: 190 - 198.
- Schutz von Waldorchideen durch BiotoppflegeUwe Wegener (1988): Schutz von Waldorchideen durch Biotoppflege – Veröffentlichungen der Museen der Stadt Gera - Naturwissenschaftliche Reihe – 15: 9.
- Uwe Wegener (1988): Wasserspeicher im Thüringer Becken ihre Verteilung und Iandeskulturelie Gestaltung – Hercynia – 25: 377 - 385.
- Über die Vitalität der Larvenformen der Jasside Mocydia crocea (H. -S. )(Homoptera…Uwe Wegener (1987): Über die Vitalität der Larvenformen der Jasside Mocydia crocea (H.-S.)(Homoptera Auchenorrhyncha) und ihre ökologische Bedeutung – Zool. Jb. Syst. – 114: 105 - 129.
- Bestimmung wirbelloser Tiere im GeländeUwe Wegener (1985): Bestimmung wirbelloser Tiere im Gelände – Fischer Verl., Jena – : 1 - 180.
- Die Begründung der Ökologie als Lehre vom Haushalt der Natur durch Ernst HaeckelUwe Wegener (1985): Die Begründung der Ökologie als Lehre vom Haushalt der Natur durch Ernst Haeckel – Biol. Rdsch. – 23: 337 - 343.
- Bioindikation zur Verminderung von Stickstoffdüngerverlusten und der Stickstoffbelastung von…Uwe Wegener (1983): Bioindikation zur Verminderung von Stickstoffdüngerverlusten und der Stickstoffbelastung von Gewässern – Acta hydrochim. hydrobiol. – 11(3): 279 - 293.
- Margarete Müller, Uwe Wegener (1975): Floristische Neufunde im Nordharz und Vorland – Naturkundliche Jahresberichte des Museum Heineanum – 10_1975: 21 - 24.
- Margarete Müller, Uwe Wegener (1973): Floristische Neufunde im Nordharz und Vorland – Naturkundliche Jahresberichte des Museum Heineanum – 8_1973: 5 - 7.
- Uwe Wegener, Erhard Beuschold, Klaus Dörter (1974): Zur Problematik des Phosphoreintrages in Trinkwassertalsperren unter besonderer Berücksichtigung von Untersuchungen im Gebiet der Ostharztalsperren – Hercynia – 11: 185 - 200.
- Margarete Müller, Uwe Wegener (1972): Floristische Neufunde im Harz und Vorland – Naturkundliche Jahresberichte des Museum Heineanum – 7_1972: 17 - 19.
- Uwe Wegener (1972): Zur Verbreitung des Moor-Klees (Trifolium spadiceum L.) im Nordharz – Naturkundliche Jahresberichte des Museum Heineanum – 7_1972: 5 - 9.
- Margarete Müller, Uwe Wegener (1970): Floristische Neufunde im Nordharz und Vorland – Naturkundliche Jahresberichte des Museum Heineanum – 5-6_1971: 13 - 15.
- Uwe Wegener (1969): Das Sumpf-Blutauge (Comarum palustre L) im Harz (DDR) – Naturkundliche Jahresberichte des Museum Heineanum – 4_1969: 11 - 20.
- Uwe Wegener (1968): Floristische Neufunde im Nordharz und Vorland – Naturkundliche Jahresberichte des Museum Heineanum – 3_1968: 5.
- Uwe Wegener (1968): Neuer Nachweis einer Strandlingsgesellschaft (Littorelletum uniflora KNAPP 1948) am Oberen Kiliansteich im Harz – Naturkundliche Jahresberichte des Museum Heineanum – 3_1968: 6 - 7.
- Uwe Wegener (1968): Verbreitung, Standorte und Einschätzung von Poa chaixii VILL., des Berg-Rispengrases, im Nordharz – Naturkundliche Jahresberichte des Museum Heineanum – 3_1968: 8 - 14.
- Uwe Wegener (1967): Standortansprüche und Verbreitung von Meum athamanticum JACQ. im Harz – Naturkundliche Jahresberichte des Museum Heineanum – 2_1967: 13 - 17.
- Uwe Wegener (1967): Siedlungsdichte der Vögel auf Kontrollflächen am Westrand der Magdeburger Börde – Naturkundliche Jahresberichte des Museum Heineanum – 2_1967: 49 - 66.