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Emmerich Ráthay (1899): Über eine Bakteriose von Dactylis glomerata L. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 108: 597 - 602.- Zur Biologie der Reblaus.
Emmerich Ráthay (1893): Zur Biologie der Reblaus. – Klosterneuburg, ökol.-pomol. Lehranst. – : 15 - 47. 
Emmerich Ráthay (1891): Über eine merkwürdige durch den Blitz an Vitis vinifera hervorgerufene Erscheinung. (Mit 2 Tafeln.) – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 58: 585 - 610.
Emmerich Ráthay (1889): Das Auftreten der Gallenlaus im Versuchsweingarten zu Klosterneuburg im Jahre 1887. (Tafel 2-3) – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 39: 47 - 88.
Emmerich Ráthay (1883): Untersuchungen über die Spermogonien der Rostpilze. – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 46_2: 1 - 51.
Emmerich Ráthay, B. Haas (1883): Über Phallus impudicus (L.) und einige Coprinus-Arten. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 87: 18 - 44.- Über Phallus impudicus (L. ) und einige Coprinus-Arten. 1 Tab.Emmerich Ráthay, B. Haas (1883): Über Phallus impudicus (L.) und einige Coprinus-Arten. 1 Tab. – SB. Akad. Wissensch. Wien – 87(1): 18 - 44.
Emmerich Ráthay (1882): Ueber einige autoecische und heteroecische Uredineen. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 31: 11 - 16.
Emmerich Ráthay (1882): Ueber das Eindringen der Sporidien-Keimschläuche der Puccinia Malvacearum Mont. in die Epidermiszellen der Althaea rosea. (Tafel 1) – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 31: 9 - 10.
Emmerich Ráthay (1881): Über die Hexenbesen der Kirschbäume und über Exoascus Wiesneri n. sp. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 83: 267 - 288.
Emmerich Ráthay (1881): Über Austrocknungs- und Imbibitionserscheinungen der Cynareen-Involucren. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 83: 522 - 533.
Emmerich Ráthay (1880): Über nectarabsondernde Trichome einiger Melampyrumarten. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 81: 55 - 77.
Emmerich Ráthay (1878): Über die von Exoascus-Arten hervorgerufene Degeneration der Laubtriebe einiger Amygdaleen. – Sitzungsberichte der Akademie der Wissenschaften mathematisch-naturwissenschaftliche Klasse – 77: 67 - 82.
Emmerich Ráthay (1876): Die fleischfressenden Pflanzen. – Schriften des Vereins zur Verbreitung naturwissenschaftlicher Kenntnisse Wien – 16: 561 - 584.
