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- Friedrich Maurer (1921): Jahresbericht der Medizinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena für das Jahr 1919 – Jenaische Zeitschrift für Naturwissenschaft – NF_50: 1 - 13.
- Friedrich Maurer (1914): Ernst Haeckel und die Biologie. Festrede zur Feier von Ernst Haeckels 80. Geburtstag (16. Februar 1914) – Jenaische Zeitschrift für Naturwissenschaft – NF_44: 549 - 568.
- Friedrich Maurer (1913): Die ventrale Rumpfmuskulatur der Fische (Selachier, Ganoiden, Teleostier, Crossopterygier, Dipnoer). – Jenaische Zeitschrift für Naturwissenschaft – NF_42: 1 - 118.
- Friedrich Maurer (1911): Die ventrale Rumpfmuskulatur von Menobranchus, Menopoma und Amphiuma, verglichen mit den gleichen Muskeln anderer Urodelen. – Jenaische Zeitschrift für Naturwissenschaft – NF_40: 1 - 42.
- Friedrich Maurer (1910): Jahresbericht der Medizinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena für das Jahr 1908 – Jenaische Zeitschrift für Naturwissenschaft – NF_39: 285 - 300.
- Friedrich Maurer (1896): Die ventrale Rumpfmuskulatur einiger Reptilien. Eine vergleichend-anatomische Untersuchung – Festschrift zum siebzigsten Geburtstage von Carl Gegenbaur – 1: 181 - 258.
- Nachruf an Dr. Anton Ausserer.Friedrich Maurer (1890): Nachruf an Dr. Anton Ausserer. – Programm des k. k. zweiten Staatsgymnasiums in Graz – 1890: 33 - 40.
- Friedrich Maurer (1834): Die Ventrale Rumpfmuskulatur einiger Reptilien. Eine vergleichend-anatomische Untersuchung – Monografien Zoologie Gemischt – 0046: 181 - 257.