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- Peter Kaufmann, Patrick Gros, Helmut Wittmann, Georg Pflugbeil, Peter Pilsl, Günther Nowotny, Stefan Kwitt, Jakob Pöhacker, Thomas Rücker, Martin Kyek, Thomas Zuna-Kratky, Fiona Bergmann, Tobias Seifert, Charlotte Kraus, Robert Lindner (2023): Der Bioblitz Salzburg 2021 auf Observation.org – eine Citizen Science Bestandserfassung der urbanen Biodiversität Salzburgs – Mitteilungen aus dem Haus der Natur Salzburg – 28: 5 - 20.
- Oliver Stöhr, Andreas Berger, Jürgen Baldinger, Michael Hohla, Christoph Langer, Hedwig Meindl, Karin Moosbrugger, Georg Pflugbeil, Peter Pilsl, Norbert Sauberer, Ralf Schwab, Michael Thalinger, Harald Gustav Zechmeister, Christian Gilli (2021): Cyrtomium fortunei, Onoclea sensibilis und Osmunda regalis neu für Österreich sowie eine aktualisierte Übersicht neophytischer Gefäßkryptogamen Österreichs – Neilreichia - Zeitschrift für Pflanzensystematik und Floristik Österreichs – 12: 105 - 144.
- Helmut Wittmann, Peter Pilsl, Georg Pflugbeil, Peter Kaufmann (2020): On the road again – die „neue“ Floristische Kartierung im Bundesland Salzburg, dargestellt an einigen Vertretern der Straßenrandflora – Mitteilungen aus dem Haus der Natur Salzburg – 26: 104 - 130.
- Georg Pflugbeil, Peter Pilsl, Susanne Popp-Kohlweiss (2019): Dactylis polygama, Hippophae rhamnoides ssp. fluvatilis, Phyteuma ovatum, Rosa sherardii und Trifolium thalii: neu bzw. wiederentdeckt im Bundesland Salzburg, sowie weitere Besonderheiten der indigenen Flora – Mitteilungen aus dem Haus der Natur Salzburg – 25: 71 - 93.
- Oliver Stöhr, Peter Pilsl (2018): Vorarbeiten an einer Liste der Gefäßpflanzen des Bundeslandes Salzburg, Teil 2: Übersicht der im Land Salzburg bisher nachgewiesenen Taraxacum-Arten mit neuen Fundmeldungen – Neilreichia - Zeitschrift für Pflanzensystematik und Floristik Österreichs – 9: 11 - 48.
- Dieter Reich, Thomas Barta, Peter Pilsl, Ruth Sander (2018): Beiträge zur Kenntnis der Gattung Vulpia (Poaceae) in Österreich mit besonderer Berücksichtigung von Vulpia ciliata, neu für Wien und Niederösterreich – Neilreichia - Zeitschrift für Pflanzensystematik und Floristik Österreichs – 9: 247 - 267.
- Helmut Wittmann, Peter Pilsl, Ingeborg Pauline Illich (2014): Die Blauflüglige Sandschrecke (Sphingonotus caerulans) - eine weitere neue wärmeliebende Heuschreckenart im Bundesland Salzburg – Articulata - Zeitschrift der Deutschen Gesellschaft für Orthopterologie e.V. DGfO – 29_2014: 51 - 63.
- Georg Pflugbeil, Peter Pilsl (2013): Vorarbeiten an einer Liste der Gefäßpflanzen des Bundeslandes Salzburg, Teil 1: Neophyten. – Mitteilungen aus dem Haus der Natur Salzburg – 21: 25 - 83.
- Peter Pilsl, Georg Pflugbeil (2012): Nachträge zur Neophytenflora der Stadt Salzburg, I. – Mitteilungen aus dem Haus der Natur Salzburg – 20: 5 - 15.
- Oliver Stöhr, Peter Pilsl, Markus Staudinger, Gerhard Kleesadl, Franz Essl, Thorsten Englisch, Albin Lugmair, Helmut Wittmann (2012): Beiträge zur Flora von Österreich, IV – Stapfia – 0097: 53 - 136.
- Patrick Gros, Kristina Bauch, Wilhelm Foissner, Ernst Heiss, Michaela Hierschläger, Robert Lindner, Till R. Lohmeyer, Christine Medicus, Wolfgang Neuner, Anke Oertel, Heidelinde Sofie Pfleger, Peter Pilsl, Oliver Stöhr, Claudia Taurer-Zeiner, Roman Türk, Helmut Wittmann (2012): Nationalpark Hohe Tauern, Seidlwinkltal (Rauris, Salzburg) - GEO-Tag der Artenvielfalt. – Abhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Österreich – 38: 1 - 70.
- Peter Pilsl (2011): Bibliographie der botanischen Literatur über das Land Salzburg. Teil 2 von 1981 bis 2010. – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 19: 1 - 721.
Oliver Stöhr, Susanne Gewolf, Peter Pilsl (2010): Ergänzende Mitteilungen: Eine neue Pflanzensammlung am Haus der Natur. – Mitteilungen aus dem Haus der Natur Salzburg – 18: 103 - 107.
Michael Kurz, Patrick Gros, Marion E. Kurz, Peter Pilsl, Oliver Stöhr (2010): Neozoa in Salzburg (Insecta: Hymenoptera, Hemiptera, Lepidoptera). – Mitteilungen aus dem Haus der Natur Salzburg – 18: 63 - 66.- Helmut Wittmann, Oliver Stöhr, Peter Pilsl, Susanne Gewolf (2009): Das Gletschervorfeld der Pasterze – Tuexenia - Mitteilungen der Floristisch-soziologischen Arbeitsgemeinschaft – BH_2_2009: 147 - 193.
Oliver Stöhr, Peter Pilsl, Franz Essl, Helmut Wittmann, Michael Hohla (2009): Beiträge zur Flora von Österreich, III – Linzer biologische Beiträge – 0041_2: 1677 - 1755.- Susanne Gewolf, Christian Schröck, Roland Kaiser, Oliver Stöhr, Peter Pilsl, Günther Nowotny (2008): Neophyten Flora der stadt Salzburg – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 16: 246 - 250.
- Susanne Gewolf, Christian Schröck, Roland Kaiser, Oliver Stöhr, Peter Pilsl, Günther Nowotny (2008): Neophytenflora der Stadt Salzburg (Österreich) – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 17: 1 - 596.
Oliver Stöhr, Peter Pilsl, Franz Essl, Michael Hohla, Christian Schröck (2007): Beiträge zur Flora von Österreich, II * – Linzer biologische Beiträge – 0039_1: 155 - 292.
Christian Schröck, Peter Pilsl, Oliver Stöhr, Günther Nowotny (2006): Zum aktuellen Vorkommen ausgewählter, vorwiegend archäophytischer Gefäßpflanzen in der Stadt Salzburg. - In: STÜBER Eberhard, Salzburg (2006), Mitteilungen aus dem Haus der Natur XVII. Folge. – Mitteilungen aus dem Haus der Natur Salzburg – 17: 25 - 49.
Christian Schröck, Oliver Stöhr, Peter Pilsl (2006): Zum Vorkommen der Gattung Chamaesyce (Euphorbiaceae) im Bundesland Salzburg (Österreich) – Neilreichia - Zeitschrift für Pflanzensystematik und Floristik Österreichs – 4: 131 - 137.- Christian Schröck, Peter Pilsl, Robert Krisai, Johann Peter Gruber (2004): Bryofloristische Untersuchungen im Wildgerlostal (Nationalpark Hohe Tauern, Salzburg, Österreich) – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 13: 365 - 428.
Oliver Stöhr, Peter Pilsl, Christian Schröck, Günther Nowotny, Roland Kaiser (2004): Neue Gefäßpflanzenfunde aus Salzburg.- In: STÜBER Eberhard, Salzburg (2004), Mitteilungen aus dem Haus der Natur XVI. Folge. – Mitteilungen aus dem Haus der Natur Salzburg – 16: 46 - 64.- Peter Pilsl, Oliver Stöhr, Christian Eichberger (2004): Berichtigungen und Ergänzungen zu aktuellen Publikationen über die Phanerogamenflora von Salzburg – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 13: 339 - 346.
- Christian Schröck, Peter Pilsl, Oliver Stöhr, Günther Nowotny, Albin Blaschka, Roland Kaiser (2004): Adventivflora einer mitteleuropäischen Stadt am Beispiel von Salzburg (Österreich)- Vorstellung eines laufenden Projektes der Salzburger Botanischen Arbeitsgemeinschaft – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 13: 347 - 363.
- Oliver Stöhr, Christian Schröck, Peter Pilsl, Susanne Gewolf, Christian Eichberger, Günther Nowotny, Robert Krisai, Apollonia Mayr, Roland Kaiser (2004): Beiträge zur indigenen Flora von Salzburg – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 13: 15 - 114.
- Christian Schröck, Oliver Stöhr, Susanne Gewolf, Christian Eichberger, Günther Nowotny, Apollonia Mayr, Peter Pilsl (2004): Beiträge zur Adventivflora von Salzburg I – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 13: 221 - 337.
- Peter Pilsl (2003): Bibliographie der botanischen Literatur über das Land Salzburg- Teil 1: Von den Anfängen bis 1980 – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 12: 5 - 396.
Peter Pilsl, Helmut Wittmann, Günther Nowotny (2002): Beiträge zur Flora des Bundeslandes Salzburg III – Linzer biologische Beiträge – 0034_1: 5 - 165.
Johann Peter Gruber, Robert Krisai, Peter Pilsl, Christian Schröck (2001): Die Moosflora und -vegetation des Naturdenkmales Krimmler Wasserfälle (Nationalpark Hohe Tauern, Salzburg, Österreich) – Nationalpark Hohe Tauern - Wissenschaftliche Mitteilungen Nationalpark Hohe Tauern – 6: 9 - 49.- Peter Pilsl (1999): Stand der bryofloristischen Kartierung Salzburgs. – Abhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Österreich – 30: 123 - 129.
Herbert Weingartner, Raimund Killingseder, Peter Pilsl (1997): Geographie – Nationalpark Hohe Tauern - Wissenschaftliche Mitteilungen Nationalpark Hohe Tauern – 2_SB: 419 - 583.
Peter Pilsl (1997): Naturkunde, Ökologie u. Naturschutz – Nationalpark Hohe Tauern - Wissenschaftliche Mitteilungen Nationalpark Hohe Tauern – 2_SB: 15 - 39.
Norbert Winding, Peter Pilsl (1997): Zoologie – Nationalpark Hohe Tauern - Wissenschaftliche Mitteilungen Nationalpark Hohe Tauern – 2_SB: 351 - 418.
Peter Pilsl (1997): Botanik – Nationalpark Hohe Tauern - Wissenschaftliche Mitteilungen Nationalpark Hohe Tauern – 2_SB: 271 - 350.
Elisabeth Charlotte Kirchner, Peter Pilsl (1997): Geowissenschaften – Nationalpark Hohe Tauern - Wissenschaftliche Mitteilungen Nationalpark Hohe Tauern – 2_SB: 41 - 269.
Helmut Wittmann, Peter Pilsl (1997): Beiträge zur Flora des Bundeslandes Salzburg II. – Linzer biologische Beiträge – 0029_1: 385 - 506.
Peter Pilsl (1994): Botanik – Nationalpark Hohe Tauern - Wissenschaftliche Mitteilungen Nationalpark Hohe Tauern – 1_SB: 101 - 127.
Helmut Wittmann, Apollonia Siebenbrunner, Peter Pilsl, Paul Heiselmayer (1987): Vebreitungsatlas der salzburger Gefäszpflanzen – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 2: 1 - 403.- Helmut Wittmann, Apollonia Siebenbrunner, Peter Pilsl, Paul Heiselmayer (1984): Bericht über die floristische Kartierung im Bundesland Salzburg – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 9: 21 - 26.
Roman Türk, Helmut Wittmann, Peter Pilsl (1982): Ergebnisse der floristischen Flechtenkartierung in Oberösterreich + ein erster Überblick – Stapfia – 0010: 121 - 137.
