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- Martin Mühlbauer, Gerald Zauner (2023): Revitalisierung von Neben] und Altarmstrukturen an grosen Fliesgewassern Okologische Ziele, Planungsrahmenbedingungen, Methoden und Beispiele – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 159: 87 - 107.
- Michael Jung, Clemens Ratschan, Gerald Zauner (2022): Allgemeines und Besonderheiten der Fischfauna im Umfeld der Donauinsel Soldatenau – Der Bayerische Wald – 35_1-2: 162 - 167.
- Willy Albert Zahlheimer, Rudolf Ritt, Otto Aßmann, Franz Berger, Ralf Braun-Reichert, Markus Fehrer, Horst Göding, Gotthard Grimbs, Gudrun Grimbs, Martin Hanslmeier, Michael Jung, Michael Hohla, Albin Lugmair, Tanja Major, Markus Mathyl, Andreas Pontz, Clemens Ratschan, Ulrich Teuber, Michael Wasner, Herbert W. Wurster, Gerald Zauner, Alois Zechmann (2022): Zusammenfassung Die österreichische Donauinsel Soldatenau bei Passau – biologische Vielfalt dank Trinkwasserversorgung – Der Bayerische Wald – 35_1-2: 185 - 189.
- Martin Brader, Jürgen Plass, Clemens Ratschan, Stephan Weigl, Werner Weißmair, Gerald Zauner (2022): Liste der Wirbeltiere Oberösterreichs 8. Fassung – Linzer biologische Beiträge – 0054_1: 1 - 62.
- Michael Jung, Clemens Ratschan, Gerald Zauner (2019): Wissenschaft: Erstnachweis des Steingreßlings (Romanogobio uranoscopus Agassiz, 1828) im Inn und Verbreitung im deutschsprachigen Raum – Österreichs Fischerei – 72: 177 - 189.
- Clemens Ratschan, Gerald Zauner, Michael Jung (2017): Der Sterlet im oberen Donautal – Identifikation der Laichhabitate mittels Telemetrie. Endbericht 2016 – Gutachten Naturschutzabteilung Oberösterreich – 0835: 1 - 70.
- Clemens Ratschan, Gerald Zauner (2016): Fischereibiologie & Aquakultur: Hochwasserretention durch Renaturierung des Großen Kößlbachs - ein Resümee 12 Jahre nach Umsetzung – Österreichs Fischerei – 69: 286 - 296.
- Clemens Gumpinger, Clemens Ratschan, Michael Schauer, Josef Wanzenböck, Gerald Zauner (2016): Artenschutzprojekt Kleinfische und Neunaugen in Oberösterreich: Endbericht über die Projektdauer 2008 bis 2015 – Gutachten Naturschutzabteilung Oberösterreich – 0839: 1 - 164.
- Martin Brader, Jürgen Plass, Clemens Ratschan, Stephan Weigl, Werner Weißmair, Gerald Zauner (2016): Liste der Wirbeltiere Oberösterreichs – Linzer biologische Beiträge – 0048_1: 327 - 380.
- Sollen Cypriniden wie die Nase besetzt werden? Gedanken anlässlich der Nase als "Fisch des Jahres"Gerald Zauner, Clemens Ratschan, Michael Jung, Martin Mühlbauer (2015): Sollen Cypriniden wie die Nase besetzt werden? Gedanken anlässlich der Nase als "Fisch des Jahres" – Österreichs Fischerei – 68: 135 - 140.
- Fischökologische Sanierung von Fließstrecken und Stauhaltungen der österreichischen Donau gem. …Gerald Zauner, Michael Jung, Clemens Ratschan, Martin Mühlbauer (2015): Fischökologische Sanierung von Fließstrecken und Stauhaltungen der österreichischen Donau gem. WRRL: Immer der Nase (Chondrostoma nasus) nach – Österreichs Fischerei – 68: 177 - 196.
- Thomas Friedrich, Bernhard Schmall, Clemens Ratschan, Gerald Zauner (2014): Die Störarten der Donau Teil 3: Sterlet, »Stierl« (Acipenser ruthenus) und aktuelle Schutzprojekte im Donauraum – Österreichs Fischerei – 67: 167 - 183.
- Gerald Zauner (2013): Beweg-Gründe für Fischwanderungen. – Umwelt - Schriftenreihe für Ökologie und Ethologie – 39: 25 - 37.
- Michael Schauer, Clemens Ratschan, Josef Wanzenböck, Clemens Gumpinger, Gerald Zauner (2013): Der Schlammpeitzger (Misgurnus fossilis, Linnaeus 1758) in Oberösterreich – Österreichs Fischerei – 66: 54 - 70.
- Clemens Ratschan, Gerald Zauner, Martin Mühlbauer (2012): Einfluss des schifffahrtsbedingten Wellenschlags auf Jungfische: Sog und Schwall, Drift und Habitat nut - zung; Rekrutierung von Fischbeständen in der Donau – Österreichs Fischerei – 65: 50 - 74.
- Clemens Ratschan, Gerald Zauner (2012): Verbreitung und Bestände des Huchens in Oberösterreich - ursprünglich, aktuell und Zukunftsperspektiven – Österreichs Fischerei – 65: 250 - 258.
- Clemens Gumpinger, Clemens Ratschan, Michael Schauer, Josef Wanzenböck, Gerald Zauner (2011): Das Artenschutzprojekt Kleinfische und Neunaugen - ein wertvoller Beitrag zum Erhalt der Biodiversität in oberösterreichischen Gewässern Teil 1: Allgemeines – Österreichs Fischerei – 64: 130 - 144.
- Clemens Ratschan, Clemens Gumpinger, Michael Schauer, Josef Wanzenböck, Gerald Zauner (2011): Artenschutzprojekt Kleinfische und Neunaugen in Oberösterreich Teil 2: Balkan-Goldsteinbeißer (Sabanejewia balcanica Karaman, 1922) – Österreichs Fischerei – 64: 174 - 188.
- Josef Wanzenböck, Clemens Ratschan, Michael Schauer, Clemens Gumpinger, Gerald Zauner (2011): Der Strömer (Leuciscus souffia Risso, 1826) in Oberösterreich - historischer Rückgang, derzeitige Verbreitung und mögliche Trendwende – Österreichs Fischerei – 64: 294 - 306.
- Gerhard Aubrecht, Martin Brader, Jürgen Plass, Clemens Ratschan, Werner Weißmair, Gerald Zauner (2011): Liste der Wirbeltiere Oberösterreichs – Beiträge zur Naturkunde Oberösterreichs – 0021: 3 - 53.
- Clemens Gumpinger, Clemens Ratschan, Michael Schauer, Josef Wanzenböck, Gerald Zauner (2010): Artenschutzprojekt. Kleinfische und Neunaugen in Oberösterreich. Bericht über die Projektjahre 2010 und 2011. – Gutachten Naturschutzabteilung Oberösterreich – 0189: 1 - 102.
- Gerald Zauner, Clemens Ratschan, Martin Mühlbauer (2007): Fischfauna der Donau im östlichen Machland unter besonderer Berücksichtigung der FFHSchutzgüter und ihres Erhaltungszustands; Maßnahmen und Potenzial für Revitalisierungen – Österreichs Fischerei – 60: 194 - 206.
- Gerald Zauner, Clemens Ratschan (2007): Einige aktuelle Perlfisch-(Rutilus meidingeri) Nachweise in österreichischen Fließgewässern – Österreichs Fischerei – 60: 127 - 130.
- Gerhard Aubrecht, Martin Brader, Jürgen Plass, Clemens Ratschan, Werner Weißmair, Gerald Zauner (2007): Liste der Wirbeltiere Oberösterreichs – Beiträge zur Naturkunde Oberösterreichs – 0017: 5 - 53.
- Severin Hohensinner, Helmut Habersack, M. Jungwirth, Gerald Zauner (2006): Natürliche Charakteristik der Donau-Auen im Machland und hydromorphologische Veränderungen durch menschliche Eingriffe (1812-1991) – Beiträge zur Naturkunde Oberösterreichs – 0016: 517 - 543.
- Gerald Zauner, Clemens Ratschan, Martin Mühlbauer, Stefan Guttmann, Bernd Pfleger, Thomas Rader (2006): Studie zur Untersuchung der Fischfauna im Donauabschnitt zwischen Wallsee und Dornach (östliches Machland) unter besonderer Berücksichtigung der FFH-Schutzgüter (Fischarten des Anhang II). Maßnahmen und Potential für Revitalisierungen. - Studie im Auftrag des Amtes der Oberösterreichischen Landesregierung, Abt. Naturschutz sowie der Oberösterreichischen und Niederösterreichischen Landesfischereiverbände. – Gutachten Naturschutzabteilung Oberösterreich – 0160: 1 - 289.
- Severin Hohensinner, Helmut Habersack, Mathias Jungwirth, Gerald Zauner (2005): Natürliche Charakteristik der Donau-Auen im Machland und hydromorphologische Veränderungen durch menschliche Eingriffe (1812-1991). (N.F. 463) – Wissenschaftliche Mitteilungen Niederösterreichisches Landesmuseum – 17: 275 - 308.
- Gerald Zauner, Clemens Ratschan, Jürgen Eberstaller, Peter Pinka (2005): Vertical-Slot-Fischpass mit staffelbarem Abfluss: Eine Möglichkeit zur Optimierung von technischen Fischaufstiegshilfen – Österreichs Fischerei – 58: 162 - 169.
- Gerald Zauner, Clemens Ratschan (2005): Erstnachweis von Perlfischen (Rutilus meidingeri) in der oberösterreichischen Donau - Bestätigung einer selbst erhaltenden Donaupopulation! – Österreichs Fischerei – 58: 126 - 129.
- Pilotstudie Oberes Donautal Gewässerökologische Evaluierung neugeschaffener…Gerald Zauner, Peter Pinka, Otto Moog (2001): Pilotstudie Oberes Donautal Gewässerökologische Evaluierung neugeschaffener Schotterstrukturen im Stauwurzelbereich des Kraftwerkes Aschach – Bundesministerium für Verkehr, Innovation und Techologie, Wien – .
- Pilotstudie Oberes Donautal Gewässerökologische Evaluierung neugeschaffener…Gerald Zauner, Peter Pinka, Otto Moog (2001): Pilotstudie Oberes Donautal Gewässerökologische Evaluierung neugeschaffener Schotterstrukturen im Stauwurzelbereich des Kraftwerkes Aschach. – Bundesministerium für Verkehr, Innovation und Techologie, Wien – .
- Gerhard Aubrecht, Martin Brader, Werner Weißmair, Gerald Zauner (2001): Liste der Wirbeltiere Oberösterreichs. 4. Fassung – Beiträge zur Naturkunde Oberösterreichs – 0010: 515 - 551.
- Stefan Schmutz, Gerald Zauner, Jürgen Eberstaller, Mathias Jungwirth (2001): Die »Streifenbefischungsmethode«: Eine Methode zur Quantifizierung von Fischbeständen mittelgroßer Fließgewässer – Österreichs Fischerei – 54: 14 - 27.
- Gerald Zauner, Peter Pinka (1998): Fischökologische Beweissicherung der Altarmdotation "Schönbüheler Altarm" (Donau, Niederösterreich, Wachau) – Stapfia – 0052: 23 - 144.
- Gerald Zauner (1997): Acipenseriden in Österreich – Österreichs Fischerei – 50: 183 - 187.
- Susanne Muhar, Erich Hübl, Alois Graf, Gerald Zauner (1996): Die Url im niederösterreichischen Alpenvorland – Jahrbuch für Landeskunde von Niederösterreich – 62_1: 23 - 99.
- Gerald Zauner, Fritz Schiemer (1994): Auswirkungen der Schiffahrt auf die Fischfauna großer Fließgewässer. (N.F. 335) – Wissenschaftliche Mitteilungen Niederösterreichisches Landesmuseum – 8: 271 - 285.
- Herwig Waidbacher, Gerald Zauner, Helene Kovacek, Otto Moog (1991): Fischökologische Studie Oberes Donautal. In Hinblick auf Strukturierungsmaßnahmen im Stauraum Aschach (Oberösterreich) – Monografien Vertebrata Pisces – 0040: 1 - 181.