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- Rudolf Schubert (2013): Pflanzliche Biodiversität im Wohngebiet Landrain in Halle/Saale – Mitteilungen zur floristischen Kartierung in Sachsen-Anhalt – 18: 63 - 73.
- Rudolf Schubert, Regine Stordeur [geb. Kirsten] (2011): Synopsis der Flechtengesellschaften Sachsen-Anhalts – Schlechtendalia – 22: 1 - 88.
- Synopsis der Moosgesellschaften Sachsen-AnhaltsRudolf Schubert (2009): Synopsis der Moosgesellschaften Sachsen-Anhalts – Schlechtendalia – 18: 1 - 158.
- Rudolf Schubert (2008): Vegetationsdynamik in einigen Naturschutzgebieten Sachsen-Anhalt – Mitteilungen zur floristischen Kartierung in Sachsen-Anhalt – 13: 53 - 75.
- Rudolf Schubert (2008): Die Moosgesellschaften des Nationalparks Harz – Mitteilungen zur floristischen Kartierung in Sachsen-Anhalt – SH_5: 1 - 80.
- Prodromus der Pflanzengesellschaften Sachsen-AnhaltsRudolf Schubert (2006): Prodromus der Pflanzengesellschaften Sachsen-Anhalts – Mitteilungen zur floristischen Kartierung in Sachsen-Anhalt – SH_4: 1 - 688.
- Arndt Kästner, Rudolf Schubert (2006): Biotoperfassung in der Tagebaufolgelandschaft des Osendorfer Sees (Halle/Saale) – Mitteilungen zur floristischen Kartierung in Sachsen-Anhalt – 11: 61 - 79.
- Rudolf Schubert (2006): Die Entwicklung der geobotanischen Forschung an der Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg unter besonderer Berücksichtigung des Harzes – Abhandlungen und Berichte aus dem Museum Heineanum – SH_7_1: 9 - 26.
- Rudolf Schubert (2005): Moosgesellschaften von Fließgewässern im Nationalpark Hochh – Hercynia – 38: 209 - 232.
- Rudolf Schubert (2004): Moosgesellschaften der Fließgewässer im Einzugsgebiet der Oder und Sieber im Nationalpark Harz – Hercynia – 37: 19 - 43.
- Gunter Karste, Rudolf Schubert, Uwe Wegener (2003): Die Wiederbesiedelung vegetationsfreier Flächen im Brockengebiet im Nationalpark Hochharz – Hercynia – 36: 217 - 233.
- Rudolf Schubert (2001): Prodromus der Pflanzengesellschaften Sachsen-Anhalts – Mitteilungen zur floristischen Kartierung in Sachsen-Anhalt – SH_2: 1 - 688.
- Rudolf Schubert (1999): Grundlagen, Bedeutung und Grenzen des Biotopmonitoring – Berichte der Bayerischen Akademie für Naturschutz und Landschaftspflege (ANL) – 23: 113 - 119.
- Gunter Karste, Rudolf Schubert (1997): Sukzessionsuntersuchungen im Brockengebiet (Nationalpark Hochharz) – Berichte der Naturhistorischen Gesellschaft Hannover – 139: 89 - 104.
- Rudolf Schubert (1996): Vorwort – Mitteilungen zur floristischen Kartierung in Sachsen-Anhalt – 1: 3 - 4.
- Rudolf Schubert (1995): Zur Gliederung von Pflanzengesellschaften. Ein Diskussionsbeitrag – Tuexenia - Mitteilungen der Floristisch-soziologischen Arbeitsgemeinschaft – NS_15: 3 - 9.
- Uwe Wegener, Rudolf Schubert, Gerrit Stohr, Friedrich Ebel (1990): 100 Jahre Brockengarten – Hercynia – 27: 309 - 325.
- Klaus Dörter, Rudolf Schubert (1984): Betrieb und Nutzung von Meliorationsmaßnahmen unter Beachtung des Umweltschutzes – Hercynia – 21: 89 - 97.
- Rudolf Piechocki, Rudolf Schubert, Joseph Schuh (1982): Prof. Dr. Drs. h. c. Hans Stubbe 80 Jahre – Hercynia – 19: 1 - 4.
- Rudolf Schubert, Michael Stubbe, Joseph Schuh (1980): Dr. rer. nat. Rudolf Piechocki 60 Jahre – Hercynia – 17: 1 - 3.
- Rudolf Schubert, Eckehart Johannes Jäger, Ernst-Gerhard Mahn (1979): Vergleichende geobotanische Untersuchungen in der Haschkirischen ASSR – Hercynia – 16: 206 - 263.
- Rudolf Schubert (1977): Ausgewählte pflanzliche Bioindikatoren zur Erfassung ökologischer Veränderungen in terrestrischen Ökosystemen durch anthropogene Beeinflussung unter besonderer Berücksichtigung industrieller Ballungsgebiete – Hercynia – 14: 399 - 412.
- Rudolf Schubert (1976): Ökologische Betrachtungsweise als Prinzip wissenschaftlicher Forschungsarbeit für die sozialistische Landeskultur – Hercynia – 13: 158 - 163.
- Rudolf Schubert (1974): Übersicht über die Pflanzengesellschaften des südlichen Teiles der DDR X. Silbergrasreiche PionierHuren auf nährstoffarmen Sand- und Grusböden – Hercynia – 11: 291 - 298.
- Rudolf Schubert (1974): Übersicht über die Pflanzengesellschaften des südlichen Teiles der DDR IX. Mauerpfefferreiche Pionierfluren – Hercynia – 11: 201 - 214.
- Rudolf Schubert (1974): Übersicht über die Pflanzengesellschaften des südlichen Teiles der DDR VIII. Ba1iphile Trocken- und Halbtrockenra8eo – Hercynia – 11: 22 - 46.
- Rudolf Piechocki, Rudolf Schubert (1973): Vorwort zum Band 10 – Hercynia – 10: 1 - 2.
- Rudolf Schubert (1973): Übersicht über die Pflanzengesellschaften des südlichen Teiles der DDR VI. Azidiphile Zwergstrauchheiden – Hercynia – 10: 101 - 110.
- Rudolf Schubert (1972): Übersicht über die Pflanzengesellschaften des südlichen Teiles der DDR III.Wälder – Hercynia – 9: 1 - 34.
- Rudolf Schubert (1972): Übersicht über die Pflanzengesellschaften des südlichen Teiles der DDR III. Wälder – Hercynia – 9: 197 - 228.
- Rudolf Schubert (1972): Übersicht über die Pflanzengesellschaften · des südlichen Teiles der DDR III. Wälder – Hercynia – 9: 106 - 136.