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- Josef Anton Sonnberger, Paul Heiselmayer (2013): Hemerobie ausgesuchter Buchenmischwälder der Stadt Salzburg, des Flachgaues und des Tennengaues im Land Salzburg. – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 20: 277 - 294.
- Christian Eichberger, Paul Heiselmayer, Johann Peter Gruber (2009): Exakte Verortung von Vegetationsaufnahmen und ergänzende Daten zu früheren Arbeiten (1995-2006). – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 18: 359 - 378.
- Paul Heiselmayer, Ingrid Wawra (2008): Lineare Gehölze und Waldränder in der Gemeinde Neumarkt am Wallersee (Flachgau, Salzburg, Österreich): ökologische Bedeutung in der Kulturlandschaft insbesondere als Nahrungsquele für Vögel – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 16: 410 - 412.
- Paul Heiselmayer, Josef Anton Sonnberger (2008): Hemerobie ausgesuchter Buchenmischwälder der Stadt Salzburg, des Flachgaues und des Tennengaues im Land Salzburg – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 16: 393 - 394.
- , Paul Heiselmayer, Fadil Millaku, Elez Krasniqi, Ferat Rexhepi, Agim Haziri (2008): Endemic, steno-endemic and relict plants in serpentines of Kosova – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 16: 149 - 162.
- Paul Heiselmayer, Martina Mannel (2008): Ant - plant interaction in the genus Inga (Fabaceae) in the Piedras Blancas Nationalpark, Costa Rica – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 16: 363 - 364.
- Paul Heiselmayer, Ulrike Langmann, Ulrike Gartner (2008): Orchideenwiese – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 16: 353 - 354.
- Christian Eichberger, Christina Grosser, Paul Heiselmayer (2008): Apium repens, Cypripedium calceolus, Liparis loeselii und Spiranthes aestivalis, die vier Gefäßpflanzenarten der Fauna-Flora-Habitat-Richtlinie im Bundesland Salzburg- Ökologie, Verbreitung und Gefährdungssituation – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 16: 75 - 91.
- Christian Eichberger, Paul Heiselmayer, Angelika Vago (2008): Veränderungen von Landschaft und Lebensräumen in den letzten zwei Jahrhunderten am Beispiel der Glanegger Wiesen (Salzburg, Österreich) – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 16: 120 - 134.
- Christian Eichberger, Paul Heiselmayer, Sabine Grabner (2004): Rotföhrenwälder in Österreich: eine syntaxonomische Neubewertung – Tuexenia - Mitteilungen der Floristisch-soziologischen Arbeitsgemeinschaft – NS_24: 127 - 176.
- Christian Eichberger, Paul Heiselmayer, Robert Krisai (2004): Die Floristische Erforschung Salzburgs im Überblick – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 13: 7 - 13.
- Paul Heiselmayer (1999): Wintersport als Verursacher von Vegetationsschäden – Laufener Spezialbeiträge und Laufener Seminarbeiträge (LSB) – 6_1999: 25 - 28.
- Christian Eichberger, Paul Heiselmayer (1997): Die Erika-Kiefernbestände (Erico-Pinetum sylvestris BR.-BL. in BR.-BL. et al. 39) bei Mandling (Salzburg und Steiermark, Österreich) (Nachtrag). – Linzer biologische Beiträge – 0029_2: 1175.
- Christian Eichberger, Paul Heiselmayer (1997): Die Erika-Kiefernbestände (Erico-Pinetum sylvestris BR.- BL. in BR. -BL. et al. 39) bei Mandling (Salzburg und Steiermark, Österreich). – Linzer biologische Beiträge – 0029_1: 507 - 543.
- Menschlicher Einfluß auf die Vegetation am Beispiel der KykladenPaul Heiselmayer (1995): Menschlicher Einfluß auf die Vegetation am Beispiel der Kykladen – Carinthia II. Mitteilungen des Naturhistorischen Landesmuseums fuer Kaernten. Sonderhefte No.(1) 1930- – 53: 55 - 57.
- Paul Heiselmayer (1995): Menschlicher Einfluß auf die Vegetation am Beispiel der Kykladen. – Carinthia II - Sonderhefte – 53: 55 - 57.
- Paul Heiselmayer, Christian Eichberger (1995): Die Eibe (Taxus baccata L.) in Salzburg. Versuch einer Monographie – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 7: 1 - 128.
- Die Pflanzenwelt des WallfahrtswegesPaul Heiselmayer, Josef Seidenschwarz (1994): Die Pflanzenwelt des Wallfahrtsweges – Nationalpark Berchtesgarden - Forschungsberichte – 30: 83 - 98.
- Paul Heiselmayer (1988): KRETA -Vegation und Pflanzengeographie einer südägäischen Insel. – Berichte des naturwissenschaftlichen-medizinischen Verein Innsbruck – 75: 251 - 260.
- Paul Heiselmayer (1987): Geländeklima und Vegetation im Bereich des Tappenkars (Hinteres Kleinarltal, Salzburg). - In: GEISER Elisabeth, Salzburg (1987), Naturwissenschaftliche Forschung in Salzburg. Festschrift zum 60. Geburtstag von Prof. Dr. Mag. Eberhard Stüber, Direktor des Hauses der Natur und Landesumweltanwalt. Berichte aus dem Haus der Natur in Salzburg X. Folge Teil A. – Mitteilungen aus dem Haus der Natur Salzburg – 10: 114 - 123.
- Helmut Wittmann, Apollonia Siebenbrunner, Peter Pilsl, Paul Heiselmayer (1987): Vebreitungsatlas der salzburger Gefäszpflanzen – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 2: 1 - 403.
- Paul Heiselmayer (1986): Anton Eleutherius Sauter- Ein Botaniker aus Salzburg – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 1: 9 - 11.
- Paul Heiselmayer (1985): Zur Vegetation stark beweideter Gebiete in den Radstädter Tauern (Hinterstes Kleinarltal, Salzburg) – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 123: 247 - 262.
- Paul Heiselmayer (1985): Zur Problematik der Zeigerwerte und deren Anwendung in Pflanzengesellschaften der alpinen Stufe – Stapfia – 0014: 105 - 125.
- Helmut Wittmann, Apollonia Siebenbrunner, Peter Pilsl, Paul Heiselmayer (1984): Bericht über die floristische Kartierung im Bundesland Salzburg – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 9: 21 - 26.
- Paul Heiselmayer, Hubert Plank, Werner Schneider (1982): Vegetationskundliche Luftbildauswertung am Beispiel der Umgebung des Glocknerhauses (Mit 6 Abbildungen) – Carinthia II – 172_92: 225 - 240.
- Paul Heiselmayer (1982): Die Pflanzengesellschaften des Tappenkars (Radstädter Tauern) – Stapfia – 0010: 161 - 202.
- Paul Heiselmayer, Hermann Suida (1981): Der Gaisberg, Natur- und Erholungslandschaft. – Mitt(h)eilungen der Gesellschaft für Salzburger Landeskunde – 120_121: 563 - 580.
- Paul Heiselmayer (1981): Buchbesprechung – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 7: 37.
- Paul Heiselmayer (1979): Prinzipien der Vegetationsgliederung im Tappenkar (Radstädter Tauern). – Mitt(h)eilungen der Gesellschaft für Salzburger Landeskunde – 119: 305 - 323.
- Paul Heiselmayer (1979): Die Tagung der bryologisch-lichenologischen Arbeitsgemeinschaft für Mitteleuropa vom 24. - 27. August 1978 in Salzburg – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 6: 3 - 23.
- Paul Heiselmayer (1978): Der Erfassung ökologischer Parameter im Bereich des Tappenkars. – Mitt(h)eilungen der Gesellschaft für Salzburger Landeskunde – 118: 345 - 364.
- Paul Heiselmayer (1978): Vorarbetien für eine Wärmestufenkarte von Salzburg – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 5: 33 - 36.
- Paul Heiselmayer (1978): Bibliographie von Bestimmungsschlüsseln II – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 5: 18 - 23.
- Die Wälder im hinteren Kleinarltal. Zeugen einer wärmeren Klimaepoche.Paul Heiselmayer (1977): Die Wälder im hinteren Kleinarltal. Zeugen einer wärmeren Klimaepoche. – Mitt(h)eilungen der Gesellschaft für Salzburger Landeskunde – 117_2: 411 - 431.
- Paul Heiselmayer (1977): Bibliographie von Bestimmungsschlüsseln – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 4: 27 - 35.
- Paul Heiselmayer (1977): Floristisches vom Tappenkar – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 4: 14 - 23.
- Paul Heiselmayer (1976): Stand der floristischen Kartierung in Salzburg – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 3: 14 - 16.
- Paul Heiselmayer (1976): Die subalpin-alpine Aussenstelle des botanischen Institutes am Tappenkar – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 3: 35 - 36.
- Paul Heiselmayer (1976): Inneralpine Laubwälder in Kärnten, der Steiermark und Salzburg – Carinthia II – 166_86: 309 - 328.
- Paul Heiselmayer (1975): Aposeris Foetida (L.) Less. - neue Vorkommen in Salzburg – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 2: 10 - 13.
- Paul Heiselmayer (1975): Der Stand der floristischen Kartierung in Salzburg – Floristische Mitteilungen aus Salzburg – 1: 5 - 7.