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- Wilhelm Michaelsen (1930): Seescheiden oder Ascidiae – Die Tierwelt Deutschlands und der angrenzenden Meeresteile nach ihren Merkmalen und nach ihrer Lebensweise – 17: 164 - 188.
- Seescheiden oder AscidiaeWilhelm Michaelsen (1930): Seescheiden oder Ascidiae – Tierwelt Deutschlands – 17: 164 - 188.
- Pheretima (Archipheretima) ophiodes n. sp. , ein eigentümlich bunter Regenwurm von den…Wilhelm Michaelsen (1929): Pheretima (Archipheretima) ophiodes n. sp., ein eigentümlich bunter Regenwurm von den Philippinen – Mitt. zool. Staatsinst. Zool. Mus. Hamburg – 44: 85 - 90.
- Wilhelm Michaelsen (1923): Neue und altbekannte Ascidien aus dem Reichsmuseum zu Stockholm. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 40: 1 - 60.
- Wilhelm Michaelsen (1922): 3. Sonderbericht über den Vortrag am 2. November 1921. Die Verbreitung der Oligochäten im Lichte der Wegener'schen Theorie der Kontinentenverschiebung und andere Fragen zur Stammesgeschichte und Verbreitung dieser Tiergruppe – Verhandlungen des Naturwissenschaftlichen Vereins in Hamburg – 29: 45 - 79.
- Wilhelm Michaelsen (1921): Zoologische Ergebnisse XXXIII. Ascidiae Krikobranchiae des Roten Meeres: Clavelinidae und Synoicidae (mit 1 Tafel und Textfigur). – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 97X: 1 - 38.
- Wilhelm Michaelsen (1921): Beiträge zur Kenntnis der Meeresfauna Westafrikas. Band III, Lieferung 2. – Beiträge zur Kenntnis der Meeresfauna Westafrikas – 3: 37 - 67.
- Wilhelm Michaelsen (1921): Beiträge zur Kenntnis der Meeresfauna Westafrikas. Band III, Lieferung 3. – Beiträge zur Kenntnis der Meeresfauna Westafrikas – 3: 69 - 110.
- Wilhelm Michaelsen (1920): Zur Stammesgeschichte und Systematik der Oligochäten, insbesondere der Lumbriculiden. – Archiv für Naturgeschichte – 86A_8: 130 - 141.
- Wilhelm Michaelsen (1922): Oligochäten vom westlichen Vorderindien und ihre Beziehungen zur Oligochätenfauna von Madagaskar und den Seychellen. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 38: 27 - 68.
- Oligochäten vom westlichen Vorderindien und ihre Beziehungen zur Oligochätenfauna von Madagaskar…Wilhelm Michaelsen (1920-1922): Oligochäten vom westlichen Vorderindien und ihre Beziehungen zur Oligochätenfauna von Madagaskar und den Seychellen – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 38_BH2: 27 - 68.
- Wilhelm Michaelsen (1919): Über die Bezeihungen der Hirudineen zu de Oligochäten – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 36: 131 - 153.
- Wilhelm Michaelsen (1919): Die Krikobranchen Ascidien des westlichen indischen Ozeans: Claveliniden und Synoiciden. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 36: 71 - 104.
- Wilhelm Michaelsen (1918): Zoologische Ergebnisse XXXII. Ascidia Ptychobranchia und Dictyobranchia des Roten Meeres (mit 1 Tafel, 20 Textfiguren und 1 Kartenskizze). – Denkschriften der Akademie der Wissenschaften.Math.Natw.Kl. Frueher: Denkschr.der Kaiserlichen Akad. der Wissenschaften. Fortgesetzt: Denkschr.oest.Akad.Wiss.Mathem.Naturw.Klasse. – 95B: 1 - 120.
- Wilhelm Michaelsen (1918): Die Lumbriciden, mit besonderer Berücksichtigung der bisher als Familie Glossoscolecidae zusammengefaßten Unterfamilien. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 41: 1 - 398.
- Wilhelm Michaelsen (1918): Die Ptychobranchen und Diktyobranchen Ascidien des westlichen Indischen Ozeans. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 35: 1 - 74.
- Wilhelm Michaelsen (1918): Die Krikobranchen Ascidien des westlichen Indischen Ozeans: Didemniden. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 37: 1 - 74.
- Die Krikobranchen Ascidien des westlichen Indischen Ozeans: Claveliniden und Synoiciden.Wilhelm Michaelsen (1918-1920): Die Krikobranchen Ascidien des westlichen Indischen Ozeans: Claveliniden und Synoiciden. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 36_BH2: 71 - 104.
- Über die Beziehungen der Hirudineen zu den Oligochäten.Wilhelm Michaelsen (1918-1920): Über die Beziehungen der Hirudineen zu den Oligochäten. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 36_BH2: 131 - 153.
- Wilhelm Michaelsen (1916): Ein eigentümlicher neuer Enchyträide der Gattung Propappus aus der Niederelbe – Verhandlungen des Naturwissenschaftlichen Vereins in Hamburg – 23: 51 - 55.
- Wilhelm Michaelsen (1915): Beiträge zur Kenntnis der Meeresfauna Westafrikas. Band I, Lieferung 3. – Beiträge zur Kenntnis der Meeresfauna Westafrikas – 1: 319 - 518.
- Wilhelm Michaelsen (1914): Diagnosen einiger neuer westafrikanischer Ascidien. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 31: 75 - 79.
- Wilhelm Michaelsen (1914): Oligochäten vom tropischen Afrika. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 31: 81 - 127.
- Wilhelm Michaelsen (1914): Ein neuer Regenwurm aus Griechenland. – Verhandlungen der Zoologisch-Botanischen Gesellschaft in Wien. Frueher: Verh.des Zoologisch-Botanischen Vereins in Wien. seit 2014 "Acta ZooBot Austria" – 64: 8 - 9.
- Wilhelm Michaelsen (1913): Oligochäten vom tropischen und südlich-subtropischen Afrika – Zoologica (bis Bd 8 unter dem Namen Bibliotheca Zoologica) – 27_68: 1 - 63.
- Wilhelm Michaelsen (1913): Oligochäten vom tropischen und südlich-subtropischen Afrika – Zoologica (bis Bd 8 unter dem Namen Bibliotheca Zoologica) – 26_67: 139 - 170.
- Wilhelm Michaelsen (1913): Die Oligochäten des Kaplandes. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 34: 473 - 556.
- Wilhelm Michaelsen (1913): Oligochäten von Travancore und Borneo. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 30: 73 - 92.
- Wilhelm Michaelsen (1913-1914): Oligochäten vom tropischen Afrika. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 31_BH2: 81 - 127.
- Wilhelm Michaelsen (1913-1914): Diagnosen einiger neuer westafrikanischer Ascidien. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 31_BH2: 75 - 79.
- Wilhelm Michaelsen (1913/14): Über einige westafrikanische Ascidien. – Zoologischer Anzeiger – 43: 423 - 432.
- Wilhelm Michaelsen (1912): Über einige zentralamerikanische Oligochäten. – Archiv für Naturgeschichte – 78A_9: 112 - 129.
- Wilhelm Michaelsen (1912-1913): Oligochäten von Travancore und Borneo. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 30_BH2: 73 - 92.
- Wilhelm Michaelsen (1911): Zur Kenntnis der Eodrilaceen und ihrer Verbreitungsverhältnisse. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 30: 527 - 572.
- Wilhelm Michaelsen (1911): Die Tethyiden [Styeliden] desNaturhistorischen Museums zu Hamburg. nebst Nachtrag und Anhang, einige andere Familien betreffend. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 28: 109 - 186.
- Wilhelm Michaelsen (1910): Oligochäten von verschiedenen Gebieten. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 27: 47 - 169.
- Wilhelm Michaelsen (1910-1911): Die Tethyiden [Styeliden] des Naturhistorisclien Museums zu Hamburg, nebst Nachtrag und Anhang, einige andere Familien betreffend. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 28_BH2: 109 - 186.
- Wilhelm Michaelsen (1910-1911): Oligochäten von den Aru- und Kei-Inseln. – Abhandlungen der Senckenbergischen Naturforschenden Gesellschaft – 33_1910-1911: 249 - 261.
- Oligochäten von den Aru- und Kei-InselnWilhelm Michaelsen (1910): Oligochäten von den Aru- und Kei-Inseln – Abh. Senckenb. Naturf. Ges. – 33: 251 - 261.
- Wilhelm Michaelsen (1909-1910): Oligochäten von verschiedenen Gebieten. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 27_BH2: 47 - 169.
- Wilhelm Michaelsen (1908): XIV c. Oligochaeta für 1907. – Archiv für Naturgeschichte – 74-2_3: 1 - 19.
- Wilhelm Michaelsen (1908): Zur Kenntnis der Tubificiden. – Archiv für Naturgeschichte – 74-1: 129 - 162.
- Wilhelm Michaelsen (1908): Die Pyuriden [Halocynthiiden] des Naturhistorischen Museums zu Hamburg – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 25: 227 - 287.
- Wilhelm Michaelsen (1908): Die Molguliden des Naturhistorischen Museums zu Hamburg – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 25: 117 - 152.
- Wilhelm Michaelsen (1908): Pendulations-Theorie und Oligochäten, zugleich eine Erörterung der Grundzüge des Oligochäten-Systems. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 25: 153 - 175.
- Wilhelm Michaelsen (1908): III. Annelida. A. Oligochäten aus dem westlichen Kapland. – Denkschriften der medicinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena – 13: 29 - 42.
- Die Fauna Südwest-Australiens. Ergebnisse der Hamburger südwWilhelm Michaelsen, R. Hartmeyer (1908): Die Fauna Südwest-Australiens. Ergebnisse der Hamburger südw – unbekannt – : 1.
- Wilhelm Michaelsen (1907): Neue Oligochäten von Vorder-Indien, Ceylon, Birma und den Andaman-Inseln. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 24: 143 - 188.
- Wilhelm Michaelsen (1907): Zur Kenntnis der deutschen Lumbricidenfauna. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 24: 189 - 193.
- Zur Kenntnis der deutschen LumbricidenfaunaWilhelm Michaelsen (1907): Zur Kenntnis der deutschen Lumbricidenfauna – Mitt. naturhist. Mus. – 24: 188 - 193.
- Wilhelm Michaelsen (1905): XIV c. Oligocliaeta für 1901, 1902 und 1903. – Archiv für Naturgeschichte – 71-2_3: 1 - 44.
- Wilhelm Michaelsen (1905): Die Oligochäten Deutsch-Ostafrikas – Zeitschrift für wissenschaftliche Zoologie – 82: 288 - 367.
- Wilhelm Michaelsen (1905-1907): Regenwürmer von Erytraea – Verhandlungen des Vereins für Naturwissenschaftliche Unterhaltung zu Hamburg – 13: 5 - 15.
- Wilhelm Michaelsen (1904): XIV c. Oligochaeta für 1898, 1899 und 1900. – Archiv für Naturgeschichte – 70-2_3: 1 - 56.
- Wilhelm Michaelsen (1904): Über eine Trinephrus-Art von Ceylon. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 21: 125 - 131.
- Wilhelm Michaelsen (1904): Revision der compositen Styeliden oder Polyzoinen. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 21: 1 - 124.
- Wilhelm Michaelsen (1903): Die Oligochäten Nordost -Afrikas, nach den Ausbeuten der Herren Oscar Neumann und Carlo Freiherr von Erlanger. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 18: 435 - 556.
- Wilhelm Michaelsen (1903): Wissenschaftlicher Teil. Eine neue Haplotaxiden-Art und andere Oligochaeten aus dem Telezkischen See im nördlichen Altai – Verhandlungen des Naturwissenschaftlichen Vereins in Hamburg – 10: 1 - 7.
- Wilhelm Michaelsen (1903): Hamburgische Elb-Untersuchung. IV. Oligochaeten. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 19: 169 - 210.
- Wilhelm Michaelsen (1903): Neue Oligochaeten und neue Fundorte alt-bekannter. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 19: 1 - 54.
- Wilhelm Michaelsen (1902): Oligochaeta für 1895, 1896 und 1897. – Archiv für Naturgeschichte – 68-2_3: 1 - 40.
- Wilhelm Michaelsen (1902): II. Wissenschaftlicher Teil. Die Lumbriciden-Fauna Norwegens und ihre Beziehungen – Verhandlungen des Naturwissenschaftlichen Vereins in Hamburg – 9: 1 - 13.
- Wilhelm Michaelsen (1902): Die Oligochaeten-Fauna des Baikal-Sees – Verhandlungen des Naturwissenschaftlichen Vereins in Hamburg – 9: 43 - 60.
- Wilhelm Michaelsen (1901): Entgegnung. – Zoologischer Anzeiger – 25: 3 - 6.
- Wilhelm Michaelsen (1901): Neue Tubificiden des Niedereibgebietes – Verhandlungen des Naturwissenschaftlichen Vereins in Hamburg – 8: 66 - 70.
- Wilhelm Michaelsen (1900): Die holosomen Ascidien des magalhaensisch-südgeorgischen Gebietes – Zoologica (bis Bd 8 unter dem Namen Bibliotheca Zoologica) – 12_31: 1 - 148.
- Wilhelm Michaelsen (1900): Die Terricolen- Fauna Columbiens. – Archiv für Naturgeschichte – 66-1: 231 - 266.
- Wilhelm Michaelsen (1900): Zur Kenntnis der Geoscoleciden Südamerikas. – Zoologischer Anzeiger – 23: 53 - 56.
- Wilhelm Michaelsen (1900): Zur Nomenclatur der Oligochaeten, eine Rechtfertigung. – Zoologischer Anzeiger – 23: 566 - 568.
- OligochaetaWilhelm Michaelsen (1900): Oligochaeta – Berlin, Friedlander & Sohn – 10: 1 - 575.
- Wilhelm Michaelsen (1899): Oligochäten von den Inseln des Pacific, nebst Erörterungen zur Systematik der Megascoleoiden. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 12: 211 - 246.
- Wilhelm Michaelsen (1899): Beiträge zur Kenntniss der Oligochäten. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 12: 105 - 144.
- Wilhelm Michaelsen (1900): Eine neue eminoscolex-Art von Hoch-Sennaar – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 17: 1 - 5.
- Wilhelm Michaelsen (1898): Vorläufige Mittheilung über einige Tunicaten aus dem Magalhaensischen Gebiet, sowie von Süd-Georgien. – Zoologischer Anzeiger – 21: 363 - 371.
- Wilhelm Michaelsen (1898): Terricolen von verschiedenen Gebieten der Erde. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 16_BH2: 1 - 122.
- Wilhelm Michaelsen (1899): Terricolen von verschiedenen Gebieten der Erde. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 16: 1 - 122.
- Wilhelm Michaelsen (1897): II. Wissenschaftlicher Teil. Weiterer Beitrag zur Systematik der Regenwürmer – Verhandlungen des Naturwissenschaftlichen Vereins in Hamburg – 4: 1 - 26.
- Wilhelm Michaelsen (1897-1899): Die Terricolen des Madagassisehen Inselgebiets – Abhandlungen der Senckenbergischen Naturforschenden Gesellschaft – 21_1897-1899: 217 - 252.
- Wilhelm Michaelsen (1898): Ueber eine neue Gattung und vier neue Arten der Unterfamilie Benhamini. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 15: 163 - 178.
- Wilhelm Michaelsen (1897): Ueher eine neue Gattung und vier neue Arten der Unterfamilie Benhamini – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 15_BH2: 163 - 178.
- Wilhelm Michaelsen (1896): IX. Grönländische Anneliden – Zoologica (bis Bd 8 unter dem Namen Bibliotheca Zoologica) – 8_20: 120 - 132.
- Wilhelm Michaelsen (1896-1897): Oligochaeten – Abhandlungen der Senckenbergischen Naturforschenden Gesellschaft – 23_1896-1897: 193 - 243.
- Wilhelm Michaelsen (1897): Neue und wenig bekannte afrikanische Terricolen. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 14: 1 - 71.
- Wilhelm Michaelsen (1897): Land- und Süsswasser-Asseln aus der Umgebung Hamburgs. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 14: 119 - 134.
- Wilhelm Michaelsen (1897): Die Terricolenfauna Ceylons. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 14: 157 - 250.
- Wilhelm Michaelsen (1896): Land- und Siisswasser-Asseln aus der Umgebung Hamburgs. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 14_BH2: 119 - 134.
- Wilhelm Michaelsen (1896): Neue und wenig bekannte afrikanische Terricolen. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 14_BH2: 1 - 71.
- Wilhelm Michaelsen (1896): Die Terricolenfauna Ceylons. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 14_BH2: 157 - 250.
- Wilhelm Michaelsen (1895): Die Regenwurm-Fauna von Florida und Georgia, nach der Ausbeute des Herrn Dr. Einar Lönnberg. – Zoologische Jahrbücher. Abteilung für Systematik, Geographie und Biologie der Tiere – 8: 177 - 194.
- Wilhelm Michaelsen (1895): Zur Systematik der Regenwürmer – Verhandlungen des Naturwissenschaftlichen Vereins in Hamburg – 2: 18 - 24.
- Wilhelm Michaelsen (1894-1903): Lumbriciden. – Denkschriften der medicinisch-naturwissenschaftlichen Gesellschaft zu Jena – 8: 97 - 100.
- Weiterer Beitrag zur Systematik der RegenwürmerWilhelm Michaelsen (1894): Weiterer Beitrag zur Systematik der Regenwürmer – Verh. naturw. Ver. Hamb. – 3: 1 - 26.
- Zur Systematik der RegenwürmerWilhelm Michaelsen (1894): Zur Systematik der Regenwürmer – Verh. naturw. Ver. Hamb. – 3: 18 - 24.
- Wilhelm Michaelsen (1892): Terricolen der Berliner Zoologischen Sammlung. – Archiv für Naturgeschichte – 58-1: 209 - 261.
- Wilhelm Michaelsen (1891): Terricolen der Berliner Zoologischen Sammlung. – Archiv für Naturgeschichte – 57-1: 205 - 228.
- Wilhelm Michaelsen (1891): Polychaeten von Ceylon. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 9: 1 - 23.
- Wilhelm Michaelsen (1891): Beschreibung der von Herrn Dr. Fr. Stuhlmann am Victoria Nyanza gesammelten Terricolen. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 9: 1 - 14.
- Wilhelm Michaelsen (1891): Beschreibung der von Herrn Dr. Fr. Stuhlmann auf Sansibar und dem gegenüberliegenden Festlande gesammelten Terricolen. – Mitteilungen aus dem Naturhistorischen Museum in Hamburg – 9: 1 - 72.
- Wilhelm Michaelsen (1891): Beschreibung der von Herrn Dr. Fr. Stuhlmann am Victoria Nyanza gesammelten Terricolen. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 9-2: 29 - 42.
- Wilhelm Michaelsen (1891): Polycliaoten von Ceylon. – Jahrbuch der Hamburgischen Wissenschaftlichen Anstalten – 9-2: 91 - 113.