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- Guido Reiter (2023): Allgemeines zu Fledermäusen – Biologiezentrum Linz Sonderpublikationen – Saeugetiere_OOE: 303 - 304.
- Karin Widerin, Maria Jerabek, Valerie Saliger, Guido Reiter (2023): Erste Nachweise der Alpenfledermaus, Hypsugo savii (Bonaparte, 1837), und der Weißrandfledermaus, Pipistrellus kuhlii (Kuhl, 1817), in Salzburg (Österreich) – Mitteilungen aus dem Haus der Natur Salzburg – 28: 65 - 73.
- Guido Reiter, Jürgen Plass (2023): Kleine Hufeisennase Rhinolophus hipposideros (André 1797) – Biologiezentrum Linz Sonderpublikationen – Saeugetiere_OOE: 308 - 313.
- Leopold Slotta-Bachmayr, Gundi Habenicht, Guido Reiter, Christine Resch, Stefan Resch, Michael Strauch, Jürgen Plass, Alexander Schuster, Stephan Weigl (2023): Rote Liste der Säugetiere Oberösterreichs – Biologiezentrum Linz Sonderpublikationen – Saeugetiere_OOE: 195 - 215.
- Guido Reiter, Jürgen Plass (2023): Große Hufeisennase Rhinolophus ferrumequinum Schreber 1774 – Biologiezentrum Linz Sonderpublikationen – Saeugetiere_OOE: 306 - 307.
- Guido Reiter, Markus Milchram (2021): Neun Jahre akustisches Fledermausmonitoring im Nationalpark Thayatal – Möglichkeiten und Limits – Naturkundliche Mitteilungen aus den Landessammlungen Niederösterreich – 31: 212 - 220.
- Guido Reiter (2019): Fledermäuse: vom Regen in die Traufe? – ÖKO.L Zeitschrift für Ökologie, Natur- und Umweltschutz – 2019_03-04: 39 - 43.
- Guido Reiter (2018): Fledermäuse - die heimlichen Unbekannten – Natur und Land (vormals Blätter für Naturkunde und Naturschutz) – 2018_4: 27 - 31.
- Klaus Krainer, Harald Mixanig, Daniela Wieser, Guido Reiter (2017): Die Nutzung von GPS-Telemetrie zur Analyse der Lebensraumnutzung von Mausohren (Myotis myotis) in Kärnten – Carinthia II – 207_127: 565 - 576.
- Teresa Knoll, Konrad Fiedler, Guido Reiter (2016): Fledermausgemeinschaften und Rufaktivität im Wildnisgebiet Dürrenstein und in umliegenden Wirtschaftswäldern – Silva Fera – 5_2016: 23 - 34.
- Erich Weigand, Andreas Eckelt, Gregor Degasperi, Heinz Mitter, Werner Weißmair, Guido Reiter, Peter Huemer, Christian Fuxjäger, Herbert Kerschbaumsteiner (2016): Fauna – Besonderheiten des Schutzgebietes – Nationalpark Kalkalpen - Schriftenreihe – 16: 75 - 100.
- Isabel Schmotzer, Guido Reiter (2016): Quartiere für Fledermäuse (Merkblatt) – Gutachten Naturschutzabteilung Oberösterreich – 0829: 1 - 2.
- Oliver Gebhardt, Claudia Gebhardt, Andreas Kiefer, Gernot Kunz, Petra Schattanek, Guido Reiter (2016): Neue Nachweise der Nymphenfledermaus (Myotis alcathoe, Helversen et al. 2001) aus der Steiermark – Mitteilungen des naturwissenschaftlichen Vereins für Steiermark – 146: 69 - 75.
- Julia Kropfberger, Guido Reiter, Isabel Schmotzer (2015): Quartier- und Lebensraumnutzung der Bechsteinfledermaus im Naturpark Obst-Hügel-Land – ÖKO.L Zeitschrift für Ökologie, Natur- und Umweltschutz – 2015_03: 21 - 27.
- Guido Reiter, Hannes Seehofer (2015): Fledermaus-Ersatzquartiere; Neues Naturschutzgebiet Pielachmündung-Steinwand – Lanius – 23_03-04: 7.
- Guido Reiter, M. Plank, Ulrich F.H. Hüttmeir (2014): Fledermäuse in den Kernzonen und Wirtschaftwäldern des BiosphärenparksWienerwald – Wissenschaftliche Mitteilungen Niederösterreichisches Landesmuseum – 25: 503 - 522.
- Georg Amann, Hans Walser, Guido Reiter (2013): Die Fledermäuse in den Jagdberggemeinden – wie nutzen Fledermäuse die Kulturlandschaft? – Inatura Dornbirn - Naturmonografien – 2013: 307 - 330.
- Katharina Bürger, Oliver Gebhardt, Stephanie Wohlfahrt, Gudrun Wibbelt, Guido Reiter (2013): First confirmed records of Geomyces destructans (Blehert & Gargas 2009) in Austria – Berichte des naturwissenschaftlichen-medizinischen Verein Innsbruck – 98: 127 - 135.
- Michael Plank, Guido Reiter (2013): Use of the forest canopy by bats in temperate forests in the Thayatal National Park – Nationalpark Hohe Tauern - Conference Volume – 5: 585 - 586.
- Guido Reiter, Klaus Krainer (2013): Wandernde Fledermäuse am Gründen Band Kärntens – Natur und Land (vormals Blätter für Naturkunde und Naturschutz) – 2013_4: 37.
- Ulrich F.H. Hüttmeir, Guido Reiter (2011): Fledermausveranstaltungen in Wien - Lange Nacht der Stadtwerke – Tag der Artenvielfalt – Fledermausnacht Hirschstetten – Natur und Naturschutz - Studien der Wiener Umweltschutzabteilung (MA 22) – 114: 1 - 19.
- Ulrich F.H. Hüttmeir, Katharina Bürger, Stefan Wegleitner, Guido Reiter (2010): Ergänzende Erhebungen und Einschätzung des Erhaltungszustandes der Fledermäuse in Wien - Endbericht 2010 – Natur und Naturschutz - Studien der Wiener Umweltschutzabteilung (MA 22) – 71: 1 - 110.
- Guido Reiter, Stefan Wegleitner, Ulrich F.H. Hüttmeir, Martin Pollheimer (2010): Die Alpenfledermaus, Hypsugo savii (Bonaparte, 1837), in Mitteleuropa – Nyctalus – Internationale Fledermaus-Fachzeitschrift – NF_15: 158 - 170.
- Ulrich F.H. Hüttmeir, Antonin Reiter, Guido Reiter (2010): Fledermäuse in den Nationalparks Thayatal und Podyjí, sowie Erstnachweis der Nymphenfledermaus (Myotis alcathoe HELVERSEN & HELLER, 2001) in Niederösterreich. – Wissenschaftliche Mitteilungen Niederösterreichisches Landesmuseum – 21: 433 - 444.
- Guido Reiter, Julia Kropfberger, Simone Pysarczuk, Isabel Schmotzer (2009): Fledermäuse im Naturpark Obst-Hügel-Land. Endbericht. – Gutachten Naturschutzabteilung Oberösterreich – 0661: 1 - 51.
- Klaus Krainer, Ulrich F.H. Hüttmeir, Guido Reiter, Anna Karina Smole-Wiener, Maria Jerabek (2008): Emergence behaviour of lesser horseshoe bats (Rhinolophus hipposideros): Intracolony variation in time and space (Carinthia and Salzburg, Austria). – Berichte des naturwissenschaftlichen-medizinischen Verein Innsbruck – 95: 81 - 93.
- Simone Pysarczuk, Guido Reiter (2008): Artenschutzprojekt Fledermäuse Oberösterreich. Tätigkeitsbericht 2008. – Gutachten Naturschutzabteilung Oberösterreich – 0250: 1 - 51.
- Simone Pysarczuk, Guido Reiter (2007): Artenschutzprojekt Fledermäuse Oberösterreich. Tätigkeitsbericht 2007. – Gutachten Naturschutzabteilung Oberösterreich – 0251: 1 - 47.
- Guido Reiter, Hans Walser, Anton Vorauer (2006): Vorkommen, Populationsentwicklung, Gefährdung und Schutz der Kleinen Hufeisennase, Rhinolophus hipposideros (Chiroptera: Rhinolophidae) in Vorarlberg. – Vorarlberger Naturschau - Forschen und Entdecken – 19: 85 - 98.
- Simone Pysarczuk, Maria Jerabek, Guido Reiter (2006): Artenschutzprojekt Fledermäuse Oberösterreich. Tätigkeitsbericht 2006. – Gutachten Naturschutzabteilung Oberösterreich – 0186: 1 - 49.
- Guido Reiter, Simone Pysarczuk, Maria Jerabek (2005): Erste Nachweise der Mückenfledermaus, Pipistrellus pygmaeus (LEACH 1825) (Chiroptera, Vespertilionidae) in Oberösterreich – Beiträge zur Naturkunde Oberösterreichs – 0014: 349 - 355.
- Maria Jerabek, Ulrich F.H. Hüttmeir, Josef Kreuzberger, Anton Vorauer, Christoph Walder, Guido Reiter (2005): Building-dwelling bats in the Nationalpark Hohe Tauern (Carinthia, Salzburg, Tyrol) – Nationalpark Hohe Tauern - Conference Volume – 3: 79 - 82.
- Guido Reiter, Ulrich F.H. Hüttmeir, Maria Jerabek, Klaus Krainer, Simone Pysarczuk, Anton Vorauer (2005): Jahresbericht 2005 – Jahresberichte der Koordinationsstelle für Fledermausschutz und -forschung – 2005: 1 - 36.
- Guido Reiter (2004): Heimliche Nachtschwärmer- Fledermäuse in der Stadt Linz – ÖKO.L Zeitschrift für Ökologie, Natur- und Umweltschutz – 2004_3: 16 - 21.
- Guido Reiter, Maria Jerabek, Klaus Krainer, Simone Pysarczuk (2004): Jahresbericht 2004 – Jahresberichte der Koordinationsstelle für Fledermausschutz und -forschung – 2004: 1 - 36.
- Guido Reiter, Ulrich F.H. Hüttmeir, Maria Jerabek (2004): QUARTIEREIGENSCHAFTEN VON WOCHENSTUBENQUARTIEREN KLEINER HUFEISENNASEN (RHINOLOPHUS HIPPOSIDEROS) IN ÖSTERREICH. – Berichte der Naturwissenschaftlich-Medizinischen Vereinigung in Salzburg – 14: 143 - 159.
- Fledermäuse, die heimlichen Drautaler.Ulrich F.H. Hüttmeir, Guido Reiter (2004): Fledermäuse, die heimlichen Drautaler. – Carinthia II - Sonderhefte – 61: 105 - 107.
- Guido Reiter, Ulrich F.H. Hüttmeir, Maria Jerabek, Sonja Frischmann, Harald Mixanig, Bernardette Jobst, Carmen Hebein (2004): Der GroßeAbendsegler (Nyctalus noctula) in Kärnten – Carinthia II – 194_114: 349 - 357.
- Maria Jerabek, Guido Reiter (2003): Die Kleinsäugerfauna von Bergwäldern im Karwendel (Österreich): Verbreitung, Habitatwahl und Populationsentwicklung – Berichte des naturwissenschaftlichen-medizinischen Verein Innsbruck – 90: 231 - 259.
- Maria Jerabek, Guido Reiter (2003): Populationsbiologie der Rötelmaus Clethrionomys glareolus (Rodentia: Arvicolidae) im Karwendel (Tirol, Österreich) – Berichte des naturwissenschaftlichen-medizinischen Verein Innsbruck – 90: 261 - 276.
- Guido Reiter, Maria Jerabek, Ulrich F.H. Hüttmeir (2003): Fledermäuse in der Stadt Linz – Naturkundliches Jahrbuch der Stadt Linz (Linz) – 49: 11 - 59.
- Guido Reiter, Maria Jerabek (2003): Klein und dennoch von großer Bedeutung - Kleinsäuger in der Stadt Linz – ÖKO.L Zeitschrift für Ökologie, Natur- und Umweltschutz – 2003_3: 3 - 10.
- Guido Reiter, Ulrich F.H. Hüttmeir, Maria Jerabek, Klaus Krainer (2003): Jahresbericht 2003 – Jahresberichte der Koordinationsstelle für Fledermausschutz und -forschung – 2003: 1 - 34.
- Guido Reiter, Klaus Krainer (2003): Aus den Vereinen. – Kärntner Naturschutzberichte – 2003_8: 98 - 99.
- Maria Jerabek, Guido Reiter, Brigitte A. Reutter (2002): Die Kleinsäuger im Naturreservat Gadental, Großes Walsertal: Teil 2 - Waldmäuse (Muridae, Rodentia). – Vorarlberger Naturschau - Forschen und Entdecken – 11: 123 - 142.
- Guido Reiter, Maria Jerabek (2002): Kleinsäuger in der Stadt Linz – Naturkundliches Jahrbuch der Stadt Linz (Linz) – 48: 11 - 78.
- Maria Jerabek, Guido Reiter (2001): Die Kleinsäuger im Naturreservat Gadental, Großes Walsertal: Teil 1 - Spitzmäuse, Wühlmäuse und Schläfer (Insectivora, Rodentia). – Vorarlberger Naturschau - Forschen und Entdecken – 9: 135 - 170.
- Ulrich F.H. Hüttmeir, Maria Jerabek, Guido Reiter (2001): Fledermäuse in Salzburg: Kartierung-Monitoring-Schutz – Sauteria-Schriftenreihe f. systematische Botanik, Floristik u. Geobotanik – 11: 179 - 185.
- Maria Jerabek, Klaus Reiter, Guido Reiter (2000): Erster Fortpflanzungsnachweis der Fransenfledermaus, Myotis nattereri (Kuhl, 1818), in Tirol (Österreich). – Berichte des naturwissenschaftlichen-medizinischen Verein Innsbruck – 87: 327 - 330.
- Guido Reiter, Ulrich F.H. Hüttmeir, Maria Jerabek (2000): Kurzmitteilungen Fledermausschutz in Kärnten Zwei Jahre Fledermausquartier-Betreuernetz – Kärntner Naturschutzberichte – 2000_5: 86 - 89.
- Kleinsäuger am nördlichen DachsteinplateauMaria Jerabek, Guido Reiter, Miriam Türk (20##): Kleinsäuger am nördlichen Dachsteinplateau – Monografien Vertebrata Mammalia – 0102: 1 - 21.
- Guido Reiter (2000): Alte Bäume - Lebensräume für Säugetiere – Natur und Land (vormals Blätter für Naturkunde und Naturschutz) – 2000_1-2: 20 - 23.
- Ulrich F.H. Hüttmeir, Maria Jerabek, Guido Reiter (2000): Fledermäuse - bedrohte Jäger der Nacht – Natur und Land (vormals Blätter für Naturkunde und Naturschutz) – 2000_4-5: 24 - 26.
- Guido Reiter, Josef Kreuzberger (2000): Wasservögel an Teichen bei Siggerwiesen, Salzburg: Vorkommen, Brutnachweise, Saisonale Bestandsveränderungen und Habitatnutzung. – Salzburger Vogelkundliche Berichte – 9: 1 - 10.
- Ulrich F.H. Hüttmeir, Guido Reiter (1999): Vorkommen und Gefährdung gebäudebewohnender Fledermäuse (Chiroptera: Rhinolophidae, Vespertilionidae) im Salzburger Anteil des Nationalparks Hohe Tauern und in den Nationalparkgemeinden des Pinzgaues – Nationalpark Hohe Tauern - Wissenschaftliche Mitteilungen Nationalpark Hohe Tauern – 5: 161 - 184.
- Guido Reiter, Norbert Winding (1997): Verbreitung und Ökologie alpiner Kleinsäuger (Insectivora, Rodentia) an der Südseite der Hohen Tauern, Österreich – Nationalpark Hohe Tauern - Wissenschaftliche Mitteilungen Nationalpark Hohe Tauern – 3: 97 - 135.